PDB-4y0d: Gamma-aminobutyric acid aminotransferase inactivated by (1S,3S)-3...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4y0d

タイトル

Gamma-aminobutyric acid aminotransferase inactivated by (1S,3S)-3-amino-4-difluoromethylenyl-1-cyclopentanoic acid (CPP-115)

要素

4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

キーワード

TRANSFERASE / GABA-AT / inactivator

機能・相同性

機能・相同性情報

(S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / 4-aminobutyrate transaminase complex / succinate-semialdehyde dehydrogenase binding / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase activity / Degradation of GABA / 4-aminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase / 4-aminobutyrate:2-oxoglutarate transaminase activity / 4-aminobutyrate transaminase activity / gamma-aminobutyric acid catabolic process / behavioral response to cocaine ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Sus scrofa (ブタ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン / 解像度: 2.19 Å

データ登録者

Rui, W. / Ruslan, S. / Hyunbeom, L. / Emma, H.D. / Jose, I.J. / Neil, K. / Richard, B.S. / Dali, L.

引用

ジャーナル: J. Am. Chem. Soc. / 年: 2015
タイトル: Mechanism of inactivation of gamma-aminobutyric acid aminotransferase by (1S,3S)-3-amino-4-difluoromethylenyl-1-cyclopentanoic acid (CPP-115)
著者: Hyunbeom, L. / Emma, H.D. / Rui, W. / Ruslan, S. / Jose, I.J. / Dali, L. / Neil, K. / Richard, B.S.

履歴

登録	2015年2月5日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2015年2月25日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月22日	Group: Derived calculations / Refinement description / Source and taxonomy カテゴリ: entity_src_gen / pdbx_struct_oper_list / software Item: _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation / _software.classification
改定 1.2	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_conn Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4y0d.cif.gz	764.5 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4y0d.ent.gz	635.9 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4y0d.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

文書・要旨	4y0d_validation.pdf.gz	2 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4y0d_full_validation.pdf.gz	2 MB	表示
XML形式データ	4y0d_validation.xml.gz	81.1 KB	表示
CIF形式データ	4y0d_validation.cif.gz	116.6 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y0/4y0d ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/y0/4y0d	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4y0hC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4zsy-1 4y0i-2 1ohy-2 6b6g-2 4zsy-2 4y0h-2 6lcu-d 1ohw-2 5k1r-d 1ohv-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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シトクロムbc1 (Cytochrome bc1)
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#144 - 2011年12月
複合体I (Complex I)
類似性 (1)
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ヒドロゲナーゼ (Hydrogenase)
類似性 (1)
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クエン酸回路 (Citric Acid Cycle)
類似性 (1)
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シトクロムc (Cytochrome c)
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シトクロムp450 (Cytochrome p450)
類似性 (1)
#241 - 2020年1月
20年の分子を振り返って (Twenty Years of Molecules)
類似性 (1)

登録構造単位

A: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

B: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

C: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

D: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

212 kDa, 4 ポリマー
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1

A: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

B: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
106 kDa, 2 ポリマー
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2

C: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

D: 4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
106 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	69.555, 227.280, 70.999
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 108.83, 90.00
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

#1: タンパク質	4-aminobutyrate aminotransferase, mitochondrial / (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / GABA aminotransferase / GABA-AT / Gamma-amino-N- ...(S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase / GABA aminotransferase / GABA-AT / Gamma-amino-N-butyrate transaminase / GABA-T / L-AIBAT 分子量: 52440.973 Da / 分子数: 4 / 断片: UNP residues 39-500 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Sus scrofa (ブタ) / 遺伝子: ABAT, GABAT / 発現宿主: Sus scrofa (ブタ) 参照: UniProt: P80147, 4-aminobutyrate-2-oxoglutarate transaminase, (S)-3-amino-2-methylpropionate transaminase
#2: 化合物	ChemComp-FES / FE2/S2 (INORGANIC) CLUSTER 分子量: 175.820 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: Fe₂S₂
#3: 化合物	ChemComp-RW2 / (1S)-4-[({3-hydroxy-2-methyl-5-[(phosphonooxy)methyl]pyridin-4-yl}methyl)amino]cyclopent-3-ene-1,3-dicarboxylic acid 分子量: 402.293 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₅H₁₉N₂O₉P
#4: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1422 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.54 Å³/Da / 溶媒含有率: 51.54 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸発脱水法詳細: 0.1M ammonium acetate 0.1M bis-tris (pH: 5.5) 17% PEG 10,000 PH範囲: 5.5

