PDB-5f4w: Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from Streptococcus pyogenes in...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5f4w

タイトル

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from Streptococcus pyogenes in complex with TBP

要素

Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

キーワード

LYASE / Covalent intermediate / Acidic pH / Substrate / Aldolase / Class I

機能・相同性

機能・相同性情報

tagatose-bisphosphate aldolase / tagatose-bisphosphate aldolase activity / 6-deoxy-6-sulfofructose-1-phosphate aldolase activity / lactose catabolic process via tagatose-6-phosphate / 6-sulfoquinovose(1-) catabolic process / D-tagatose 6-phosphate catabolic process / tagatose-6-phosphate kinase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.663 Å

データ登録者

LowKam, C.

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
著者: LowKam, C. / Liotard, B. / Sygusch, J.

履歴

登録	2015年12月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2017年2月1日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5f4w.cif.gz	783.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5f4w.ent.gz	664 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5f4w.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	5f4w_validation.pdf.gz	898.2 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5f4w_full_validation.pdf.gz	908.9 KB	表示
XML形式データ	5f4w_validation.xml.gz	63.2 KB	表示
CIF形式データ	5f4w_validation.cif.gz	96 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/5f4w ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/5f4w	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	5f2gC 5f2iC 5f2lC 5f2mC 5f4sC 5ff7C 3mhfS 5f2j PDB 未公開エントリ 5f4x C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	5f4s-2 5f2l-1 3mhg-1 5f4s-1 5f2g-1 3mhf-1 3mhg-2 5f2i-1 5ff7-2 5f2g-2 5f2m-1 3kao-1 3myp-1 3myp-2 5hjl-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (4)

登録構造単位

A: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

B: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

C: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

D: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

147 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

B: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
73.9 kDa, 2 ポリマー
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2

C: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

D: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
73.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	63.955, 107.373, 237.730
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2 / D-tagatose-1 / 6-bisphosphate aldolase 2 / Tagatose-bisphosphate aldolase 2 分子量: 36620.457 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌) 遺伝子: lacD2, lacD.2, SPy_1919, M5005_Spy1635 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63705, tagatose-bisphosphate aldolase

#1: タンパク質

Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2 / D-tagatose-1 / 6-bisphosphate aldolase 2 / Tagatose-bisphosphate aldolase 2

分子量: 36620.457 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌)
遺伝子: lacD2, lacD.2, SPy_1919, M5005_Spy1635 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63705, tagatose-bisphosphate aldolase

-
非ポリマー , 5種, 1467分子

#2: 化合物	ChemComp-P6T / 1,6-di-O-phosphono-D-tagatose / D-タガト-ス1,6-ビスりん酸分子量: 340.116 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₁₂P₂
#3: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: Cl
#4: 化合物	ChemComp-13P / 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE / ジヒドロキシアセトンリン酸分子量: 170.058 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₃H₇O₆P
#5: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1457 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.79 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.85 %
結晶化	温度: 296 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 7.5 詳細: Tris Acetate, Calcium Acetate, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A / 波長: 0.9795 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2013年7月16日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9795 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.663→50 Å / Num. obs: 170703 / % possible obs: 92.9 % / 冗長度: 4.3 % / R_merge(I) obs: 0.4 / Net I/σ(I): 15.98
反射シェル	解像度: 1.94→1.98 Å / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.089 / Mean I/σ(I) obs: 1.88 / % possible all: 88

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	1.9_1692	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3MHF

3mhf

解像度: 1.663→49.876 Å / SU ML: 0.2 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / 位相誤差: 28.1 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2056	1764	1.17 %
R_work	0.1733	-	-
obs	0.1737	150379	78.14 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.663→49.876 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10246	0	36	1460	11742

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.012	10666
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.288	14428
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	14.007	4004
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.048	1600
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	1876

