- PDB-5jbs: Conformational changes during monomer-to-dimer transition of Bruc... -
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基本情報
登録情報
データベース: PDB / ID: 5jbs
タイトル
Conformational changes during monomer-to-dimer transition of Brucella suis VirB8
要素
Type IV secretion system protein virB8
キーワード
TRANSPORT PROTEIN / M012R-VirB8
機能・相同性
機能・相同性情報
protein secretion by the type IV secretion system / identical protein binding / plasma membrane 類似検索 - 分子機能
VirB8 protein / Type IV secretion system protein VirB8/PtlE / Bacterial virulence protein VirB8 / VirB8 protein / NTF2-like domain superfamily / Nuclear Transport Factor 2; Chain: A, / Roll / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
DI(HYDROXYETHYL)ETHER / Type IV secretion system protein virB8 類似検索 - 構成要素
A: Type IV secretion system protein virB8 B: Type IV secretion system protein virB8 C: Type IV secretion system protein virB8 D: Type IV secretion system protein virB8 ヘテロ分子
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 0.97 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.95→42.2 Å / Num. obs: 48835 / % possible obs: 97 % / 冗長度: 3.5 % / Net I/σ(I): 2.4
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解析
ソフトウェア
名称: REFMAC / バージョン: 5.8.0123 / 分類: 精密化
精密化
構造決定の手法: 分子置換 / 解像度: 1.95→42.2 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.96 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.936 / SU B: 5.374 / SU ML: 0.142 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.155 / ESU R Free: 0.152 / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS