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- PDB-5d7y: Crystal structure of Hepatitis B virus T=4 capsid in complex with... -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 5d7y | ||||||
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Title | Crystal structure of Hepatitis B virus T=4 capsid in complex with the allosteric modulator HAP18 | ||||||
![]() | Capsid protein | ||||||
![]() | VIRUS/INHIBITOR / capsid / core protein / hepadnavirus / icosahedral / assembly effector / assembly accelerator / allosteric modulator / HAP / VIRUS-INHIBITOR complex | ||||||
Function / homology | ![]() microtubule-dependent intracellular transport of viral material towards nucleus / T=4 icosahedral viral capsid / viral penetration into host nucleus / host cell / host cell cytoplasm / symbiont entry into host cell / structural molecule activity / DNA binding / RNA binding / identical protein binding Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Venkatakrishnan, B. / Katen, S.P. / Zlotnick, A. | ||||||
![]() | ![]() Title: Hepatitis B Virus Capsids Have Diverse Structural Responses to Small-Molecule Ligands Bound to the Heteroaryldihydropyrimidine Pocket. Authors: Venkatakrishnan, B. / Katen, S.P. / Francis, S. / Chirapu, S. / Finn, M.G. / Zlotnick, A. | ||||||
History |
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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PDBx/mmCIF format | ![]() | 122.2 KB | Display | ![]() |
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PDB format | ![]() | 99.1 KB | Display | ![]() |
PDBx/mmJSON format | ![]() | Tree view | ![]() | |
Others | ![]() |
-Validation report
Summary document | ![]() | 889.4 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 907.3 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 15.6 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 21.9 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 1qgtS S: Starting model for refinement |
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Similar structure data |
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Links
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Assembly
Deposited unit | ![]()
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1 | ![]()
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2 |
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3 | ![]()
| x 5|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
4 | ![]()
| x 6|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5 | ![]()
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6 | ![]()
| x 60|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Unit cell |
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Symmetry | Point symmetry: (Schoenflies symbol: I (icosahedral)) | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS oper:
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