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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 6erl | ||||||
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タイトル | Quadruplex with flipped tetrad formed by the c-myc promoter sequence | ||||||
![]() | cmbr-481317 | ||||||
![]() | DNA / Quadruplex / G4 / 8-Bromo-Guanosine / tetrad flip | ||||||
機能・相同性 | DNA / DNA (> 10)![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | 溶液NMR / DGSA-distance geometry simulated annealing / simulated annealing / molecular dynamics | ||||||
![]() | Karg, B. / Weisz, K. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Loop Length Affects Syn-Anti Conformational Rearrangements in Parallel G-Quadruplexes. 著者: Karg, B. / Weisz, K. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 144.8 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 119.3 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 395.5 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 465.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 12.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 15.2 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
類似構造データ | |
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その他のデータベース |
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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NMR アンサンブル |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 7324.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) ![]() |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: 溶液NMR | ||||||||||||||||||||||||
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NMR実験 |
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試料調製
詳細 |
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試料 |
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試料状態 | イオン強度: 10 mM / Label: 1 / pH: 7 pH* / 圧: 1 atm / 温度: 303 K |
-NMR測定
NMRスペクトロメーター | タイプ: Bruker AVANCE / 製造業者: Bruker / モデル: AVANCE / 磁場強度: 600 MHz |
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解析
NMR software |
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精密化 |
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代表構造 | 選択基準: lowest energy | ||||||||||||||||||
NMRアンサンブル | コンフォーマー選択の基準: structures with the lowest energy 計算したコンフォーマーの数: 10 / 登録したコンフォーマーの数: 10 |