温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 16 mg/ml protein in 20mM Tris/HCl pH 8.4, 5 mM benzamidine, 0.1 M NaCl, 50 mM CaCl2 mixed 1+1 with 32-35% AMMONIUM SULPHATE, 2% PEG 4000, 0.1 M Bicine-NaOH pH 8.5, 15% glycerol
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.5419 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2007年4月4日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.5419 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.98→50 Å / Num. obs: 37204 / % possible obs: 98.1 % / 冗長度: 6.9 % / Rmerge(I) obs: 0.128 / Χ2: 1.005 / Net I/av σ(I): 14.259 / Net I/σ(I): 7.3 / Num. measured all: 258206
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Rmerge(I) obs
Num. unique all
Χ2
% possible all
1.98-2.05
3.7
0.912
3013
0.983
81.5
2.05-2.13
6
0.773
3708
1.018
99.7
2.13-2.23
7
0.664
3740
0.998
99.9
2.23-2.35
7.1
0.496
3733
1.012
99.9
2.35-2.49
7.2
0.392
3737
1.015
99.9
2.49-2.69
7.3
0.287
3767
1.003
99.8
2.69-2.96
7.5
0.196
3777
1.006
99.8
2.96-3.39
7.7
0.109
3807
0.999
99.9
3.39-4.26
7.8
0.062
3863
1.002
100
4.26-50
7.4
0.043
4059
1.001
99.7
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
SCALEPACK
データスケーリング
REFMAC
5.2.0019
精密化
PDB_EXTRACT
3.22
データ抽出
XDS
データ削減
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse model 解像度: 1.98→47.67 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.951 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.928 / SU B: 3.368 / SU ML: 0.094 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.148 / ESU R Free: 0.137 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor possibly two conformations, but modeled conformation is at least 80% probably bound as ammonium ion. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2145
1622
5 %
RANDOM
Rwork
0.1846
-
-
-
obs
0.186
30785
85.92 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK