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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 5ana | ||||||||||||||||||
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タイトル | THE CRYSTAL STRUCTURE OF D(GTACGTAC) AT 2.25 ANGSTROMS RESOLUTION. ARE THE A-DNA'S ALWAYS UNWOUND APPROXIMATELY 10 DEGREES AT THE C-G STEPS | ||||||||||||||||||
![]() | DNA (5'-D(*![]() DNA / A-DNA / DOUBLE HELIX | 機能・相同性 | DNA | ![]() 手法 | ![]() ![]() Takusagawa, F. | ![]() ![]() タイトル: The crystal structure of d(GTACGTAC) at 2.25 A resolution: are the A-DNA's always unwound approximately 10 degrees at the C-G steps 著者: Takusagawa, F. 履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 13.1 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 7.4 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 314.7 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 314.6 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 1.2 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 1.7 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: DNA鎖 | 分子量: 2426.617 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 |
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#2: 化合物 | ChemComp-MG / |
#3: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.31 Å3/Da / 溶媒含有率: 46.76 % | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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結晶化 | 手法: 蒸気拡散法 / 詳細: VAPOR DIFFUSION / Temp details: ROOM TEMPERATURE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 |
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結晶化 | *PLUS pH: 7 / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
溶液の組成 | *PLUS
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-データ収集
回折 | 平均測定温度: 263 K |
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検出器 | 検出器: DIFFRACTOMETER |
放射 | 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.25→25 Å / Num. all: 2348 / Num. obs: 1233 |
反射 | *PLUS 最高解像度: 2.25 Å / 最低解像度: 25 Å |
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解析
ソフトウェア | 名称: CORELS / 分類: 精密化 | ||||||||||||
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精密化 | 解像度: 2.25→25 Å /
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Refine Biso |
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.25→25 Å
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精密化 | *PLUS 最高解像度: 2.25 Å / 最低解像度: 25 Å / Num. reflection obs: 1233 / Rfactor obs: 0.184 | ||||||||||||
溶媒の処理 | *PLUS | ||||||||||||
原子変位パラメータ | *PLUS |