PDB-5ikc: X-RAY STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN DOUBLECORTIN in...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5ikc

タイトル

X-RAY STRUCTURE OF THE N-TERMINAL DOMAIN OF HUMAN DOUBLECORTIN in complex with FAB

要素

Ighg protein
MAb 6H10 light chain
Neuronal migration protein doublecortin

キーワード

TRANSFERASE / DCX DOMAIN / UBIQUITIN-LIKE FOLD / MICROTUBULE ASSOCIATED / SIGNALING PROTEIN

機能・相同性

機能・相同性情報

axoneme assembly / Neurofascin interactions / microtubule associated complex / central nervous system development / neuron migration / nervous system development / retina development in camera-type eye / microtubule binding / microtubule / cytoskeleton ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Mus musculus (ハツカネズミ)

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 2.06 Å

データ登録者

Ruf, A. / Stihle, M. / Benz, J. / Thoma, R. / Rudolph, M.G.

引用

ジャーナル: J.Biol.Chem. / 年: 2016
タイトル: Crystal Structures of the Human Doublecortin C- and N-terminal Domains in Complex with Specific Antibodies.
著者: Burger, D. / Stihle, M. / Sharma, A. / Di Lello, P. / Benz, J. / D'Arcy, B. / Debulpaep, M. / Fry, D. / Huber, W. / Kremer, T. / Laeremans, T. / Matile, H. / Ross, A. / Rufer, A.C. / Schoch, ...

履歴

登録	2016年3月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2016年5月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2016年6月8日	Group: Database references
改定 1.2	2016年12月14日	Group: Structure summary
改定 2.0	2020年3月11日	Group: Polymer sequence / カテゴリ: entity_poly / Item: _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can
改定 2.1	2024年11月20日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5ikc.cif.gz	419.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5ikc.ent.gz	343.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5ikc.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ik/5ikc ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ik/5ikc	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5in7C 5io9C 5ioiC 5ip4C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6svl-1 6dfi-d 3r08-d 6o3b-2 4l5f-d 6fla-2 6o9h-2 1tqc-d 4ps4-d 6plk-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#21 - 2001年9月抗体 (Antibodies) 類似性 (1) #256 - 2021年4月 SARSコロナウイルス2型のスパイクと抗体 (SARS-CoV-2 Spike and Antibodies) 類似性 (1)

登録構造単位

A: MAb 6H10 light chain

B: Ighg protein

H: Ighg protein

L: MAb 6H10 light chain

M: Neuronal migration protein doublecortin

N: Neuronal migration protein doublecortin

ヘテロ分子

113 kDa, 6 ポリマー
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1

A: MAb 6H10 light chain

B: Ighg protein

M: Neuronal migration protein doublecortin

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
56.7 kDa, 3 ポリマー
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2

H: Ighg protein

L: MAb 6H10 light chain

N: Neuronal migration protein doublecortin

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
56.7 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	66.858, 110.399, 75.092
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 106.540, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: 抗体	MAb 6H10 light chain 分子量: 23509.977 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: LC / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: A0A0U5BC76
#2: 抗体	Ighg protein 分子量: 22799.244 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Mus musculus (ハツカネズミ) / 遺伝子: Ighg / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: Q569X1
#3: タンパク質	Neuronal migration protein doublecortin / Doublin / Lissencephalin-X / Lis-X 分子量: 10398.659 Da / 分子数: 2 / Fragment: N-terminal domain, UNP Residues 133-221 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: DCX, DBCN, LISX / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: O43602
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 385 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.36 Å³/Da / 溶媒含有率: 47.81 %
結晶化	温度: 295 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / 詳細: unknown

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

SLS

/ ビームライン: X10SA / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: PSI PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2014年1月13日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.06→41.825 Å / Num. obs: 63983 / % possible obs: 99.1 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 3.3 % / B_iso Wilson estimate: 37.398 Å² / CC_1/2: 0.991 / R_merge(I) obs: 0.149 / Net I/σ(I): 7.33

