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Open data
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Basic information
| Entry | Database: PDB / ID: 4z88 | ||||||
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| Title | SH3-II of Drosophila Rim-binding protein with Aplip1 peptide | ||||||
Components |
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Keywords | RIM-BINDING PROTEIN / Synapse / Active Zone / SH3 domain / Aplip1 | ||||||
| Function / homology | Function and homology informationretrograde synaptic vesicle transport / presynaptic active zone organization / Pregnenolone biosynthesis / Serotonin Neurotransmitter Release Cycle / Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle / Glutamate Neurotransmitter Release Cycle / Dopamine Neurotransmitter Release Cycle / Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle / cytoskeleton of presynaptic active zone / cytoskeletal matrix organization at active zone ...retrograde synaptic vesicle transport / presynaptic active zone organization / Pregnenolone biosynthesis / Serotonin Neurotransmitter Release Cycle / Norepinephrine Neurotransmitter Release Cycle / Glutamate Neurotransmitter Release Cycle / Dopamine Neurotransmitter Release Cycle / Acetylcholine Neurotransmitter Release Cycle / cytoskeleton of presynaptic active zone / cytoskeletal matrix organization at active zone / anterograde synaptic vesicle transport / regulation of terminal button organization / presynaptic active zone cytoplasmic component / MAP-kinase scaffold activity / neuromuscular synaptic transmission / regulation of JNK cascade / axonal transport of mitochondrion / kinesin binding / JNK cascade / axon cytoplasm / neuromuscular junction / axon / protein kinase binding / metal ion binding / identical protein binding Similarity search - Function | ||||||
| Biological species | ![]() | ||||||
| Method | X-RAY DIFFRACTION / SYNCHROTRON / MOLECULAR REPLACEMENT / Resolution: 2.09 Å | ||||||
Authors | Driller, J.H. / Holton, N. / Siebert, M. / Boehme, M.A. / Wahl, M.C. / Sigrist, S.J. / Loll, B. | ||||||
| Funding support | Germany, 1items
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Citation | Journal: Elife / Year: 2015Title: A high affinity RIM-binding protein/Aplip1 interaction prevents the formation of ectopic axonal active zones. Authors: Siebert, M. / Bohme, M.A. / Driller, J.H. / Babikir, H. / Mampell, M.M. / Rey, U. / Ramesh, N. / Matkovic, T. / Holton, N. / Reddy-Alla, S. / Gottfert, F. / Kamin, D. / Quentin, C. / ...Authors: Siebert, M. / Bohme, M.A. / Driller, J.H. / Babikir, H. / Mampell, M.M. / Rey, U. / Ramesh, N. / Matkovic, T. / Holton, N. / Reddy-Alla, S. / Gottfert, F. / Kamin, D. / Quentin, C. / Klinedinst, S. / Andlauer, T.F. / Hell, S.W. / Collins, C.A. / Wahl, M.C. / Loll, B. / Sigrist, S.J. | ||||||
| History |
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Structure visualization
| Structure viewer | Molecule: Molmil Jmol/JSmol |
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| PDBx/mmCIF format | 4z88.cif.gz | 381.2 KB | Display | PDBx/mmCIF format |
|---|---|---|---|---|
| PDB format | pdb4z88.ent.gz | 314.6 KB | Display | PDB format |
| PDBx/mmJSON format | 4z88.json.gz | Tree view | PDBx/mmJSON format | |
| Others | Other downloads |
-Validation report
| Summary document | 4z88_validation.pdf.gz | 602.3 KB | Display | wwPDB validaton report |
|---|---|---|---|---|
| Full document | 4z88_full_validation.pdf.gz | 611 KB | Display | |
| Data in XML | 4z88_validation.xml.gz | 30.7 KB | Display | |
| Data in CIF | 4z88_validation.cif.gz | 44.3 KB | Display | |
| Arichive directory | https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z8/4z88 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/z8/4z88 | HTTPS FTP |
-Related structure data
| Related structure data | ![]() 4z89C ![]() 4z8aC ![]() 2csqS S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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| Deposited unit | ![]()
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X-RAY DIFFRACTION
Germany, 1items
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