PDB-5f4s: Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from Streptococcus pyogenes in...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 5f4s

タイトル

Tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from Streptococcus pyogenes in complex with FBP

要素

Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

キーワード

LYASE / Covalent intermediate / Acidic pH / Substrate / Aldolase / Class I

機能・相同性

機能・相同性情報

tagatose-bisphosphate aldolase / tagatose-bisphosphate aldolase activity / 6-deoxy-6-sulfofructose-1-phosphate aldolase activity / lactose catabolic process via tagatose-6-phosphate / 6-sulfoquinovose(1-) catabolic process / D-tagatose 6-phosphate catabolic process / tagatose-6-phosphate kinase activity
類似検索 - 分子機能

生物種

Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.724 Å

データ登録者

LowKam, C.

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: NON-STEREOSPECIFIC SUBSTRATE CLEAVAGE BY TAGATOSE-BISPHOSPHATE CLASS I ALDOLASE
著者: LowKam, C. / Liotard, B. / Sygusch, J.

履歴

登録	2015年12月3日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2016年12月28日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.conn_type_id / _struct_conn.id / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr1_symmetry / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_symmetry
改定 1.2	2024年11月20日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	5f4s.cif.gz	778 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb5f4s.ent.gz	656.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	5f4s.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	5f4s_validation.pdf.gz	1.5 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	5f4s_full_validation.pdf.gz	1.5 MB	表示
XML形式データ	5f4s_validation.xml.gz	62.8 KB	表示
CIF形式データ	5f4s_validation.cif.gz	93.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/5f4s ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/f4/5f4s	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	5f2gC 5f2iC 5f2lC 5f2mC 5f4wC 5ff7C 3mhfS 5f2j PDB 未公開エントリ 5f4x C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	5f2i-1 5f2l-1 5f4w-1 3mhf-1 5f2g-1 5ff7-2 5f2m-1 3myp-1 3mhg-2 3mhf-2 3mhg-1 5f2g-2 3myp-2 5f2m-2 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#50 - 2004年2月解糖系酵素 (Glycolytic Enzymes) 類似性 (4)

登録構造単位

A: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

B: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

C: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

D: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

147 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

A: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

C: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
73.9 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

D: Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2

ヘテロ分子

登録者が定義した集合体
73.5 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	64.011, 109.141, 238.335
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

-
タンパク質 , 1種, 4分子 ABCD

#1: タンパク質	Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2 / D-tagatose-1 / 6-bisphosphate aldolase 2 / Tagatose-bisphosphate aldolase 2 分子量: 36620.457 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌) 遺伝子: lacD2, lacD.2, SPy_1919, M5005_Spy1635 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63705, tagatose-bisphosphate aldolase

#1: タンパク質

Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2 / D-tagatose-1 / 6-bisphosphate aldolase 2 / Tagatose-bisphosphate aldolase 2

分子量: 36620.457 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現
由来: (組換発現)

Streptococcus pyogenes serotype M1 (化膿レンサ球菌)
遺伝子: lacD2, lacD.2, SPy_1919, M5005_Spy1635 / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P63705, tagatose-bisphosphate aldolase

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非ポリマー , 5種, 1393分子

#2: 化合物	ChemComp-P6F / 1,6-di-O-phosphono-D-fructose / D-フルクト-ス1,6-ビスりん酸分子量: 340.116 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₁₂P₂
#3: 化合物	ChemComp-13P / 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE / ジヒドロキシアセトンリン酸分子量: 170.058 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₃H₇O₆P
#4: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#5: 化合物	ChemComp-CA / CALCIUM ION / カルシウムジカチオン分子量: 40.078 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: Ca
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1384 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

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実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

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試料調製

結晶	マシュー密度: 2.87 Å³/Da / 溶媒含有率: 57.07 %
結晶化	温度: 296 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: Tris Acetate, Calcium Acetate, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K PH範囲: 7.5

