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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5vj4 | ||||||
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タイトル | Crystal structure of a putative surface protein encoded by BTA121 | ||||||
![]() | Uncharacterized protein | ||||||
![]() | LIPID BINDING PROTEIN / Relapsing fever | ||||||
機能・相同性 | Uncharacterized protein![]() | ||||||
生物種 | ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Luo, Z. / Asojo, O. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structure of Borrelia turicatae protein, BTA121, a differentially regulated gene in the tick-mammalian transmission cycle of relapsing fever spirochetes. 著者: Luo, Z. / Kelleher, A.J. / Darwiche, R. / Hudspeth, E.M. / Shittu, O.K. / Krishnavajhala, A. / Schneiter, R. / Lopez, J.E. / Asojo, O.A. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 120.6 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 97.7 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 453.6 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 459.1 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 20.8 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 28.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 40695.973 Da / 分子数: 2 / 断片: residues 71-445 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() #2: 化合物 | ChemComp-SO4 / #3: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 3.4 Å3/Da / 溶媒含有率: 63.85 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / 詳細: 1.8M lithium sulfate, 50mM sodium HEPES pH 7.5 |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: RAYONIX MX-225 / 検出器: CCD / 日付: 2017年2月17日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.8→50 Å / Num. obs: 26628 / % possible obs: 100 % / 冗長度: 5.7 % / Rmerge(I) obs: 0.081 / Net I/σ(I): 20.3 |
反射 シェル | 解像度: 2.8→2.9 Å / 冗長度: 5.7 % / Rmerge(I) obs: 1.16 / Mean I/σ(I) obs: 1.7 / Num. unique obs: 2665 / CC1/2: 0.738 / Rpim(I) all: 0.037 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 82.974 Å2
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精密化ステップ | サイクル: 1 / 解像度: 2.8→39.8 Å
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拘束条件 |
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