- PDB-5tu5: PagF prenyltransferase with Tyr-Tyr-Tyr and DMSPP -
+
データを開く
IDまたはキーワード:
読み込み中...
-
基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5tu5
タイトル
PagF prenyltransferase with Tyr-Tyr-Tyr and DMSPP
要素
PagF prenyltransferase
TYR-TYR-TYR
キーワード
TRANSFERASE / RiPP / prenylation / ABBA fold
機能・相同性
Peptide O-prenyltransferase, LynF/TruF/PatF family / Family of unknown function (DUF5838) / transferase activity / metal ion binding / DIMETHYLALLYL S-THIOLODIPHOSPHATE / Putative prenyl transferase
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97856 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.9→50 Å / Num. obs: 27191 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 5.3 % / Rsym value: 0.091 / Net I/σ(I): 15.6
反射 シェル
解像度: 1.9→1.93 Å / Rsym value: 0.675
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
REFMAC
5.8.0151
精密化
XDS
データ削減
XDS
データスケーリング
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.9→25 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.941 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.932 / SU B: 3.56 / SU ML: 0.104 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.169 / ESU R Free: 0.144 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN USED IF PRESENT IN THE INPUT