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Yorodumi- PDB-5ecf: Ligand binding domain 1 of Penicillium marneffei MP1 protein comp... -
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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 5ecf | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Title | Ligand binding domain 1 of Penicillium marneffei MP1 protein complexed with arachidonic acids | |||||||||
Components | Cell wall antigen | |||||||||
Keywords | LIPID BINDING PROTEIN / LBD1 / arachidonic acid | |||||||||
| Function / homology | Cell wall mannoprotein 1 / Hydrophobic surface binding protein A / extracellular region / ARACHIDONIC ACID / Cell wall mannoprotein 1 / Cell wall mannoprotein 1 Function and homology information | |||||||||
| Biological species | Talaromyces marneffei PM1 (fungus) | |||||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / molecular replacement / Resolution: 2.6 Å | |||||||||
Authors | Lam, W.H. / Zhang, H. / Hao, Q. | |||||||||
Citation | Journal: Infect. Immun. / Year: 2019Title: Talaromyces marneffeiMp1 protein, a novel virulence factor, carries two arachidonic acid-binding domains to suppress inflammatory responses in hosts Authors: Lam, W.H. / Sze, K.H. / Ke, Y. / Tse, M.K. / Zhang, H. / Woo, P.C.Y. / Lau, S.K.P. / Lau, C.C.Y. / Xu, S. / Lai, P.M. / Zhou, T. / Antonyuk, S.V. / Kao, R.Y.T. / Yuen, K.Y. / Hao, Q. | |||||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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Downloads & links
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Download
| PDBx/mmCIF format | 5ecf.cif.gz | 539.4 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb5ecf.ent.gz | 447.4 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 5ecf.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 5ecf_validation.pdf.gz | 1.4 MB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 5ecf_full_validation.pdf.gz | 1.4 MB | Display | |
| Data in XML | 5ecf_validation.xml.gz | 51.8 KB | Display | |
| Data in CIF | 5ecf_validation.cif.gz | 70.6 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ec/5ecf ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ec/5ecf | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 5e7xSC ![]() 6j6fC S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Similar structure data |
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Assembly
| Deposited unit | ![]()
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| Unit cell |
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| Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
|
Movie
Controller
Components
About Yorodumi



Talaromyces marneffei PM1 (fungus)
X-RAY DIFFRACTION
Citation











PDBj










