登録情報 | データベース: PDB / ID: 5h9i |
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タイトル | Crystal structure of Geobacter metallireducens SMUG1 with xanthine |
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要素 | Geobacter metallireducens SMUG1 |
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キーワード | HYDROLASE / SMUG1 / DNA damage / base excision repair / substrate specificity |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
single-strand selective uracil DNA N-glycosylase activity / oxidized pyrimidine nucleobase lesion DNA N-glycosylase activity / base-excision repair / DNA binding類似検索 - 分子機能 Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase / Uracil-DNA Glycosylase, subunit E / Uracil-DNA glycosylase-like domain / Uracil-DNA glycosylase-like / Uracil DNA glycosylase superfamily / Uracil-DNA glycosylase-like domain superfamily / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 BETA-MERCAPTOETHANOL / ISOPROPYL ALCOHOL / PENTANOIC ACID / XANTHINE / Uracil-DNA glycosylase-like domain-containing protein類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Geobacter metallireducens (バクテリア) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 1.501 Å |
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データ登録者 | Xie, W. / Cao, W. / Zhang, Z. / Shen, J. |
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資金援助 | 中国, 4件 組織 | 認可番号 | 国 |
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Science and Technology Program of Guangzhou | 201504010025 | 中国 | Foundation of Key Laboratory of Gene Engineering of the Ministry of Education | 201502 | 中国 | Guangdong Innovative Research Team | 2011Y038 | 中国 | the Fundamental Research Funds for the Central Universities | 15lgjc02 | 中国 |
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引用 | ジャーナル: Acs Chem.Biol. / 年: 2016 タイトル: Structural Basis of Substrate Specificity in Geobacter metallireducens SMUG1 著者: Zhang, Z. / Shen, J. / Yang, Y. / Li, J. / Cao, W. / Xie, W. |
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履歴 | 登録 | 2015年12月28日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2016年4月27日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2016年6月29日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_oper_list Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation |
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