温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: 16 mg/ml protein in 20mM Tris/HCl pH 8.4, 5 mM benzamidine, 0.1 M NaCl, 50 mM CaCl2 mixed 1+1 with 32-35% AMMONIUM SULPHATE, 2% PEG 4000, 0.1 M Bicine-NaOH pH 8.5, 15% glycerol
-
データ収集
回折
平均測定温度: 100 K
放射光源
由来: 回転陽極 / タイプ: BRUKER AXS MICROSTAR / 波長: 1.54178 Å
検出器
タイプ: MAR scanner 345 mm plate / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2007年4月4日
放射
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1.54178 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.98→50 Å / Num. obs: 37912 / % possible obs: 99.6 % / 冗長度: 30.5 % / Rmerge(I) obs: 0.125 / Χ2: 1.031 / Net I/av σ(I): 32.205 / Net I/σ(I): 7.4 / Num. measured all: 1156773
反射 シェル
Diffraction-ID: 1 / Rejects: _
解像度 (Å)
冗長度 (%)
Num. unique all
Χ2
% possible all
Rmerge(I) obs
1.98-2.05
17
3555
0.966
95.8
2.05-2.13
29
3744
1.092
100
0.821
2.13-2.23
31.5
3744
1.031
100
0.64
2.23-2.35
31.9
3745
1.076
100
0.477
2.35-2.49
32.2
3763
1.032
100
0.377
2.49-2.69
32.6
3785
1.036
100
0.274
2.69-2.96
32.8
3793
1.019
100
0.186
2.96-3.39
33
3822
1.013
100
0.102
3.39-4.26
32.9
3872
1.01
100
0.058
4.26-50
31.4
4089
1.007
99.9
0.041
-
解析
ソフトウェア
名称
バージョン
分類
NB
SCALEPACK
データスケーリング
REFMAC
5.2.0019
精密化
PDB_EXTRACT
3.22
データ抽出
XDS
データ削減
PHASER
位相決定
精密化
構造決定の手法: 分子置換 開始モデル: inhouse model 解像度: 1.98→49.69 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.957 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.94 / SU B: 2.931 / SU ML: 0.084 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.128 / ESU R Free: 0.123 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD 詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor crystal soaked with ca. 200mM cyclohexylamine for 1h single binding site is in s1 pocket probably bound as ammonium ion. HYDROGENS HAVE ...詳細: the numbering follows that of the unprocessed precursor crystal soaked with ca. 200mM cyclohexylamine for 1h single binding site is in s1 pocket probably bound as ammonium ion. HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.2041
1775
5 %
RANDOM
Rwork
0.1721
-
-
-
obs
0.1737
33713
93.21 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK