PDB-5ual: Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ual

タイトル

Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant

要素

(DNA-directed RNA polymerase subunit ...) x 4
RNA polymerase sigma factor RpoD

キーワード

transferase/transferase inhibitor / inhibitor / antibiotic / tuberculosis / rifampin / rifamycin / RNA polymerase / RpoB S531L / transferase-transferase inhibitor complex

機能・相同性

機能・相同性情報

sigma factor antagonist complex / RNA polymerase complex / submerged biofilm formation / cellular response to cell envelope stress / regulation of DNA-templated transcription initiation / sigma factor activity / bacterial-type flagellum assembly / bacterial-type RNA polymerase core enzyme binding / cytosolic DNA-directed RNA polymerase complex / bacterial-type flagellum-dependent cell motility ...
類似検索 - 分子機能

RNA Polymerase Primary Sigma Factor / RNA Polymerase Primary Sigma Factor / RNA polymerase sigma factor 70, non-essential domain / Sigma-70, non-essential region / RNA polymerase sigma factor 70, region 1.1 / Sigma-70 factor, region 1.1 superfamily / Sigma-70 factor, region 1.1 / RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain / RNA polymerase subunit, RPB6/omega / Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit ...RNA Polymerase Primary Sigma Factor / RNA Polymerase Primary Sigma Factor / RNA polymerase sigma factor 70, non-essential domain / Sigma-70, non-essential region / RNA polymerase sigma factor 70, region 1.1 / Sigma-70 factor, region 1.1 superfamily / Sigma-70 factor, region 1.1 / RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain / RNA polymerase subunit, RPB6/omega / Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit / RNA polymerase Rpb1 funnel domain / RNA polymerase, RBP11-like subunit / Sigma-70 factors family signature 1. / RNA polymerase sigma factor RpoD, C-terminal / RNA polymerase sigma factor RpoD / Topoisomerase I; Chain A, domain 4 / DNA-directed RNA polymerase, insert domain / : / RNA polymerase sigma-70 region 1.2 / Sigma-70 factor, region 1.2 / RNA polymerase sigma-70 region 3 / Sigma-70 region 3 / Sigma-70 factors family signature 2. / RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2 / RNA polymerase sigma-70 / RNA polymerase sigma-70 region 4 / Sigma-70, region 4 / RNA polymerase sigma-70 region 2 / RNA polymerase sigma-70 like domain / Sigma-70 region 2 / RNA polymerase sigma factor, region 2 / RNA polymerase sigma factor, region 3/4-like / Gyrase A; domain 2 / DNA-directed RNA polymerase, omega subunit / DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime, bacterial type / DNA-directed RNA polymerase, beta subunit, external 1 domain superfamily / DNA-directed RNA polymerase, beta subunit, external 1 domain / RNA polymerase beta subunit external 1 domain / RNA polymerase, alpha subunit, C-terminal / Bacterial RNA polymerase, alpha chain C terminal domain / DNA-directed RNA polymerase, alpha subunit / DNA-directed RNA polymerase beta subunit, bacterial-type / Beta Complex / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain / DNA-directed RNA polymerase, subunit beta-prime / RNA polymerase Rpb6 / RNA polymerase, subunit omega/Rpo6/RPB6 / RNA polymerase Rpb6 / RNA polymerase Rpb2, domain 2 superfamily / RNA polymerase Rpb1, domain 3 superfamily / RPB6/omega subunit-like superfamily / DNA-directed RNA polymerase, insert domain / DNA-directed RNA polymerase, RpoA/D/Rpb3-type / RNA polymerase Rpb3/RpoA insert domain / RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain / RNA polymerases D / RNA polymerase Rpb1, clamp domain superfamily / RNA polymerase Rpb1, domain 3 / RNA polymerase Rpb1, domain 3 / RNA polymerase Rpb1, domain 1 / RNA polymerase, beta subunit, protrusion / RNA polymerase beta subunit / RNA polymerase Rpb1, domain 1 / RNA polymerase, alpha subunit / RNA polymerase Rpb1, domain 5 / RNA polymerase Rpb1, domain 4 / DNA-directed RNA polymerase, insert domain superfamily / RNA polymerase Rpb1, domain 2 / RNA polymerase Rpb1, domain 5 / RNA polymerase Rpb1, domain 4 / RNA polymerase Rpb2, domain 2 / RNA polymerase Rpb2, domain 2 / RNA polymerase, RBP11-like subunit / RNA polymerase, N-terminal / RNA polymerase Rpb1, funnel domain superfamily / RNA polymerase I subunit A N-terminus / RNA polymerase, beta subunit, conserved site / RNA polymerase Rpb2, domain 7 / RNA polymerase Rpb2, domain 3 / RNA polymerase Rpb2, OB-fold / RNA polymerase Rpb2, domain 7 / RNA polymerase Rpb2, domain 3 / RNA polymerases beta chain signature. / DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, hybrid-binding domain / DNA-directed RNA polymerase, subunit 2 / DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, hybrid-binding domain superfamily / RNA polymerase Rpb2, domain 6 / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Arc Repressor Mutant, subunit A / Winged helix-like DNA-binding domain superfamily / Alpha-Beta Complex / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Escherichia coli (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 3.887 Å

データ登録者

Molodtsov, V. / Scharf, N.T. / Stefan, M.A. / Garcia, G.A. / Murakami, K.S.

資金援助

米国, 2件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)	R01GM087350	米国
National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)	R01AI110780	米国

引用

ジャーナル: Mol. Microbiol. / 年: 2017
タイトル: Structural basis for rifamycin resistance of bacterial RNA polymerase by the three most clinically important RpoB mutations found in Mycobacterium tuberculosis.
著者: Molodtsov, V. / Scharf, N.T. / Stefan, M.A. / Garcia, G.A. / Murakami, K.S.

履歴

登録	2016年12月19日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年1月11日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年3月22日	Group: Database references
改定 1.2	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.4	2024年3月6日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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関連構造データ

関連構造データ	5uacC 5uagC 5uahC 5uajC 5uaqC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	5uah-1 4zh2-1 4ljz-1 4kmu-1 4kn7-1 5uaq-1 4kn4-1 6cux-1 5uag-1 4jk2-1 4llg-1 5uaj-1 4yg2-1 4zh4-1 4yfk-1 4lk1-1 6n62-d 4xsx-2 4xsz-1 4xsy-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#253 - 2021年1月エクスプレソーム (Expressome) 類似性 (13) #48 - 2003年12月異化活性化タンパク質 (Catabolite Activator Protein) 類似性 (27) #40 - 2003年4月 RNAポリメラーゼ (RNA Polymerase) 類似性 (1)

登録構造単位

A: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

B: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

C: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

D: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'

E: DNA-directed RNA polymerase subunit omega

F: RNA polymerase sigma factor RpoD

G: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

H: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

I: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

J: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'

K: DNA-directed RNA polymerase subunit omega

L: RNA polymerase sigma factor RpoD

ヘテロ分子

921 kDa, 12 ポリマー
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1

A: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

B: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

C: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

D: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'

E: DNA-directed RNA polymerase subunit omega

F: RNA polymerase sigma factor RpoD

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
461 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

2

G: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

H: DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

I: DNA-directed RNA polymerase subunit beta

J: DNA-directed RNA polymerase subunit beta'

K: DNA-directed RNA polymerase subunit omega

L: RNA polymerase sigma factor RpoD

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
460 kDa, 6 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	187.372, 205.950, 309.692
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
DNA-directed RNA polymerase subunit ... , 4種, 10分子 ABGHCIDJEK

#1: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha / RNAP subunit alpha / RNA polymerase subunit alpha / Transcriptase subunit alpha 分子量: 36558.680 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) 株: K12 / 遺伝子: rpoA, pez, phs, sez, b3295, JW3257 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A7Z4, DNA-directed RNA polymerase
#2: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit beta / RNAP subunit beta / RNA polymerase subunit beta / Transcriptase subunit beta 分子量: 150846.953 Da / 分子数: 2 / Mutation: S531L / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) 株: K12 遺伝子: rpoB, groN, nitB, rif, ron, stl, stv, tabD, b3987, JW3950 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A8V2, DNA-directed RNA polymerase
#3: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit beta' / RNAP subunit beta' / RNA polymerase subunit beta' / Transcriptase subunit beta' 分子量: 155366.781 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) 株: K12 / 遺伝子: rpoC, tabB, b3988, JW3951 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A8T7, DNA-directed RNA polymerase
#4: タンパク質	DNA-directed RNA polymerase subunit omega / RNAP omega subunit / RNA polymerase omega subunit / Transcriptase subunit omega 分子量: 10249.547 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) 株: K12 / 遺伝子: rpoZ, b3649, JW3624 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A800, DNA-directed RNA polymerase

-
タンパク質 , 1種, 2分子 FL

#5: タンパク質	RNA polymerase sigma factor RpoD / Sigma-70 分子量: 70352.242 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Escherichia coli (strain K12) (大腸菌) 株: K12 / 遺伝子: rpoD, alt, b3067, JW3039 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P00579

-
非ポリマー , 3種, 7分子

#6: 化合物	ChemComp-RFP / RIFAMPICIN 分子量: 822.940 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₄₃H₅₈N₄O₁₂ / コメント: 抗生剤*YM
#7: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#8: 化合物	ChemComp-ZN / ZINC ION 分子量: 65.409 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Zn

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 3.25 Å³/Da / 溶媒含有率: 62.13 %
結晶化	温度: 300 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: CHESS / ビームライン: A1 / 波長: 0.9769 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 270 / 検出器: CCD / 日付: 2013年3月21日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9769 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 3.8→50 Å / Num. obs: 92344 / % possible obs: 86.9 % / 冗長度: 4.4 % / Net I/σ(I): 9.1
反射シェル	解像度: 3.8→3.87 Å / CC_1/2: 0.604

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10.1_2155: ???)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

解像度: 3.887→29.941 Å / SU ML: 0.56 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.33 / 位相誤差: 34.53

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2861	1979	2.16 %
R_work	0.2297	-	-
obs	0.231	91437	82.87 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 3.887→29.941 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	54833	0	65	0	54898

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	55695
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.001	75174
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	16.544	34459
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.054	8565
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	9846

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
3.8872-3.9842	0.3987	72	0.3123	3231	X-RAY DIFFRACTION	42
3.9842-4.0916	0.3705	126	0.3366	5809	X-RAY DIFFRACTION	76
4.0916-4.2117	0.3387	134	0.3177	6119	X-RAY DIFFRACTION	80
4.2117-4.3473	0.3465	136	0.3124	6162	X-RAY DIFFRACTION	81
4.3473-4.5022	0.3633	139	0.2934	6293	X-RAY DIFFRACTION	82
4.5022-4.6818	0.3384	146	0.2786	6544	X-RAY DIFFRACTION	85
4.6818-4.894	0.3434	146	0.2536	6667	X-RAY DIFFRACTION	87
4.894-5.1508	0.3317	153	0.2545	6853	X-RAY DIFFRACTION	89
5.1508-5.4717	0.2997	153	0.2473	6934	X-RAY DIFFRACTION	90
5.4717-5.8912	0.2974	155	0.244	6966	X-RAY DIFFRACTION	91
5.8912-6.4786	0.3273	155	0.244	7011	X-RAY DIFFRACTION	90
6.4786-7.4037	0.3358	155	0.2319	6958	X-RAY DIFFRACTION	90
7.4037-9.2815	0.2429	154	0.1959	6992	X-RAY DIFFRACTION	89
9.2815-29.9415	0.2239	155	0.1797	6919	X-RAY DIFFRACTION	86

