PDB-6c29: Crystal structure of the N-terminal periplasmic domain of ScsB fr...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 6c29

タイトル

Crystal structure of the N-terminal periplasmic domain of ScsB from Proteus mirabilis

要素

Putative metal resistance protein

キーワード

OXIDOREDUCTASE / redox enzyme / immunoglobulin fold / cysteine active site

機能・相同性

機能・相同性情報

cytochrome complex assembly / protein-disulfide reductase activity / cell redox homeostasis / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Proteus mirabilis (バクテリア)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.538 Å

データ登録者

Furlong, E.J. / Choudhury, H.G. / Kurth, F. / Martin, J.L.

資金援助

オーストラリア, 2件

引用

ジャーナル: J Biol Chem / 年: 2018
タイトル: Disulfide isomerase activity of the dynamic, trimeric ScsC protein is primed by the tandem immunoglobulin-fold domain of ScsB.
著者: Emily J Furlong / Hassanul G Choudhury / Fabian Kurth / Anthony P Duff / Andrew E Whitten / Jennifer L Martin /

要旨: Correct disulfide bond formation is essential for proper folding of many proteins, including bacterial virulence factors. The suppressor of copper sensitivity (Scs) proteins have roles in ...

履歴

登録	2018年1月7日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2018年3月7日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2018年3月14日	Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_PubMed ..._citation.journal_abbrev / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation_author.name
改定 1.2	2018年5月2日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first ..._citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.title
改定 1.3	2020年1月1日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2024年11月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Refinement description / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	6c29.cif.gz	435.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb6c29.ent.gz	366.8 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	6c29.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	6c29_validation.pdf.gz	434.7 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	6c29_full_validation.pdf.gz	438.6 KB	表示
XML形式データ	6c29_validation.xml.gz	33.9 KB	表示
CIF形式データ	6c29_validation.cif.gz	50.9 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/6c29 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c2/6c29	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	SASDC48C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2x8a-d 3qxu-2 3qxu-4 1dwu-1 4kml-d 4dd1-d 2vzp-d 4n9o-d 4ddc-d 1wsc-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	SASBDB: SASDC48associated SAS data, PmScsC-PmScsBalpha complex

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#233 - 2019年5月 S-ニトロシル化ヘモグロビン (S-Nitrosylated Hemoglobin) 類似性 (2) #91 - 2007年7月チミン２量体 (Thymine Dimers) 類似性 (2)

登録構造単位

A: Putative metal resistance protein

B: Putative metal resistance protein

C: Putative metal resistance protein

84.2 kDa, 3 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Putative metal resistance protein

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
根拠: gel filtration
28.1 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

B: Putative metal resistance protein

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
28.1 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

3

C: Putative metal resistance protein

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
28.1 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	69.977, 97.061, 110.196
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	chain A
2	1	chain B
3	1	chain C

NCSドメイン領域:

Component-ID: 1 / Ens-ID: 1 / Beg auth comp-ID: SER / Beg label comp-ID: SER / End auth comp-ID: GLY / End label comp-ID: GLY / Auth seq-ID: 1 - 247 / Label seq-ID: 1 - 247

Dom-ID	Selection details	Auth asym-ID	Label asym-ID
1	chain A	A	A
2	chain B	B	B
3	chain C	C	C

#1: タンパク質	Putative metal resistance protein 分子量: 28083.121 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Proteus mirabilis (strain HI4320) (バクテリア) 株: HI4320 / 遺伝子: PMI0439 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21 (DE3) pLysS / 参照: UniProt: B4EV20
#2: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 669 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.3 Å³/Da / 溶媒含有率: 46 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.1 M MES monohydrate pH 6, 6% v/v tacsimate pH 6, 24% PEG4000, 4% 1,3-butanediol

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Australian Synchrotron / ビームライン: MX2 / 波長: 0.9786 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2015年7月10日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9786 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.538→97.061 Å / Num. obs: 111511 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 15.8 % / B_iso Wilson estimate: 15.96 Å² / CC_1/2: 0.998 / R_merge(I) obs: 0.146 / R_pim(I) all: 0.038 / R_rim(I) all: 0.15 / Net I/σ(I): 16
反射シェル	解像度: 1.538→1.544 Å / 冗長度: 16.3 % / R_merge(I) obs: 2.114 / Num. unique obs: 1094 / CC_1/2: 0.653 / R_pim(I) all: 0.531 / R_rim(I) all: 2.18 / % possible all: 98.3

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
Blu-Ice		データ収集
XDS		データ削減
Aimless	0.5.8	データスケーリング
PHASER	2.5.7	位相決定
BUCCANEER	1.5	モデル構築
Coot	0.8.1	モデル構築
PDB_EXTRACT	3.24	データ抽出

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 1.538→55.098 Å / SU ML: 0.14 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 18.95
詳細: The structure was solved initially by using SAD with SHELX in hkl2map to get a partial alanine model of the protein. This model was then used for MR in Phaser

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1978	5541	4.97 %
R_work	0.1726	-	-
obs	0.1738	111388	99.64 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 147.77 Å² / B_iso mean: 27.6084 Å² / B_iso min: 8.36 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 1.538→55.098 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5694	0	0	669	6363
B_iso mean	-	-	-	31.78	-
残基数	-	-	-	-	741

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.011	6045
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.332	8351
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.058	944
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1098
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.191	2183

Refine LS restraints NCS

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Refine-ID	Rms	タイプ
1	1	A	3908	X-RAY DIFFRACTION	11.212	TORSIONAL
1	2	B	3908	X-RAY DIFFRACTION	11.212	TORSIONAL
1	3	C	3908	X-RAY DIFFRACTION	11.212	TORSIONAL

LS精密化シェル

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / R_factor R_free error: 0 / Total num. of bins used: 30

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Num. reflection all	% reflection obs (%)
1.5384-1.5559	0.2926	215	0.249	3470	3685	99
1.5559-1.5742	0.2509	190	0.2364	3458	3648	99
1.5742-1.5934	0.2742	177	0.2269	3489	3666	99
1.5934-1.6136	0.2594	186	0.2196	3474	3660	100
1.6136-1.6348	0.2454	181	0.2212	3470	3651	99
1.6348-1.6572	0.2263	160	0.2057	3491	3651	99
1.6572-1.6809	0.2158	185	0.2008	3502	3687	99
1.6809-1.706	0.2144	182	0.1938	3503	3685	99
1.706-1.7326	0.2674	155	0.2021	3514	3669	100
1.7326-1.761	0.2382	172	0.1932	3496	3668	100
1.761-1.7914	0.2078	182	0.186	3524	3706	100
1.7914-1.824	0.1949	176	0.1895	3475	3651	100
1.824-1.8591	0.2432	178	0.1828	3518	3696	100
1.8591-1.897	0.1991	196	0.1905	3543	3739	100
1.897-1.9383	0.2551	177	0.2304	3459	3636	99
1.9383-1.9833	0.2137	171	0.1741	3541	3712	100
1.9833-2.0329	0.2039	189	0.1656	3505	3694	100
2.0329-2.0879	0.1893	184	0.177	3519	3703	100
2.0879-2.1494	0.2101	188	0.1682	3528	3716	100
2.1494-2.2187	0.2171	207	0.1672	3515	3722	100
2.2187-2.298	0.2142	203	0.1885	3520	3723	100
2.298-2.39	0.1829	183	0.164	3541	3724	100
2.39-2.4988	0.217	177	0.1707	3555	3732	100
2.4988-2.6306	0.1988	172	0.1713	3566	3738	100
2.6306-2.7954	0.202	189	0.1768	3578	3767	100
2.7954-3.0112	0.1874	205	0.17	3543	3748	100
3.0112-3.3142	0.1808	174	0.1639	3595	3769	100
3.3142-3.7936	0.177	206	0.1516	3593	3799	100
3.7936-4.7792	0.1671	186	0.1359	3646	3832	100
4.7792-55.1333	0.1642	195	0.1663	3716	3911	98

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.7257	-0.1068	0.2412	0.2458	-0.0957	0.4857	0.0383	-0.1236	0.0445	0.1989	-0.0679	0.0085	-0.0154	0.0513	-0.005	0.1458	0.0211	-0.0321	0.1305	0.0285	0.1118	18.9058	27.5779	-21.1611
2	0.479	0.3002	0.3207	0.1973	0.1926	0.8862	-0.0261	0.0624	-0.0006	-0.059	0.0151	0.0269	0.0357	0.1393	-0.0204	0.1004	0.0309	-0.0117	0.1256	0.0135	0.1143	18.9522	28.9265	-33.052
3	0.5054	0.4983	-0.1093	0.9835	0.1051	0.5406	-0.3529	0.3066	0.1166	-0.8374	0.4356	0.4162	0.2704	0.4446	0.0655	-0.0222	0.1978	0.2254	0.25	-0.1223	-0.155	23.3515	22.0495	-36.5323
4	0.509	0.2097	-0.1307	0.1271	-0.0156	0.4876	-0.0055	-0.0618	0.1424	-0.0713	0.0567	0.0989	-0.0903	0.052	0.0059	0.1142	0.0265	-0.0123	0.1082	0.0049	0.1182	13.1856	33.1562	-36.8198
5	0.6219	0.123	-0.0167	0.128	0.169	0.4295	0.0282	-0.0119	-0.0776	0.0449	-0.0471	0.0924	0.0335	0.1922	-0.0174	0.12	0.0357	-0.0244	0.153	0.0233	0.1649	24.945	28.6272	-27.6349
6	0.6695	0.063	-0.0037	0.4167	0.0614	0.0704	-0.023	-0.1907	-0.2168	0.0184	-0.0049	-0.0187	-0.0089	-0.07	-0.0518	0.1085	0.0335	0.0189	0.1507	0.058	0.1466	11.818	16.8426	-32.1219
7	0.2437	-0.1895	0.094	0.103	0.0044	0.1605	0.0812	0.0393	0.0228	-0.4221	-0.1137	0.0292	0.0475	0.1903	0.0002	0.2396	0.0481	0.0295	0.178	-0.0033	0.1643	10.7635	32.3161	-61.3192
8	0.4057	-0.4727	-0.0367	0.6455	-0.3164	0.6471	0.052	-0.0069	0.0223	-0.1562	-0.0713	-0.0144	-0.0006	0.0836	0.0027	0.1142	0.0162	-0.0038	0.1151	-0.0109	0.1152	7.4577	33.9056	-53.9059
9	-0.0103	-0.0456	0.0591	0.2106	-0.3495	0.6228	0.0873	0.2001	0.5554	-0.3053	-0.4169	-0.4209	0.1843	0.5434	-0.0656	0.1087	-0.0944	0.0539	0.2544	0.0652	0.4756	24.1928	41.4761	-56.9161
10	0.2252	-0.2642	0.1137	0.2505	-0.0105	0.1941	0.086	0.0754	0.0151	-0.1383	-0.007	-0.002	0.0255	0.0803	0.0472	0.102	0.0389	0.0165	0.1308	0.0035	0.1007	11.1382	26.2494	-52.7609
11	0.8832	0.0535	-0.2872	0.602	-0.0401	0.4774	0.0096	0.082	0.0963	-0.0466	-0.0543	-0.0668	-0.0788	0.0817	-0.0134	0.1148	-0.0089	-0.0154	0.1008	0.0281	0.1164	-3.7091	27.1919	-28.5442
12	0.4935	0.5822	0.106	0.4681	0.1548	0.6849	0.126	-0.0965	-0.0566	0.2489	-0.1073	0.0508	-0.0427	-0.0914	0.0145	0.1547	-0.0237	0.0009	0.1261	0.0081	0.1248	-12.9432	21.6454	-20.8047
13	0.844	0.5489	-0.2868	0.8023	-0.4157	0.2587	-0.1149	0.1222	0.0427	-0.0429	0.0748	-0.0055	-0.1582	0.0086	-0.1303	0.1591	-0.0072	-0.017	0.1116	0.0119	0.088	-10.1848	28.0673	-29.6377
14	0.8256	-0.1643	0.2333	1.5694	-0.4112	0.4141	0.0562	-0.1358	0.0013	0.1473	-0.0125	0.161	-0.0504	-0.1199	0.0292	0.1119	0.0029	0.0165	0.146	-0.0313	0.1304	-26.9793	8.0757	-18.5285
15	0.6911	0.3884	-0.0457	1.671	0.0113	0.5546	0.0141	0.0195	0.0211	-0.0741	0.066	-0.0759	-0.0302	0.0281	0.1287	0.1015	-0.0107	0.0251	0.1025	-0.0107	0.1133	-17.4806	54.394	-2.8791
16	0.4255	0.1662	0.4102	0.5303	0.469	0.5648	-0.0344	-0.0149	-0.0516	-0.0989	0.0639	0.0963	-0.0745	0.0066	0.0119	0.1421	-0.0224	-0.0057	0.1051	-0.0127	0.1259	-24.2325	47.3823	-3.6126
17	0.4393	0.5963	0.0259	0.9368	-0.3795	0.617	-0.0089	0.0376	-0.0493	-0.0947	-0.0114	-0.1721	-0.0282	0.1367	0.0005	0.1082	-0.0067	0.032	0.147	-0.0078	0.1368	-14.2828	50.5504	-5.286
18	1.2678	0.2443	-0.4137	0.9173	-0.1236	0.6292	-0.0755	0.1054	-0.0096	-0.1159	0.0886	0.1284	0.0523	-0.0591	-0.0145	0.1599	-0.0147	-0.0291	0.1209	0.0087	0.0954	-35.1748	31.8513	-2.3665

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 24 )	A	1 - 24
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 25 through 60 )	A	25 - 60
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 61 through 74 )	A	61 - 74
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 75 through 97 )	A	75 - 97
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 98 through 128 )	A	98 - 128
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 129 through 154 )	A	129 - 154
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 155 through 173 )	A	155 - 173
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 174 through 210 )	A	174 - 210
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'A' and (resid 211 through 225 )	A	211 - 225
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'A' and (resid 226 through 247 )	A	226 - 247
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 1 through 45 )	B	1 - 45
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 46 through 89 )	B	46 - 89
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 90 through 154 )	B	90 - 154
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 155 through 247 )	B	155 - 247
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 1 through 60 )	C	1 - 60
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 61 through 89 )	C	61 - 89
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 90 through 154 )	C	90 - 154
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 155 through 247 )	C	155 - 247

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)