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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 5hr1 | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Crystal structure of thioredoxin L107A mutant | ||||||
Components | Thioredoxin-1 | ||||||
Keywords | OXIDOREDUCTASE / E. coli thioredoxin / thiol-redox reactions | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationDNA polymerase processivity factor activity / protein-disulfide reductase activity / cell redox homeostasis / cytoplasm / cytosol Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | ![]() | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.144 Å | ||||||
Authors | Noguera, M.E. / Vazquez, D.S. / Howard, E.I. / Cousido-Siah, A. / Mitschler, A. / Podjarny, A. / Santos, J. | ||||||
Citation | Journal: Sci Rep / Year: 2017Title: Structural variability of E. coli thioredoxin captured in the crystal structures of single-point mutants. Authors: Noguera, M.E. / Vazquez, D.S. / Ferrer-Sueta, G. / Agudelo, W.A. / Howard, E. / Rasia, R.M. / Manta, B. / Cousido-Siah, A. / Mitschler, A. / Podjarny, A. / Santos, J. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 5hr1.cif.gz | 406.7 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb5hr1.ent.gz | 342.4 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 5hr1.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 5hr1_validation.pdf.gz | 474.7 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 5hr1_full_validation.pdf.gz | 481.3 KB | Display | |
| Data in XML | 5hr1_validation.xml.gz | 24.7 KB | Display | |
| Data in CIF | 5hr1_validation.cif.gz | 35.1 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hr/5hr1 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/hr/5hr1 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 5hr0C ![]() 5hr2C ![]() 5hr3C ![]() 2trxS C: citing same article ( S: Starting model for refinement |
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| Similar structure data |
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Links
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Assembly
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
NCS domain segments: Ens-ID: 1
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