+Open data
-Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5jsb | ||||||
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Title | Crystal structure of Mcl1-inhibitor complex | ||||||
Components |
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Keywords | Viral Protein/Inhibitor / McL-1 / antiMcl1 / complex / Viral Protein-Inhibitor complex | ||||||
Function / homology | Function and homology information positive regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway / cell fate determination / cellular homeostasis / Bcl-2 family protein complex / mitochondrial fusion / BH domain binding / BH3 domain binding / negative regulation of anoikis / protein transmembrane transporter activity / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand ...positive regulation of oxidative stress-induced neuron intrinsic apoptotic signaling pathway / cell fate determination / cellular homeostasis / Bcl-2 family protein complex / mitochondrial fusion / BH domain binding / BH3 domain binding / negative regulation of anoikis / protein transmembrane transporter activity / negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand / release of cytochrome c from mitochondria / negative regulation of autophagy / response to cytokine / intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage / Signaling by ALK fusions and activated point mutants / channel activity / Interleukin-4 and Interleukin-13 signaling / regulation of apoptotic process / mitochondrial outer membrane / positive regulation of apoptotic process / protein heterodimerization activity / DNA damage response / negative regulation of apoptotic process / mitochondrion / nucleoplasm / membrane / nucleus / cytosol / cytoplasm Similarity search - Function | ||||||
Biological species | Homo sapiens (human) synthetic construct (others) | ||||||
Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.74 Å | ||||||
Authors | Shen, B.W. / Stoddard, B.L. | ||||||
Funding support | United States, 1items
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Citation | Journal: Elife / Year: 2016 Title: Computationally designed high specificity inhibitors delineate the roles of BCL2 family proteins in cancer. Authors: Berger, S. / Procko, E. / Margineantu, D. / Lee, E.F. / Shen, B.W. / Zelter, A. / Silva, D.A. / Chawla, K. / Herold, M.J. / Garnier, J.M. / Johnson, R. / MacCoss, M.J. / Lessene, G. / Davis, ...Authors: Berger, S. / Procko, E. / Margineantu, D. / Lee, E.F. / Shen, B.W. / Zelter, A. / Silva, D.A. / Chawla, K. / Herold, M.J. / Garnier, J.M. / Johnson, R. / MacCoss, M.J. / Lessene, G. / Davis, T.N. / Stayton, P.S. / Stoddard, B.L. / Fairlie, W.D. / Hockenbery, D.M. / Baker, D. | ||||||
History |
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-Structure visualization
Structure viewer | Molecule: MolmilJmol/JSmol |
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-Downloads & links
-Download
PDBx/mmCIF format | 5jsb.cif.gz | 666.9 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
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PDB format | pdb5jsb.ent.gz | 560.6 KB | Display | PDB format |
PDBx/mmJSON format | 5jsb.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
Others | Other downloads |
-Validation report
Summary document | 5jsb_validation.pdf.gz | 517.4 KB | Display | wwPDB validaton report |
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Full document | 5jsb_full_validation.pdf.gz | 550.7 KB | Display | |
Data in XML | 5jsb_validation.xml.gz | 55.5 KB | Display | |
Data in CIF | 5jsb_validation.cif.gz | 76 KB | Display | |
Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/js/5jsb ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/js/5jsb | HTTPS FTP |
-Related structure data
-Links
-Assembly
Deposited unit |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Component-ID: _ / Beg auth comp-ID: ASP / Beg label comp-ID: ASP / Refine code: _
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