反射シェル

解像度 (Å)	最高解像度 (Å)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	Diffraction-ID	% possible all
2.06-2.11		1.407	0.96	1	97.2
2.11-2.17		1.156	1.16	1	99.8
2.17-2.23		1.189	1.15	1	99.1
2.23-2.3		0.83	1.73	1	96.2
2.3-2.38		0.727	1.82	1	99.8
2.38-2.46		0.629	2.22	1	99.9
2.46-2.56		0.521	2.73	1	99.7
2.56-2.66		0.409	3.36	1	99.7
2.66-2.78		0.322	4.32	1	99.4
2.78-2.91		0.247	5.51	1	99.2
2.91-3.07		0.184	7.6	1	99.8
3.07-3.26		0.143	9.79	1	99.6
3.26-3.48		0.103	12.64	1	99.3
3.48-3.76		0.081	14.81	1	98.7
3.76-4.12		0.064	18.18	1	99.2
4.12-4.61		0.05	22.28	1	99.6
4.61-5.32		0.049	22.32	1	99.3
5.32-6.51		0.05	21.55	1	99.1
6.51-9.21		0.043	25.16	1	99.1
	9.21	0.033	33.26	1	97.1

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
XSCALE		データスケーリング
PDB_EXTRACT	3.2	データ抽出
PHENIX		精密化
XDS		データ削減
PHASER		位相決定

精密化

解像度: 2.06→41.825 Å / SU ML: 0.39 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 31.62

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2653	3227	5.06 %
R_work	0.1978	-	-
obs	0.2011	63800	98.86 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å

原子変位パラメータ

B_iso max: 131.49 Å² / B_iso mean: 41.7865 Å² / B_iso min: 15.17 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.06→41.825 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7921	0	2	385	8308
B_iso mean	-	-	28.33	37.1	-
残基数	-	-	-	-	1029

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.4984	0.7565	-1.4939	2.6138	-1.5042	5.6827	-0.0625	-0.2914	-0.188	-0.3874	-0.2722	-0.1768	0.6263	0.1672	0.1063	0.3598	0.0411	-0.0117	0.2608	0.0677	0.2779	-7.9402	-6.1536	13.0134
2	1.9993	0.3317	0.0143	2.4729	-1.1306	2.9574	0.0326	-0.1145	0.0286	-0.2208	-0.2548	-0.4488	0.3248	0.4549	0.2035	0.2421	0.0745	0.0604	0.2719	0.0593	0.2634	-2.478	3.2009	11.5283
3	3.1064	0.6147	-1.4706	3.0716	-2.4268	6.5882	0.1578	-0.2089	0.15	0.0815	-0.1692	-0.1275	-0.1867	-0.2899	0.0336	0.2573	0.0755	0.0319	0.2343	-0.0191	0.2375	-8.906	1.7342	17.0086
4	1.9033	0.8932	-0.472	2.389	-1.6784	0.9215	-0.0184	-0.0212	-0.3077	-0.4253	0.0289	0.1253	0.2505	-0.2125	0.0392	0.352	-0.0102	-0.0582	0.2641	-0.0665	0.1933	-27.2748	-7.6097	12.4114
5	5.3519	1.2051	1.6396	2.8131	-0.1588	3.3978	-0.3693	0.6884	-0.205	-0.7998	0.4061	0.4499	0.3978	0.0212	-0.0515	0.5171	-0.1372	-0.0955	0.4053	0.0377	0.3336	-36.2852	-14.8771	10.3176
6	6.5534	0.8925	2.2645	3.7982	-0.3433	3.9359	0.3134	-0.0774	-1.353	0.2248	0.0885	0.4548	0.8063	-0.5585	-0.3438	0.6525	-0.1839	-0.1114	0.3745	0.0064	0.5615	-38.9835	-22.6379	17.1373
7	5.1545	2.6904	1.4127	3.2218	-0.8113	3.7088	0.1423	-0.369	1.1103	-0.1485	-0.0033	0.4532	0.1791	-0.3151	0.0078	0.2633	0.0218	-0.0255	0.2756	-0.0733	0.4681	-21.446	18.3636	3.0278
8	8.8144	1.8586	1.8453	2.3549	0.6954	3.2383	-0.3499	0.3463	1.1206	-1.0116	0.4706	0.4516	-0.1587	-0.81	0.301	0.4741	-0.131	-0.1861	0.4548	0.268	0.2871	-23.2495	17.4527	-5.1289
9	7.5971	1.0155	-1.2142	3.1308	-0.0138	4.7263	-0.2447	0.4424	0.0802	-0.6802	0.0445	-0.1918	0.4155	0.081	0.1153	0.3026	0.0583	0.0107	0.204	0.0118	0.1689	-10.6791	12.4939	-3.9825
10	6.3446	1.5209	-1.1073	1.5063	-1.1382	1.6631	-0.3111	0.3794	0.4967	-0.6044	0.3717	0.2978	0.3204	-0.253	0.0371	0.3572	-0.0343	-0.0826	0.2573	0.0579	0.2574	-19.9597	13.1891	-2.6521
11	1.017	-0.213	0.7426	4.4073	-4.9119	6.6861	-0.3721	-0.0535	0.1472	-0.8073	0.4524	0.7573	0.9083	-0.9611	-0.8816	0.454	-0.1304	-0.0361	0.4832	0.2068	0.4869	-47.4608	-10.7751	20.8694
12	0.9034	-0.1766	0.0151	4.7297	-5.8187	8.2234	-0.1921	0.1474	0.3042	-0.1716	0.1616	0.1714	0.0446	-0.2586	-0.2721	0.2101	-0.0376	-0.085	0.3469	0.1392	0.3536	-41.127	1.2192	14.9812
13	2.5915	-0.6722	0.2858	4.5948	-5.0309	6.8089	0.1238	0.3271	0.0516	-0.1297	-0.1196	0.2035	0.4241	0.2599	0.2169	0.3246	-0.0362	-0.058	0.2434	0.0555	0.2666	-35.8566	-2.0079	13.847
14	1.0458	-0.4246	-0.0964	2.4094	-3.5183	6.9058	-0.1008	0.2402	0.5287	-0.3683	0.1456	0.4052	0.568	-0.0875	-0.1004	0.3323	-0.1284	-0.1184	0.2461	0.0824	0.247	-39.2142	-2.3393	16.1071
15	1.6354	0.6521	-0.5898	5.5271	-6.9263	7.8801	-0.2898	0.1619	0.1434	0.2952	1.0046	0.659	-0.3043	-1.502	-0.8764	0.3525	0.0444	0.0477	0.582	0.1796	0.537	-48.5122	0.923	20.8037
16	6.4272	-0.0639	1.5421	2.2181	-0.6722	0.9757	-0.0823	-0.263	-0.1162	0.0119	0.1481	0.1726	0.0244	-0.0823	-0.037	0.2377	0.0664	0.0188	0.3159	-0.011	0.2501	-26.2111	-6.0743	49.3748
17	3.3841	0.427	-0.1076	0.1881	-0.294	0.738	-0.0893	0.1931	-0.2324	-0.1113	0.062	0.0444	0.1044	0.0747	0.0408	0.2308	0.0593	-0.0164	0.2548	-0.027	0.2503	-30.6187	-9.6026	44.0793
18	3.1832	-1.2526	0.5469	4.7115	1.2331	1.7819	-0.1414	-0.2265	-1.0942	0.5394	0.0013	0.7609	0.634	-0.0835	0.0913	0.4077	-0.0027	0.1221	0.2308	0.0582	0.6286	-51.1032	-30.4133	46.3715
19	1.7339	2.5466	-0.596	8.9503	-3.1041	2.7126	0.0095	0.2079	-0.2029	-0.5126	0.0125	-0.0035	0.5564	0.1125	-0.1966	0.336	0.008	-0.0211	0.331	-0.0534	0.2871	-17.1243	-28.4855	36.5916
