登録情報 | データベース: PDB / ID: 5z48 |
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タイトル | Crystal structure of pyrrolidone carboxylate peptidase I from Deinococcus radiodurans R1 bound to pyroglutamate |
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要素 | Pyrrolidone-carboxylate peptidase |
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キーワード | HYDROLASE / omega peptidase / pyroglutamate / exopeptidase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
pyroglutamyl-peptidase I / pyroglutamyl-peptidase activity / proteolysis / cytosol類似検索 - 分子機能 Pyroglutamyl peptidase I, bacterial-type / Pyroglutamyl peptidase I, Glu active site / Pyrrolidone-carboxylate peptidase glutamic acid active site. / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like / Pyroglutamyl peptidase I, Cys active site / Pyrrolidone-carboxylate peptidase cysteine active site. / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like superfamily / Pyroglutamyl peptidase ...Pyroglutamyl peptidase I, bacterial-type / Pyroglutamyl peptidase I, Glu active site / Pyrrolidone-carboxylate peptidase glutamic acid active site. / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like / Pyroglutamyl peptidase I, Cys active site / Pyrrolidone-carboxylate peptidase cysteine active site. / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like / Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like superfamily / Pyroglutamyl peptidase / Aminopeptidase / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PYROGLUTAMIC ACID / Pyrrolidone-carboxylate peptidase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Deinococcus radiodurans R1 (放射線耐性) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.551 Å |
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データ登録者 | Agrawal, R. / Kumar, A. / Kumar, A. / Makde, R.D. |
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引用 | ジャーナル: Acta Crystallogr D Struct Biol / 年: 2019 タイトル: Crystal structures of pyrrolidone-carboxylate peptidase I from Deinococcus radiodurans reveal the mechanism of L-pyroglutamate recognition. 著者: Agrawal, R. / Singh, R. / Kumar, A. / Kumar, A. / Makde, R.D. |
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履歴 | 登録 | 2018年1月10日 | 登録サイト: PDBJ / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2019年1月16日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2019年4月17日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: citation / citation_author Item: _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD ..._citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year |
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改定 1.2 | 2023年11月22日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id |
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