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データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: NSLS / ビームライン: X29A / 波長: 0.9795 Å
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2013年7月16日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9795 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.724→50 Å / Num. obs: 125472 / % possible obs: 71.09 % / 冗長度: 3.6 % / R_merge(I) obs: 0.148 / Net I/σ(I): 7.2
反射シェル	解像度: 2.07→2.14 Å / Mean I/σ(I) obs: 1.58 / % possible all: 87.67

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(1.10.1_2155: ???)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング
PHENIX		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3MHF

3mhf

解像度: 1.724→50.099 Å / SU ML: 0.19 / 交差検証法: FREE R-VALUE / σ(F): 0 / 位相誤差: 27.84 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2193	1801	1.59 %
R_work	0.18	-	-
obs	0.1806	113584	64.35 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.724→50.099 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	10215	0	43	1384	11642

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	10523
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.712	14209
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.275	6407
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.067	1578
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1830

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.724-1.7705	0.5782	13	0.4408	863	X-RAY DIFFRACTION	7
1.7705-1.8226	0.5177	38	0.3851	2394	X-RAY DIFFRACTION	18
1.8226-1.8814	0.4219	62	0.3345	4144	X-RAY DIFFRACTION	31
1.8814-1.9486	0.3426	102	0.2943	6065	X-RAY DIFFRACTION	46
1.9486-2.0267	0.2721	132	0.2612	8253	X-RAY DIFFRACTION	63
2.0267-2.1189	0.2919	156	0.2388	9461	X-RAY DIFFRACTION	71
2.1189-2.2306	0.2227	158	0.2159	10284	X-RAY DIFFRACTION	77
2.2306-2.3704	0.2431	170	0.197	10800	X-RAY DIFFRACTION	81
2.3704-2.5534	0.251	177	0.1907	10705	X-RAY DIFFRACTION	81
2.5534-2.8103	0.2201	176	0.1794	10766	X-RAY DIFFRACTION	80
2.8103-3.2169	0.2169	182	0.1717	11195	X-RAY DIFFRACTION	83
3.2169-4.0527	0.1905	210	0.1409	12946	X-RAY DIFFRACTION	96
4.0527-50.1198	0.1721	225	0.1477	13907	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	2.8652	-2.1876	1.2726	3.4055	0.5792	3.8577	0.1554	-0.0017	-0.2033	0.0459	-0.0704	-0.0709	0.3243	-0.0374	-0.0082	0.0141	0.0134	0.0411	0.1726	-0.0062	0.1236	62.2718	56.449	35.8705
2	4.8505	-1.7331	0.7646	4.4268	2.5201	3.3065	-0.2009	0.5309	1.2232	-0.5962	-0.1646	0.5799	-1.3092	-0.327	0.0948	0.6125	0.1872	-0.1005	0.3375	0.0648	0.6659	61.3135	85.9112	29.3929
3	0.7768	0.6173	0.2988	1.1934	0.2982	2.1364	-0.0387	0.3502	0.2969	-0.1006	0.0078	-0.0971	-0.2564	0.1988	0.0511	0.1291	0.0057	0.0314	0.1903	0.0778	0.2104	66.4558	69.5148	29.0508
4	1.5086	-0.394	0.1668	1.764	0.6438	1.7686	0.0522	0.2305	0.0928	-0.1257	-0.0126	0.1183	-0.1221	-0.0939	-0.0078	0.0888	0.025	0.0044	0.1571	0.0786	0.1277	48.0974	63.0577	28.0267
5	3.254	-0.2412	1.6696	3.8801	-2.8218	5.003	-0.0231	0.0651	0.606	-0.5226	-0.116	0.2785	-0.6948	-0.2709	0.2475	0.2601	0.0575	-0.0018	0.1115	0.0233	0.3721	41.0771	78.8768	43.2816
6	1.6416	0.0902	-0.0106	0.657	1.2252	3.8375	0.0944	0.0582	0.0901	0.0064	-0.0879	0.1286	0.1109	-0.2293	-0.0102	0.0657	0.0255	0.0081	0.0592	0.0473	0.1245	45.0921	61.7033	40.7547
7	4.6519	-1.4148	-1.1595	7.4375	0.6373	6.0509	-0.1166	-0.4757	0.3783	0.5615	-0.0039	0.014	-0.4757	0.0319	0.0199	0.1606	0.0311	0.0297	0.1543	-0.0814	0.2238	47.3855	74.5779	56.6546
8	2.4166	1.2727	0.0159	2.5218	0.18	1.8815	0.0214	-0.0952	0.2468	0.0425	-0.02	-0.0063	-0.0892	-0.01	0.0005	0.0713	0.0381	0.0084	0.0732	0.0074	0.1312	56.0211	66.1239	47.5271
9	7.6068	-0.8404	1.3461	8.423	-5.3316	7.7931	-0.1309	0.3277	0.6882	-0.1445	-0.0572	-0.7932	-0.7269	0.574	0.1305	0.2645	-0.0898	0.0329	0.2186	0.0085	0.3344	74.0036	81.0053	37.7442
10	5.5849	-0.6398	0.0216	0.4683	0.7137	5.9816	0.126	-0.3657	-0.0015	0.2261	-0.1109	-0.1874	0.0951	0.1309	-0.0277	0.0454	0.0441	0.007	0.0899	0.0124	0.0695	65.2969	61.6576	48.998
11	3.4792	-0.1856	-0.6327	3.8113	-1.145	3.7663	0.1081	0.1208	0.1836	0.0317	-0.1127	0.0043	-0.1556	-0.0843	-0.0034	0.0213	-0.0316	-0.0124	0.1298	-0.0181	0.1105	30.5714	52.6015	49.0163
12	0.4115	0.2789	-0.2162	0.312	-0.2682	0.2323	-0.3358	-0.0467	-0.4975	-0.0723	-0.0809	-0.1299	0.6509	0.0354	-0.1393	0.7624	0.0531	0.5969	0.3114	0.1567	0.6477	32.9624	26.5441	57.688
13	0.2786	-0.0694	-0.184	0.4549	-0.2571	1.3125	-0.0854	-0.2293	-0.3205	-0.0392	-0.0132	-0.0361	0.1689	0.0702	0.0903	0.1013	0.017	0.0145	0.081	0.0596	0.1824	29.6184	41.5139	55.6547
14	2.5315	0.9045	0.7326	1.8493	0.9275	1.9797	0.002	-0.1043	0.001	0.0356	0.0226	0.0919	0.0647	-0.1265	-0.0128	0.0659	-0.0068	0.0267	0.0359	0.0482	0.1052	16.8316	48.688	55.6879
15	1.0109	-2.5829	-1.4776	6.9558	4.6525	4.325	-0.3196	0.2394	-0.6095	0.0227	-0.0371	-0.0047	0.6022	-0.3233	0.3143	0.3444	-0.0885	0.0679	0.1832	-0.0977	0.4716	8.4127	31.2305	42.2632
16	1.4896	0.6746	0.7453	2.2212	0.7441	2.7497	-0.0479	0.2168	-0.2547	-0.2145	0.0208	0.1558	0.0926	-0.1308	-0.0106	0.0644	-0.0398	0.0025	0.0629	-0.013	0.1401	13.1175	47.4833	43.0855
17	4.7888	1.8177	2.9275	2.2055	1.9725	6.141	-0.1287	0.5668	-0.681	-0.6144	0.0018	0.0928	0.7928	-0.1422	0.0124	0.3989	-0.0979	0.0763	0.3243	-0.1715	0.3747	15.3237	35.523	27.1356
18	4.2273	-0.3167	0.0868	2.324	0.7358	3.6781	-0.0048	0.2735	-0.4108	-0.1227	-0.11	0.1287	0.4743	-0.066	0.0632	0.148	-0.0244	0.0425	0.1295	-0.0094	0.1155	23.4959	44.1031	36.2567
19	0.6778	-0.5832	0.4072	1.9977	-0.8477	0.4093	-0.4462	-0.1535	-0.2377	0.2222	-0.045	-0.0205	0.5273	0.0768	-0.4153	0.7141	0.0785	0.3397	0.1641	0.0442	0.4851	41.5457	29.8572	46.6898
20	3.139	2.6126	0.0145	3.4766	1.9372	2.8627	0.0145	0.4211	-0.0984	-0.5321	0.0098	-0.0898	-0.1639	0.0082	-0.0673	0.1512	0.0151	0.0285	0.2581	0.0077	0.0838	32.9462	48.8184	35.1833
21	6.4938	-0.671	3.6501	7.1605	1.8143	6.692	0.2296	0.1749	-0.4237	-0.1918	0.1672	-0.1715	0.6857	-0.2168	-0.4594	0.4089	-0.0607	-0.0182	0.4152	-0.0087	0.1515	40.5953	39.009	9.7587
22	6.5455	-0.2911	0.9358	5.4363	-1.5469	0.681	-0.3203	1.0845	1.2342	-0.937	-0.0874	1.0209	-1.0178	-1.4155	0.3233	0.9771	0.2864	-0.2931	1.2087	0.0167	0.7947	20.1496	60.5947	6.4551
23	4.6044	2.6012	2.5399	3.6809	3.011	5.5322	0.2335	-0.2738	0.1997	0.0776	-0.4212	0.6175	0.1929	-1.1815	0.2363	0.3102	-0.0978	-0.0385	0.7532	-0.0207	0.2522	26.0225	46.3482	10.3913
24	4.6424	-1.6229	1.4839	3.9802	1.6804	6.3294	0.1912	0.4881	0.084	0.2571	-0.0717	-0.1722	0.0881	-0.4658	-0.0674	0.1225	0.0134	-0.0249	0.4436	0.015	0.075	35.527	52.9065	10.8606
25	1.6636	1.0471	-1.4176	2.1982	-1.5048	5.1203	-0.0443	0.323	0.2231	-0.2553	0.0597	0.0721	-0.1757	0.1395	-0.0057	0.1885	0.0186	-0.0693	0.3764	0.0687	0.1749	43.4679	59.2623	11.1599
26	2.8642	3.5249	-1.754	8.4699	-3.6171	4.4785	0.1068	0.1529	-0.0214	-0.2295	-0.1356	0.0012	0.083	0.3414	0.0979	0.1561	0.0194	-0.0344	0.3749	0.0204	0.1221	50.0463	54.5819	15.1597
27	0.0192	-0.0655	-0.1662	1.5162	-0.539	4.4797	-0.1155	0.4839	0.1542	-0.4432	0.128	0.0947	-0.2226	0.1959	0.0018	0.3506	-0.0825	-0.0614	0.5866	0.0673	0.2179	48.3451	56.3985	-1.6033
28	0.525	-0.1177	0.2171	0.1006	-0.2234	0.5544	-0.0189	0.4738	0.0872	-0.2296	0.1035	0.0269	0.0841	0.1981	0.202	0.4749	-0.05	-0.1343	0.92	-0.0163	0.0911	43.3031	47.8795	-11.3718
29	2.3606	0.2875	3.14	2.5381	-1.5674	7.5989	-0.3342	-0.5507	0.2347	-0.0918	0.2156	0.5959	-0.923	-1.6341	0.0702	0.6546	0.3021	-0.084	1.4767	0.0174	0.3575	17.002	48.9684	0.1401
30	0.7636	0.6554	2.0575	2.1706	1.1887	5.753	0.498	0.4918	-0.5478	-0.3823	-0.0396	0.1422	0.5006	-0.1711	-0.5227	0.539	-0.0981	-0.0878	0.6686	-0.0187	0.2282	35.4202	37.2061	-3.8082
31	4.3936	1.2403	-0.4438	8.3801	2.2223	5.7201	0.0769	-0.6041	0.1876	0.076	0.2601	-0.1511	-0.6446	0.4047	-0.2392	0.3395	0.0771	0.0561	0.294	-0.0666	0.2014	8.9255	70.3403	74.7593
32	6.4938	3.707	-1.5017	6.2712	0.0347	0.9474	-0.2354	-0.2801	-1.6305	0.0651	-0.3147	0.5642	1.568	-0.8848	0.6387	1.2862	-0.359	0.1659	0.7726	-0.1092	0.8762	-11.8369	48.5361	77.7334
33	3.6388	-2.1131	-0.5418	2.6996	1.752	2.0367	0.1643	-0.0479	-0.1468	-0.1055	-0.2912	0.4747	-0.2445	-0.8583	0.0623	0.2368	0.0344	0.0754	0.4209	-0.013	0.2097	-3.1382	60.7866	73.7224
34	1.8803	-0.383	0.8498	2.2295	-1.4373	4.4883	-0.0415	-0.3222	-0.1962	0.2285	0.0056	-0.0161	0.1662	0.0052	0.0237	0.1357	-0.0133	0.0559	0.215	0.0306	0.146	11.1502	50.4746	73.0036
35	2.142	-2.6426	1.149	6.3404	-1.3297	3.1038	0.0709	-0.1679	0.0556	0.0817	-0.1306	-0.0908	0.0061	0.1637	0.1098	0.0996	-0.0382	0.0401	0.1753	0.0093	0.1186	17.3408	55.3733	70.0522
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37	0.149	-0.0382	-0.5009	0.4175	0.3405	1.8377	-0.1424	-0.5167	-0.1204	0.3905	0.091	0.1431	-0.0635	-0.1339	0.0496	0.3817	0.0658	0.0794	0.6313	0.0501	0.1588	12.3686	56.7532	93.0358
38	0.6501	0.1862	-0.4982	1.25	-0.5148	3.4771	-0.0469	-0.35	0.0402	0.2824	0.1702	0.0279	-0.0115	-0.0353	-0.0722	0.4693	-0.0246	0.0775	0.6416	-0.0765	0.1376	9.2021	63.0313	92.2593
39	5.0265	0.5286	-2.1903	1.6738	-0.502	3.4584	0.1106	0.2753	0.1496	0.2075	-0.0773	0.5202	0.6298	-1.5647	-0.0392	0.594	-0.1116	0.1405	1.0597	-0.0399	0.3438	-10.8446	65.5777	86.8141
40	3.4117	1.3644	3.8902	4.7491	3.9684	8.1616	-0.1921	0.0909	0.3042	-0.0821	0.1408	-0.6787	-0.4993	1.3897	0.0024	0.5801	0.0208	0.0337	0.4749	-0.1207	0.3338	15.9156	74.7584	81.3357