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: APS / ビームライン: 23-ID-B / 波長: 0.99 Å
検出器	タイプ: RAYONIX MX-300 / 検出器: CCD / 日付: 2014年1月21日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.99 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.63→36.12 Å / Num. obs: 238799 / % possible obs: 99.7 % / 冗長度: 3.9 % / Net I/σ(I): 6.6

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(phenix.refine: 1.9_1692)	精密化
REFMAC		精密化
Coot		モデル構築
HKL-2000		データスケーリング

精密化

解像度: 2.19→36.12 Å / SU ML: 0.26 / 交差検証法: NONE / σ(F): 1.37 / 位相誤差: 21.47 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2089	5284	4.98 %
R_work	0.168	-	-
obs	0.1701	106082	99.39 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.19→36.12 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14654	0	122	1422	16198

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	15307
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.831	20696
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.064	5783
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.031	2194
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	2714

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.19-2.2146	0.318	154	0.2649	2901	X-RAY DIFFRACTION	85
2.2146-2.2406	0.3282	201	0.265	3322	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2406-2.2679	0.2911	155	0.2593	3339	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2679-2.2966	0.3263	192	0.2446	3342	X-RAY DIFFRACTION	100
2.2966-2.3269	0.268	173	0.2289	3359	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3269-2.3587	0.2723	153	0.2206	3389	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3587-2.3924	0.2824	175	0.2308	3429	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3924-2.4282	0.2871	162	0.228	3331	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4282-2.4661	0.2741	165	0.2249	3400	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4661-2.5065	0.2869	176	0.2136	3362	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5065-2.5497	0.2739	188	0.2074	3385	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5497-2.5961	0.2749	162	0.2121	3374	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5961-2.646	0.2515	187	0.2027	3368	X-RAY DIFFRACTION	100
2.646-2.7	0.2566	178	0.1965	3344	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7-2.7587	0.2415	167	0.1958	3382	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7587-2.8229	0.2375	179	0.1889	3408	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8229-2.8935	0.2394	166	0.1871	3370	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8935-2.9717	0.2333	170	0.1862	3397	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9717-3.0592	0.2398	180	0.1807	3380	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0592-3.1579	0.225	186	0.1659	3381	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1579-3.2707	0.1956	203	0.1673	3355	X-RAY DIFFRACTION	100
3.2707-3.4017	0.2084	177	0.1576	3382	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4017-3.5564	0.2063	184	0.1498	3386	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5564-3.7439	0.1717	160	0.1327	3377	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7439-3.9783	0.1469	168	0.1278	3375	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9783-4.2854	0.164	176	0.1236	3405	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2854-4.7163	0.1422	193	0.1165	3363	X-RAY DIFFRACTION	100
