登録情報 | データベース: PDB / ID: 5nhc |
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タイトル | Crystal structure of xylose isomerase from Piromyces E2 in complex with two Co2+ ions and xylulose |
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要素 | Xylose isomerase |
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キーワード | ISOMERASE / TIM-barrel |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
D-xylose catabolic process to ethanol / xylose isomerase / xylose isomerase activity / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Xylose isomerase, bacterial-type / Xylose isomerase / Xylose isomerase family profile. / Divalent-metal-dependent TIM barrel enzymes / Xylose isomerase-like, TIM barrel domain / Xylose isomerase-like TIM barrel / Xylose isomerase-like superfamily / TIM Barrel / Alpha-Beta Barrel / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 : / 4-HYDROXYPROLINE / D-XYLULOSE / Xylose isomerase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Piromyces sp. E2 (菌類) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 1.93 Å |
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データ登録者 | Rozeboom, H.J. / Janssen, D.B. |
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引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2017 タイトル: Metal Dependence of the Xylose Isomerase from Piromyces sp. E2 Explored by Activity Profiling and Protein Crystallography. 著者: Lee, M. / Rozeboom, H.J. / de Waal, P.P. / de Jong, R.M. / Dudek, H.M. / Janssen, D.B. |
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履歴 | 登録 | 2017年3月21日 | 登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE |
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改定 1.0 | 2017年11月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月15日 | Group: Database references / カテゴリ: citation / citation_author / Item: _citation.title / _citation_author.name |
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改定 1.2 | 2017年11月22日 | Group: Database references / カテゴリ: citation Item: _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last |
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改定 1.3 | 2018年8月29日 | Group: Data collection / Database references / カテゴリ: pdbx_database_related / Item: _pdbx_database_related.db_id |
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改定 1.4 | 2019年11月20日 | Group: Derived calculations / カテゴリ: pdbx_struct_conn_angle / struct_conn |
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改定 1.5 | 2024年5月1日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ncs_dom_lim Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id |
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