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Yorodumi- PDB-5yb0: Crystal Structure of Wild Type Phosphoserine aminotransferase (PS... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 5yb0 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal Structure of Wild Type Phosphoserine aminotransferase (PSAT) from E. histolytica | ||||||
Components | Phosphoserine aminotransferase | ||||||
Keywords | TRANSFERASE / PHOSPHOSERINE AMINOTRANSFERASE | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationphosphoserine transaminase / O-phospho-L-serine:2-oxoglutarate aminotransferase activity / L-serine biosynthetic process / pyridoxal phosphate binding / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | ![]() | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.94 Å | ||||||
Authors | Singh, R.K. / Gourinath, S. | ||||||
Citation | Journal: Int.J.Biol.Macromol. / Year: 2019Title: N-terminal residues are crucial for quaternary structure and active site conformation for the phosphoserine aminotransferase from enteric human parasite E. histolytica. Authors: Singh, R.K. / Tomar, P. / Dharavath, S. / Kumar, S. / Gourinath, S. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 5yb0.cif.gz | 1.4 MB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb5yb0.ent.gz | 1.1 MB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 5yb0.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 5yb0_validation.pdf.gz | 546.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 5yb0_full_validation.pdf.gz | 617.9 KB | Display | |
| Data in XML | 5yb0_validation.xml.gz | 149.2 KB | Display | |
| Data in CIF | 5yb0_validation.cif.gz | 192.3 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yb/5yb0 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/yb/5yb0 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 5yd2C ![]() 5yiiC ![]() 1bt4S S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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Movie
Controller
Components
About Yorodumi




X-RAY DIFFRACTION
Citation












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