20	3.1139	0.7224	0.1918	5.2373	-0.4484	2.3729	0.094	-0.013	-0.2003	0.1495	0.0172	-0.0475	0.1246	0.1225	-0.106	0.1715	0.0376	-0.0143	0.2803	-0.0134	0.1972	-11.3554	-22.7475	43.9723
21	1.4058	1.2996	0.6447	1.6662	1.0979	0.2783	0.0446	-0.0016	-0.1859	-0.0073	0.0285	0.1712	0.2352	0.0509	-0.0285	0.2716	0.0359	0.0118	0.3031	0.0195	0.3315	-19.2013	-25.7839	40.9341
22	5.5139	-1.3069	1.8746	2.637	-0.5296	2.4744	0.146	0.3019	-0.2105	-0.1177	-0.2711	0.3836	0.1075	-0.2898	0.1731	0.2675	0.0046	-0.0236	0.3771	-0.1914	0.5076	-48.3783	-33.4004	30.8959
23	8.1263	-3.4576	4.1284	6.0468	-3.1389	5.2242	-0.1832	-0.2125	0.252	0.3013	-0.1487	-0.1748	-0.0761	-0.1333	0.306	0.2961	-0.0228	-0.02	0.2177	-0.0951	0.3832	-37.5884	-32.9034	37.477
24	5.4894	-0.8447	1.6749	3.2076	-0.8366	3.2367	0.0862	0.5865	-0.1742	-0.4179	-0.3814	0.3338	0.2709	-0.3114	0.1212	0.3702	0.0363	-0.0303	0.5205	-0.2549	0.5472	-52.0909	-34.3903	25.6706
25	8.2534	1.2911	-1.2425	2.9327	0.5725	2.7645	-0.12	-0.2377	-0.0095	0.1393	0.0168	-0.0729	0.0909	0.0728	-0.0586	0.297	0.0408	0.015	0.2795	0.1186	0.2369	18.9536	19.1222	0.2162
26	2.1145	1.3824	-3.3789	5.2184	-0.5262	7.6047	0.4658	-0.087	-0.0677	0.1372	-0.1101	0.078	0.3068	-0.3883	0.1288	0.2865	0.0474	0.0441	0.5477	0.1204	0.3766	5.7738	16.3451	3.2598
27	8.7271	0.6781	-1.3738	3.7574	0.0494	4.0817	0.3171	0.0973	-0.3762	-0.0819	-0.2506	-0.6727	0.0766	0.4499	-0.0042	0.2997	0.0546	0.0273	0.3512	0.0999	0.4673	25.701	16.0493	-6.4834
28	3.4988	2.5962	-3.7345	4.6927	-0.4092	8.0377	-0.3498	0.4216	-1.2404	-0.3392	-0.5109	-0.7693	0.1103	-0.0377	0.1261	0.2825	0.1627	0.0289	0.4851	0.0476	0.49	17.7952	14.0707	-10.4605
29	2.5111	1.7377	-1.7107	5.0628	1.179	3.0388	0.1706	1.4255	-0.8752	-0.2416	0.073	-0.0117	0.0147	-0.942	0.1627	0.3493	0.0677	-0.0388	0.7188	-0.1039	0.5877	6.5243	13.1338	-8.9379
30	8.1566	0.0802	-3.1207	3.6919	1.3022	4.9801	0.6257	0.9331	1.5789	-0.7552	-0.7505	0.6496	-0.5567	-0.4652	-0.4103	0.4989	0.1559	0.0938	0.4205	0.1645	0.6338	13.1314	27.6072	-6.8452
31	7.5269	0.6971	-2.041	3.0215	1.0207	8.1898	0.3834	-0.3221	0.8714	-0.5589	0.0639	-0.7046	-0.7938	0.0669	-0.3752	0.3869	0.0364	0.1475	0.4169	0.0122	0.5629	23.2366	26.3014	-3.1714
32	2.157	0.6855	-1.0425	4.1308	0.5729	2.0059	0.3143	0.4081	0.6334	-0.1941	-0.3425	0.4128	0.0908	-0.5366	-0.0607	0.2889	0.139	0.0379	0.5538	0.0707	0.4823	7.2316	23.5314	-2.9901
33	7.7861	0.3997	0.6107	2.3369	-0.748	2.941	0.0602	-0.5895	0.3681	0.164	-0.1097	0.0009	-0.0972	0.0652	0.0297	0.1774	0.0389	0.0087	0.1657	-0.0028	0.2139	9.833	-5.5449	52.4134
34	2.4103	2.8612	-1.275	3.5494	-0.64	5.3005	-0.1679	-0.3555	-0.0544	-0.1154	0.2803	-0.0611	0.2449	-0.2938	-0.1943	0.1986	0.0333	0.0049	0.3725	0.0408	0.3236	-3.354	-9.2672	51.4954
35	8.7679	0.8468	-0.0087	4.3611	-1.1706	4.2358	-0.062	0.039	0.4306	-0.2673	-0.0826	-0.1019	-0.3119	-0.0344	0.1085	0.2221	-0.0033	-0.0278	0.1744	-0.035	0.1967	16.6357	-1.5865	46.3391
36	2.1989	1.7061	1.1703	2.8064	-0.2782	3.11	0.1192	0.2576	0.504	-0.0008	0.0208	0.1957	-0.2124	-0.3233	-0.0741	0.2227	0.0407	0.0347	0.2519	-0.0066	0.2957	3.1244	-0.0198	42.2996
37	5.1298	0.3845	0.3076	1.9711	-1.2046	2.5717	0.0383	-0.7014	0.5495	0.4838	0.0947	0.013	-0.9513	-0.0399	0.0015	0.4377	0.0043	0.0086	0.2664	-0.0912	0.2376	7.3167	2.6915	55.3016
38	9.147	0.4789	-0.5552	3.1469	0.3186	5.5461	-0.2038	-1.1706	0.1694	0.4977	0.0171	-0.0697	-0.1746	-0.4746	-0.1914	0.2809	0.0995	0.0293	0.487	-0.0461	0.3008	-4.0329	-0.9558	55.315

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 18 )	A	1 - 18
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 19 through 75 )	A	19 - 75
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 76 through 90 )	A	76 - 90
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 91 through 143 )	A	91 - 143
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 144 through 198 )	A	144 - 198
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 199 through 213 )	A	199 - 213
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 2 through 12 )	B	2 - 12
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 13 through 25 )	B	13 - 25
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 26 through 64 )	B	26 - 64
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 65 through 121 )	B	65 - 121
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 122 through 136 )	B	122 - 136
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 137 through 157 )	B	137 - 157
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 158 through 175 )	B	158 - 175
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 176 through 186 )	B	176 - 186
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 187 through 215 )	B	187 - 215
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'H' and (resid 2 through 43 )	H	2 - 43
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'H' and (resid 44 through 136 )	H	44 - 136
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'H' and (resid 137 through 215 )	H	137 - 215
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'L' and (resid 1 through 18 )	L	1 - 18
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'L' and (resid 19 through 75 )	L	19 - 75
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'L' and (resid 76 through 113 )	L	76 - 113
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'L' and (resid 114 through 155 )	L	114 - 155
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'L' and (resid 156 through 174 )	L	156 - 174
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'L' and (resid 175 through 213 )	L	175 - 213
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'M' and (resid 51 through 59 )	M	51 - 59
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'M' and (resid 60 through 67 )	M	60 - 67
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'M' and (resid 68 through 79 )	M	68 - 79
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'M' and (resid 80 through 90 )	M	80 - 90
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'M' and (resid 91 through 102 )	M	91 - 102
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'M' and (resid 103 through 115 )	M	103 - 115
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'M' and (resid 116 through 123 )	M	116 - 123
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'M' and (resid 124 through 139 )	M	124 - 139
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'N' and (resid 51 through 59 )	N	51 - 59
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'N' and (resid 60 through 67 )	N	60 - 67
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'N' and (resid 68 through 79 )	N	68 - 79
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'N' and (resid 80 through 102 )	N	80 - 102
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'N' and (resid 103 through 128 )	N	103 - 128
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'N' and (resid 129 through 140 )	N	129 - 140

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EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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