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.6634-1.7083	0.5376	29	0.5344	2199	X-RAY DIFFRACTION	15
1.7083-1.7586	0.4829	61	0.4342	5498	X-RAY DIFFRACTION	38
1.7586-1.8154	0.3777	88	0.379	8049	X-RAY DIFFRACTION	56
1.8154-1.8803	0.3313	122	0.3125	9975	X-RAY DIFFRACTION	69
1.8803-1.9555	0.326	145	0.2609	11496	X-RAY DIFFRACTION	79
1.9555-2.0445	0.2624	154	0.2207	12423	X-RAY DIFFRACTION	86
2.0445-2.1523	0.2095	151	0.1944	12961	X-RAY DIFFRACTION	89
2.1523-2.2872	0.2069	165	0.1816	13479	X-RAY DIFFRACTION	92
2.2872-2.4638	0.2069	163	0.1728	13883	X-RAY DIFFRACTION	95
2.4638-2.7117	0.2235	164	0.1709	14152	X-RAY DIFFRACTION	97
2.7117-3.104	0.1865	167	0.1664	14478	X-RAY DIFFRACTION	98
3.104-3.9105	0.1725	175	0.1397	14790	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9105-49.8979	0.174	180	0.1417	15232	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.5568	0.3456	1.3262	8.8983	-1.3691	5.3217	0.1649	-0.0396	-0.1632	-0.114	-0.1605	-0.0064	0.1829	0.0082	-0.0503	0.1111	0.0378	0.0413	0.2856	-0.0313	0.1538	61.9657	55.2429	35.2684
2	6.8821	3.1569	3.5299	1.502	1.8625	3.5711	-0.0326	0.854	1.7133	-1.1143	-0.5953	1.4782	-1.2336	0.1373	0.5551	1.1043	0.2517	-0.2737	0.5953	-0.004	0.8389	61.3767	84.6443	28.2934
3	3.6368	0.2153	0.9322	1.8435	-0.7948	2.678	-0.0495	0.3447	0.3988	-0.0115	-0.0882	-0.2448	-0.3465	0.3752	0.1497	0.2771	-0.0346	0.0302	0.3055	0.0506	0.2712	66.1783	68.2229	28.3091
4	2.8114	-0.5678	-0.7043	1.8833	0.8537	2.6305	0.0556	0.2066	0.1503	-0.1152	0.0263	0.0729	-0.0985	-0.0929	-0.0848	0.1956	0.0059	0.003	0.2704	0.0571	0.1966	47.7399	61.7711	27.4396
5	4.4071	-1.2651	2.2983	2.2824	-1.8671	7.7412	-0.0408	-0.2486	1.433	-0.1998	0.0522	0.5313	-0.6586	-1.0208	0.0491	0.3134	0.058	0.0185	0.2837	-0.0236	0.4823	41.1356	77.5983	42.3395
6	2.8836	-0.357	-0.9515	3.2505	2.7108	5.5173	0.0911	-0.0497	0.1806	0.0496	-0.122	0.1236	0.086	-0.2353	0.0399	0.1438	0.0311	0.0175	0.1894	0.0384	0.149	44.7602	60.5529	40.1941
7	6.4127	-2.6941	-2.1136	2.5347	0.9895	6.0937	0.0695	-1.0704	0.7753	0.632	-0.192	-0.2144	-0.508	-0.5727	-0.0162	0.2907	0.0515	0.0083	0.5262	-0.1797	0.3406	47.1408	73.6066	55.98
8	4.7742	2.8918	0.6874	4.1035	0.6539	2.9946	0.065	-0.3078	0.3358	0.0845	-0.1033	0.1689	-0.1007	-0.2266	0.018	0.1594	0.043	0.0023	0.2183	-0.0111	0.185	55.7137	65.0501	46.8326
9	4.8129	1.9716	-0.3679	6.3399	-3.6052	5.2931	-0.1334	-0.0941	0.5531	0.3923	-0.1866	-0.6329	-1.3356	0.5946	0.3684	0.7729	-0.1666	-0.1012	0.3859	0.0098	0.5278	73.7766	79.7053	36.8961
10	6.2057	2.7464	2.2487	9.1985	5.4812	4.2035	-0.1476	-0.292	0.088	-0.2388	0.0312	-0.3161	-0.0777	-0.0926	0.0567	0.1971	0.0356	-0.0223	0.2469	0.0066	0.1264	64.8351	60.7345	48.3822
11	5.8426	-1.6859	0.9209	5.2	2.5489	6.1547	0.195	0.2247	-0.3446	-0.0396	0.1013	-0.146	0.9745	-0.1159	-0.2883	0.3886	-0.1001	-0.0097	0.4853	0.0007	0.2117	39.2961	39.3327	9.1911
12	2.2272	-0.1472	3.0199	8.6479	-3.0311	6.6004	-0.2775	-0.5288	0.8552	-0.1561	0.1607	1.2334	-0.8837	-1.4832	0.1132	0.5904	0.2219	-0.1139	1.1525	-0.0199	0.6598	18.8101	58.996	6.1431
13	2.9611	1.5355	0.2838	2.2369	0.8927	2.3692	0.0458	0.1315	0.1744	0.0378	-0.0027	0.2917	0.1133	-0.6579	-0.035	0.2599	0.0082	-0.0452	0.5657	0.0555	0.2121	31.7634	50.9129	10.0168
14	2.0759	1.1008	-0.2419	2.4725	-1.156	3.5841	-0.043	0.2647	0.091	-0.126	0.1144	-0.0236	-0.0496	0.007	-0.067	0.2358	0.0202	-0.0132	0.4176	0.0098	0.1894	46.0304	54.1771	10.903
15	2.9804	0.7449	3.1605	1.5328	1.7879	4.1094	-0.559	0.4662	0.7101	-0.6623	0.284	0.078	-1.0268	0.5099	0.2344	0.6633	-0.1326	-0.0827	0.6682	0.1402	0.3644	44.0494	64.4154	-9.9272