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(chain A and resid 2:30)
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(chain A and resid 31:44)
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(chain A and resid 45:97)
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(chain A and resid 98:169)
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(chain A and resid 170:180)
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(chain A and resid 181:210)
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(chain A and resid 211:233)
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(chain A and resid 234:284)
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(chain A and resid 285:306)
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(chain A and resid 307:324)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(chain B and resid 3:29)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(chain B and resid 30:52)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(chain B and resid 53:110)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(chain B and resid 111:168)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(chain B and resid 169:179)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(chain B and resid 180:211)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(chain B and resid 212:233)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(chain B and resid 234:280)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(chain B and resid 281:307)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(chain B and resid 308:324)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(chain C and resid 3:27)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(chain C and resid 28:51)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(chain C and resid 52:82)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(chain C and resid 83:97)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(chain C and resid 98:138)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(chain C and resid 139:159)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(chain C and resid 160:210)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(chain C and resid 211:276)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(chain C and resid 277:303)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(chain C and resid 304:325)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(chain D and resid 1:27)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(chain D and resid 28:51)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(chain D and resid 52:97)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(chain D and resid 98:137)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(chain D and resid 138:161)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(chain D and resid 162:196)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(chain D and resid 197:225)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(chain D and resid 226:284)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(chain D and resid 285:320)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(chain D and resid 321:326)

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