登録情報 | データベース: PDB / ID: 5i8s |
---|
タイトル | Structure of Mouse Acireductone dioxygenase with Ni2+ ion and pentanoic acid in the active site |
---|
要素 | 1,2-dihydroxy-3-keto-5-methylthiopentene dioxygenase |
---|
キーワード | OXIDOREDUCTASE / Product analog / off-pathway chemistry |
---|
機能・相同性 | 機能・相同性情報
Methionine salvage pathway / acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) / acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] / acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) activity / acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity / methionine metabolic process / L-methionine salvage from methylthioadenosine / nickel cation binding / oxidoreductase activity / iron ion binding ...Methionine salvage pathway / acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) / acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] / acireductone dioxygenase (Ni2+-requiring) activity / acireductone dioxygenase [iron(II)-requiring] activity / methionine metabolic process / L-methionine salvage from methylthioadenosine / nickel cation binding / oxidoreductase activity / iron ion binding / nucleus / plasma membrane / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Acireductone dioxygenase, eukaryotes / Acireductone dioxygenase ARD family / ARD/ARD' family / RmlC-like cupin domain superfamily / Jelly Rolls / RmlC-like jelly roll fold / Jelly Rolls / Sandwich / Mainly Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PENTANOIC ACID / NICKEL (II) ION / Acireductone dioxygenase類似検索 - 構成要素 |
---|
生物種 | ![](img/tx_mammal.gif) Mus musculus (ハツカネズミ) |
---|
手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.89 Å |
---|
データ登録者 | Deshpande, A.R. / Wagenpfeil, K. / Pochapsky, T.C. / Petsko, G.A. / Ringe, D. |
---|
資金援助 | 米国, 1件 組織 | 認可番号 | 国 |
---|
National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS) | GM26788 | 米国 |
|
---|
引用 | ジャーナル: Biochemistry / 年: 2016 タイトル: Metal-Dependent Function of a Mammalian Acireductone Dioxygenase. 著者: Deshpande, A.R. / Wagenpfeil, K. / Pochapsky, T.C. / Petsko, G.A. / Ringe, D. |
---|
履歴 | 登録 | 2016年2月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
---|
改定 1.0 | 2016年3月9日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
---|
改定 1.1 | 2016年3月23日 | Group: Database references |
---|
改定 1.2 | 2017年9月27日 | Group: Author supporting evidence / Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _citation.journal_id_CSD / _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
---|
改定 1.3 | 2019年12月25日 | Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization |
---|
改定 1.4 | 2023年9月27日 | Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession |
---|
|
---|