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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6etl | ||||||
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タイトル | Atomic resolution structure of RNase A (data collection 2) | ||||||
![]() | Ribonuclease pancreatic | ||||||
![]() | HYDROLASE / Raman microspectroscopy / ribonuclease / atomic resolution / radiation damage / photodamage | ||||||
機能・相同性 | ![]() pancreatic ribonuclease / ribonuclease A activity / RNA nuclease activity / nucleic acid binding / lyase activity / defense response to Gram-positive bacterium / extracellular region 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() | ||||||
![]() | Caterino, M. / Vergara, A. / Merlino, A. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Raman-markers of X-ray radiation damage of proteins. 著者: Vergara, A. / Caterino, M. / Merlino, A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 92.4 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 76.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 13708.326 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) ![]() ![]() | ||
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#2: 化合物 | #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.04 Å3/Da / 溶媒含有率: 39.68 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: liquid diffusion / pH: 5.3 詳細: Free-interface diffusion of a 10 uL of 30 mg ml-1 protein solution, 20 mM sodium citrate at pH 5.3 agaist 10 ul isopropanol 99.9% isopropanol. |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2011年9月26日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.7749 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 0.85→50 Å / Num. obs: 95598 / % possible obs: 97.8 % / 冗長度: 3.3 % / Rmerge(I) obs: 0.047 / Net I/σ(I): 38.7 |
反射 シェル | 解像度: 0.85→0.88 Å / 冗長度: 3.2 % / Rmerge(I) obs: 0.353 / Mean I/σ(I) obs: 2.5 / % possible all: 95.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 解像度: 0.85→50 Å / 交差検証法: FREE R-VALUE
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 0.85→50 Å
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