16	0.312	0.6569	-0.2566	2.1717	-0.7452	6.0088	-0.0989	0.5544	0.0267	-0.3393	0.2164	-0.0231	0.054	0.5033	-0.0807	0.2951	-0.0476	0.0018	0.5821	0.0011	0.2125	50.3478	51.676	-1.2769
17	1.3814	-0.8436	-1.0285	5.6172	-1.0642	4.5105	-0.1254	0.5148	-0.085	-0.7891	0.4	0.353	-0.093	0.354	-0.2938	0.5553	-0.1757	-0.0733	0.876	0.0414	0.2687	44.1039	51.1702	-20.3068
18	2.9977	1.1185	2.3756	2.024	-0.2605	6.3465	-0.0164	0.4086	0.04	-0.1803	0.117	0.0455	0.0249	-0.1341	-0.1282	0.4368	-0.026	-0.0454	0.6085	-0.018	0.2204	41.6626	44.1165	-7.0345
19	8.8378	-2.163	3.8303	4.0051	-1.2562	2.0522	-0.2734	0.07	-0.097	-0.4157	-0.2728	0.8822	0.0976	-1.5186	-0.1991	0.5001	0.0025	-0.1439	1.2744	0.0357	0.3866	16.2011	46.4675	-0.523
20	6.495	-0.7455	3.6492	5.2285	1.9292	9.4779	0.0046	0.512	-0.7832	0.0695	0.2176	-0.0096	0.7031	-0.1991	-0.2246	0.5938	-0.1389	-0.0399	0.5077	0.0032	0.2261	37.1968	35.0757	-4.2128
21	2.4185	1.0753	-1.6539	8.225	0.5709	5.1577	0.2208	0.0338	0.1739	-0.0117	-0.1778	-0.0563	-0.4571	0.155	-0.0625	0.1073	-0.0149	-0.0285	0.2905	0.0166	0.1832	30.5038	54.7651	47.4308
22	3.1994	-0.633	1.081	4.8343	-1.1844	5.0335	-0.206	-0.3262	-0.9306	-0.1462	-0.0852	-0.3472	1.0776	0.348	0.2767	0.5085	0.0422	0.1914	0.3835	0.1237	0.5421	32.9106	26.5038	58.1812
23	2.1604	-0.3752	0.295	4.2113	-3.3193	6.9304	-0.0697	-0.2213	-0.2687	-0.0171	-0.1621	-0.2663	0.1965	0.4212	0.2423	0.1679	0.0237	0.0155	0.2768	0.0377	0.2614	37.7398	40.6662	53.7444
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26	4.9698	5.9727	1.3182	8.4071	2.0652	3.3075	0.0001	-0.2564	0.0971	0.0084	-0.117	0.174	-0.1104	-0.119	0.1231	0.1679	0.0085	0.0053	0.1692	0.0328	0.1455	14.9021	52.1849	57.4284
27	2.29	1.116	0.2401	4.6	1.5786	2.7172	-0.0737	0.1738	-0.2995	-0.0242	0.0013	0.1371	0.1495	-0.1499	0.0715	0.1439	-0.0088	0.0225	0.2057	-0.0024	0.1955	12.3633	42.3118	43.6898
28	3.2402	0.3085	-0.538	3.5418	1.1345	3.688	-0.1331	0.4717	-0.3406	-0.2488	-0.1138	0.0824	0.3491	-0.1879	0.1836	0.2389	-0.0135	0.042	0.2502	-0.027	0.2076	19.948	40.6364	32.7079
29	3.1181	-2.8559	0.6976	5.4678	-1.5936	2.0178	-0.6211	0.0092	-0.4575	-0.4198	-0.1826	-0.2794	1.0213	0.4499	0.3067	0.5326	0.1335	0.1967	0.2398	0.0526	0.4402	39.5675	29.3485	47.4423
30	2.9684	1.4352	1.3457	4.1263	-2.0996	3.359	-0.1376	0.4175	-0.1805	-0.0217	-0.0742	-0.0875	0.1735	-0.018	0.1971	0.2053	0.0016	0.04	0.3628	0.0049	0.1476	33.2441	46.5392	35.8678
31	7.2537	2.895	-2.2793	7.9877	-0.1978	7.7881	-0.0481	-0.217	0.2747	-0.0876	0.1397	-0.4771	-0.7297	0.3232	-0.0881	0.3317	0.0028	0.0287	0.2866	-0.0631	0.248	8.6205	69.5641	73.8604
32	4.2532	1.3296	-3.1362	8.0249	-4.4787	8.2846	0.0386	-0.1692	-1.0182	0.2437	-0.093	0.9878	0.5132	-0.9946	0.0669	0.5592	-0.1636	0.1393	0.6575	-0.0108	0.6375	-12.1837	47.9142	77.131
33	4.6729	-2.8453	0.0179	4.1548	0.6927	2.9962	0.1471	-0.126	-0.0947	-0.0778	-0.1223	0.4158	-0.2185	-0.5966	-0.0168	0.226	-0.0153	0.054	0.3512	-0.0035	0.1967	-3.5664	59.9989	73.1084
34	2.5798	-1.4875	1.6005	3.2154	-2.1919	5.8687	-0.0076	-0.2426	-0.1334	0.1802	-0.0357	-0.0482	0.1682	0.2157	0.0192	0.1693	-0.032	0.0507	0.2532	0.0219	0.1941	10.8203	49.8073	72.6693
35	3.8148	-3.9114	0.4453	8.3265	-1.2932	4.1448	0.0551	-0.2261	0.0319	0.1036	-0.0923	-0.0548	-0.1036	0.464	0.0441	0.1339	-0.0647	0.0105	0.2549	-0.0004	0.1446	16.9697	54.586	69.4593
36	1.8691	0.9439	-1.228	4.9178	-2.141	6.6499	0.037	-0.572	-0.3022	0.5504	0.021	-0.0443	0.1898	0.3868	-0.0541	0.3522	0.0249	0.0075	0.5286	0.0314	0.2253	15.8306	49.4836	88.5172
37	0.2372	-0.4552	0.025	1.4761	1.256	3.3239	-0.0657	-0.6307	-0.0385	0.4029	0.138	0.1195	0.2809	0.1311	-0.0631	0.3335	0.0006	0.036	0.6645	0.0418	0.2087	12.3635	56.2929	92.5166
38	0.4757	-0.5179	-0.2283	0.5402	-0.1923	3.7567	0.1082	-0.6252	0.1167	0.2213	0.0068	-0.0041	0.0069	0.0437	-0.093	0.4747	-0.1081	0.0562	0.6095	-0.0667	0.2695	9.0598	62.6808	91.1826
39	5.0363	0.0639	-0.3443	1.5832	0.3801	3.246	0.1622	-0.7612	0.3088	0.4503	-0.3185	0.6123	0.2696	-0.8565	0.1484	0.5019	-0.0449	0.1607	0.6186	-0.0488	0.325	-11.0147	64.603	85.7663
40	4.4032	-1.1105	3.2912	3.334	1.9566	5.0101	-0.1445	0.0048	1.084	-0.4242	0.602	-0.7958	-2.0104	2.8437	-0.4889	0.7828	-0.3564	0.0511	0.6912	-0.1448	0.495	15.6159	73.9882	80.4307

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 2:30)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 31:44)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 45:97)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 98:169)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 170:180)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 181:210)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 211:233)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 234:284)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 285:306)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 307:324)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain B and resid 3:29)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain B and resid 30:52)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain B and resid 53:110)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain B and resid 111:168)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain B and resid 169:179)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain B and resid 180:211)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain B and resid 212:233)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain B and resid 234:280)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain B and resid 281:307)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain B and resid 308:324)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain C and resid 2:27)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain C and resid 28:51)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain C and resid 52:82)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain C and resid 83:97)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain C and resid 98:138)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain C and resid 139:159)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain C and resid 160:210)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain C and resid 211:276)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain C and resid 277:303)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain C and resid 304:326)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain D and resid 1:27)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain D and resid 28:51)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain D and resid 52:97)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain D and resid 98:137)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain D and resid 138:161)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(chain D and resid 162:196)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(chain D and resid 197:225)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(chain D and resid 226:284)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(chain D and resid 285:320)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(chain D and resid 321:326)

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関連情報:EMDBヘッダ

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