- PDB-6ehf: OmpT (in-vitro folded), an outer membrane protein Vibrio cholerae... -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 6ehf
タイトル
OmpT (in-vitro folded), an outer membrane protein Vibrio cholerae (trimer form)
要素
OmpT protein
キーワード
MEMBRANE PROTEIN (膜タンパク質) / Outer membrane protein / Porin (ポリン (タンパク質)) / OmpF or OmpC ortholog / ion-transport / membrane beta barrel / ion-channel (イオンチャネル) / diffusion porin / diffusion channel / non-specific porin.
機能・相同性
Gram-negative porin / Porin domain, Gram-negative type / Porin domain superfamily / porin activity / cell outer membrane / metal ion binding / OmpT protein
解像度: 2.72→71.03 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.921 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.93 / SU B: 15.094 / SU ML: 0.281 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.369 / ESU R Free: 0.29 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.28059
956
5.1 %
RANDOM
Rwork
0.23798
-
-
-
obs
0.24015
17747
98.98 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK