登録情報 データベース : PDB / ID : 5gtd 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル o-Succinylbenzoate CoA Synthetase (MenE) from Bacillus Subtilis in Complex with the Acyl-adenylate Intermediate OSB-AMP 要素2-succinylbenzoate--CoA ligase 詳細 キーワード LIGASE / Adenylate-forming Enzyme / adenylate intermdiate / OSBAMP / in-line backside nucleophilic substitution / strained conformation機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
o-succinylbenzoate-CoA ligase / o-succinylbenzoate-CoA ligase activity / CoA-ligase activity / menaquinone biosynthetic process / ATP binding 類似検索 - 分子機能 2-succinylbenzoate--CoA ligase / : / ANL, C-terminal domain / ANL, N-terminal domain / ANL, N-terminal domain / AMP-binding enzyme, C-terminal domain / AMP-binding enzyme C-terminal domain / AMP-binding, conserved site / Putative AMP-binding domain signature. / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 ... 2-succinylbenzoate--CoA ligase / : / ANL, C-terminal domain / ANL, N-terminal domain / ANL, N-terminal domain / AMP-binding enzyme, C-terminal domain / AMP-binding enzyme C-terminal domain / AMP-binding, conserved site / Putative AMP-binding domain signature. / GMP Synthetase; Chain A, domain 3 / AMP-dependent synthetase/ligase / AMP-binding enzyme, C-terminal domain superfamily / AMP-binding enzyme / Rossmann fold / 2-Layer Sandwich / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE MONOPHOSPHATE / IMIDAZOLE / 2-SUCCINYLBENZOATE / DI(HYDROXYETHYL)ETHER / 2-succinylbenzoate--CoA ligase 類似検索 - 構成要素生物種 Bacillus subtilis (枯草菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.69 Å 詳細データ登録者 Chen, Y. / Guo, Z. 資金援助 香港, 1件 詳細 詳細を隠す組織 認可番号 国 the University Grants Council of the Government of the Hong Kong Special Administrative Region SBI14SC05 香港
引用 残り1件を表示 表示を減らす履歴 登録 2016年8月20日 登録サイト : PDBJ / 処理サイト : PDBJ改定 1.0 2017年1月4日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2023年11月8日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_conn_type Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn_type.id 改定 2.0 2024年5月29日 Group : Advisory / Atomic model ... Advisory / Atomic model / Data collection / Derived calculations / Non-polymer description / Structure summary カテゴリ : atom_site / atom_site_anisotrop ... atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / entity / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_validate_close_contact / struct_conn / struct_site Item : _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id ... _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_comp_id / _chem_comp.formula / _chem_comp.formula_weight / _chem_comp.id / _chem_comp.mon_nstd_flag / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_atom.comp_id / _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag / _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config / _chem_comp_atom.type_symbol / _chem_comp_bond.atom_id_1 / _chem_comp_bond.atom_id_2 / _chem_comp_bond.comp_id / _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag / _chem_comp_bond.value_order / _entity.pdbx_description / _pdbx_entity_nonpoly.comp_id / _pdbx_entity_nonpoly.name / _pdbx_nonpoly_scheme.mon_id / _pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id
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