登録情報 | データベース: PDB / ID: 6dxs |
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タイトル | Crystal structure of the LigJ hydratase E284Q mutant substrate complex with (3Z)-2-keto-4-carboxy-3-hexenedioate |
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要素 | 4-oxalomesaconate hydratase |
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キーワード | lyase/lyase inhibitor / Hydratase / amidohydrolase / LYASE / lyase-lyase inhibitor complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
付加脱離酵素(リアーゼ); 炭素-酸素リアーゼ類; デヒドラターゼ類 / lignin catabolic process / : / carboxy-lyase activity / hydrolase activity / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase / Amidohydrolase / Amidohydrolase-related / Metal-dependent hydrolase類似検索 - ドメイン・相同性 (2Z)-4-oxobut-2-ene-1,2,4-tricarboxylic acid / 2-keto-4-carboxy-3-hexenedioate hydratase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Sphingobium sp. SYK-6 (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.65 Å |
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データ登録者 | Mabanglo, M.F. / Raushel, F.M. / Hogancamp, T.N. |
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資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Robert A. Welch Foundation | A-840 | 米国 |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2018 タイトル: Structure and Reaction Mechanism of the LigJ Hydratase: An Enzyme Critical for the Bacterial Degradation of Lignin in the Protocatechuate 4,5-Cleavage Pathway. 著者: Hogancamp, T.N. / Mabanglo, M.F. / Raushel, F.M. |
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履歴 | 登録 | 2018年6月29日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2018年9月26日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2018年10月17日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation_author.identifier_ORCID |
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改定 1.2 | 2023年10月11日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id |
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