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.8553	0.5905	0.071	1.581	0.1677	2.1646	0.2715	-0.6019	-0.0154	0.6138	-0.1143	0.3223	0.2559	-0.3153	-0.0001	1.8365	0.0901	-0.0021	1.8474	0.0511	1.605	-100.9806	-33.5068	39.1023
2	0.6135	0.2679	-0.4991	0.1159	-0.1139	0.2421	-0.2524	-0.5512	-0.401	-1.1061	0.7978	-1.4828	-0.5337	0.726	-0.0003	2.0845	0.2017	0.0779	1.809	0.1738	1.7338	-93.8398	-35.5663	29.1581
3	0.2267	-0.0636	0.3379	-0.0688	-0.286	0.7769	-0.1	0.1072	-0.1967	1.309	0.4264	-0.02	0.09	-0.5496	-0.0002	2.6529	-0.2765	0.0459	2.0506	-0.063	1.6917	-88.1259	-13.0745	45.9771
4	0.8579	-0.3025	-0.1578	0.8995	-0.8528	0.7366	-0.4899	0.1864	-0.7662	-1.4021	-0.0506	0.4932	-1.0171	0.3173	0	2.0012	-0.3946	-0.0182	1.9681	0.074	1.5415	-74.7736	-13.0591	30.0756
5	0.6813	-0.2059	-0.2587	0.063	0.06	0.0509	0.5041	0.1018	-0.6193	1.1935	-0.3464	-0.5139	-1.6834	-0.0991	0.0005	3.3565	-0.1515	-0.0528	2.4756	-0.2953	2.0547	-73.807	21.4719	40.3777
6	1.1241	-0.3587	-0.3909	0.1185	0.1295	0.1384	-0.3571	2.4776	-1.9606	-0.6458	-0.3199	0.0115	0.2478	-1.3556	-0.0504	3.5274	-0.8658	-0.7574	2.4544	0.0103	1.7337	-70.6799	27.3753	29.981
7	0.9012	-0.3809	0.1756	0.4482	0.2464	0.3314	-0.2888	-0.8367	0.4055	-0.3834	-0.499	-0.6387	-1.7649	2.2431	-0.0349	4.2402	-0.9801	-0.3758	2.6294	-0.4506	1.8887	-62.5028	17.178	42.8133
8	0.2458	-0.2017	-0.1806	0.2566	0.2003	0.1649	-1.0491	-2.5736	0.6192	-0.2525	-0.5155	1.4618	0.0648	-0.4252	-0.0342	2.2322	-0.1418	-0.0516	2.4179	-0.636	3.4771	-57.7498	17.9979	37.0434
9	0.1985	0.0989	0.1465	0.0656	0.021	0.2475	-0.7261	0.3071	-0.2558	1.2288	0.077	0.0783	0.2258	1.7217	0.0031	3.0534	-0.7571	0.1786	2.0337	-0.4208	1.9315	-61.2039	26.7488	27.9225
10	0.1664	-0.2259	-0.2334	0.2473	0.2444	0.2203	-1.9457	-0.8213	0.9179	0.7423	0.908	-0.1582	1.4844	0.008	-0.0014	4.8907	-0.4958	-0.4413	3.0144	0.1891	2.0726	-64.1395	27.8851	40.0756
11	0.4007	0.2331	-0.5056	0.3245	-0.5374	0.8696	-0.4101	0.8817	0.1967	-0.3212	-0.4667	0.9942	-1.4073	1.2371	0	2.3148	-0.3835	-0.4143	1.9549	-0.0196	1.7363	-77.2007	5.9798	35.535
12	1.532	-1.2953	1.1069	1.1632	-1.1737	1.0088	0.2665	0.012	0.1645	0.9282	-0.9311	-1.1324	-0.1838	0.652	-0.0013	2.2022	-0.5385	-0.3562	2.2971	-0.2141	1.8253	-74.0372	-11.2381	34.3489
13	0.1098	-0.0053	-0.519	-0.0925	0.0963	2.5751	0.4194	0.1661	0.0478	0.1685	-0.3332	-0.1601	0.9556	-1.4133	-0.0002	1.4894	-0.1922	0.1615	1.8628	-0.288	2.1438	-133.7988	-44.1817	-7.9421
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精密化 TLSグループ

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21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 394 through 914 )
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23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 2 through 16 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 17 through 60 )
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26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'F' and (resid 94 through 135 )
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33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'G' and (resid 201 through 231 )
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36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 187 through 232 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'I' and (resid 3 through 787 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'I' and (resid 788 through 1342 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'J' and (resid 16 through 307 )
40	X-RAY DIFFRACTION	40	chain 'J' and (resid 308 through 376 )
41	X-RAY DIFFRACTION	41	chain 'J' and (resid 377 through 703 )
42	X-RAY DIFFRACTION	42	chain 'J' and (resid 704 through 1375 )
43	X-RAY DIFFRACTION	43	chain 'K' and (resid 2 through 60 )
44	X-RAY DIFFRACTION	44	chain 'K' and (resid 61 through 80 )
45	X-RAY DIFFRACTION	45	chain 'L' and (resid 94 through 135 )
46	X-RAY DIFFRACTION	46	chain 'L' and (resid 136 through 291 )
47	X-RAY DIFFRACTION	47	chain 'L' and (resid 292 through 354 )
48	X-RAY DIFFRACTION	48	chain 'L' and (resid 355 through 562 )
49	X-RAY DIFFRACTION	49	chain 'L' and (resid 563 through 613 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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