4.7163-5.3981	0.165	176	0.1279	3413	X-RAY DIFFRACTION	100
5.3981-6.7982	0.1771	186	0.1531	3387	X-RAY DIFFRACTION	100
6.7982-49.7045	0.1578	192	0.1404	3392	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.8948	-0.9156	0.5402	1.6269	-0.2198	2.0163	0.0362	0.2178	0.0888	-0.2715	0.0234	-0.2209	-0.0137	0.2067	-0.0305	0.2916	0.0194	0.0689	0.3224	-0.0075	0.2642	47.9644	9.4226	41.0755
2	0.9691	-0.2133	0.0035	1.0572	-0.0385	1.2119	-0.0946	-0.0974	0.1503	0.1403	0.053	-0.0473	-0.0781	0.0761	-0.0014	0.2512	0.0457	0.0031	0.2035	-0.0508	0.2555	40.1725	14.0403	62.5603
3	1.6671	-0.6597	0.5076	1.8414	-0.27	1.0983	-0.2855	-0.4489	-0.283	0.5292	0.2445	0.3698	0.6093	-0.1089	0.0312	0.5827	0.0745	0.165	0.334	0.0226	0.3596	26.0605	-10.9895	76.2289
4	1.8667	-0.4054	0.1504	1.5634	0.0139	1.7867	-0.0274	0.0406	-0.1507	0.1135	-0.0655	0.2815	0.1616	-0.1697	0.0921	0.2736	-0.0018	0.0205	0.2445	-0.0441	0.3399	23.4843	-8.6297	55.002
5	1.2099	0.072	0.2618	1.8714	0.2354	1.4944	-0.0615	-0.0287	-0.1556	0.1142	-0.0484	0.4103	0.0442	-0.3016	0.0907	0.2615	0.0386	0.0414	0.3148	-0.0381	0.3792	17.4493	1.1227	59.9725
6	1.0392	-0.1887	0.8594	1.3709	0.1232	1.5883	-0.0914	-0.015	0.0076	0.1515	0.0627	0.0348	-0.2471	0.0302	0.0501	0.2087	0.0535	0.0391	0.2359	-0.015	0.2498	30.9774	13.3306	58.2473
7	2.0749	0.3553	0.1767	0.9213	0.6228	1.7132	0.0946	0.1971	-0.2282	-0.0481	-0.0905	0.0695	0.1378	0.1127	0.0221	0.3299	0.0848	-0.0398	0.2648	-0.0537	0.2746	26.6123	5.8188	35.2055
8	2.4807	0.4962	0.537	1.4891	1.3491	3.2291	0.068	0.2737	-0.0159	-0.1621	-0.1293	0.1839	-0.0414	-0.0668	0.0289	0.2977	0.0522	-0.0215	0.2599	0.0002	0.2029	31.0147	13.3724	37.4408
9	3.1411	-0.4876	1.1663	1.3193	0.1688	2.3208	-0.1038	-0.4323	0.2798	0.4562	0.1455	-0.1462	-0.1227	0.0052	-0.0284	0.4303	0.0787	-0.0358	0.3122	-0.0744	0.2686	47.0974	10.9241	84.3255
10	0.6938	-0.1602	0.5841	0.8723	0.0521	1.5468	-0.0234	0.0147	0.0581	0.0567	0.022	-0.2323	0.0615	0.2383	0.0022	0.2327	0.045	0.0119	0.2892	-0.0434	0.2583	54.2732	5.1005	62.7574
11	1.0186	-0.3164	-0.112	0.9934	0.0946	0.2789	-0.0222	-0.0901	-0.202	0.2293	0.0308	0.0743	0.3016	-0.0184	-0.0164	0.3869	0.0518	0.0238	0.2081	0.0021	0.3224	39.5265	-19.0288	63.2608
12	2.8143	0.5182	1.4474	0.8916	-0.315	2.2236	0.1598	-0.2891	-0.3207	0.5168	-0.032	-0.0412	0.6589	-0.0564	-0.1608	0.6412	0.1188	-0.0301	0.297	-0.0292	0.3695	47.7763	-27.1188	71.2889
13	0.7314	0.3535	0.4175	0.6369	0.1647	1.3337	-0.0017	0.0807	-0.1064	0.0747	0.0547	-0.0541	0.2013	0.2369	-0.0569	0.305	0.1164	0.0007	0.3038	-0.044	0.291	56.4103	-10.7823	64.9675
14	0.8786	0.0868	-0.0663	2.2633	-0.3949	2.0812	0.1325	-0.1203	-0.17	0.2944	-0.1614	0.0964	0.1553	0.1075	0.0045	0.4324	0.0741	-0.0508	0.399	-0.0371	0.3075	56.1763	-5.9055	89.3042
15	0.9196	-0.121	0.5415	1.6714	-1.0339	3.1484	0.1193	0.1733	-0.2175	-0.2653	0.0584	0.1172	0.3271	-0.005	-0.1269	0.2954	0.0046	-0.052	0.2955	-0.0966	0.3091	40.4478	40.7631	84.5339
16	0.9757	-0.0999	0.3348	0.6394	-0.0167	1.2189	0.0656	0.2494	0.0276	-0.1183	-0.0991	0.0084	-0.0076	0.1874	0.0182	0.1993	0.0085	0.0123	0.2723	0.001	0.223	59.0711	53.9701	88.9783
17	0.8003	-0.4103	0.2976	0.8411	-0.2032	1.1495	-0.0207	-0.0626	0.1508	0.0559	0.017	0.0062	-0.2547	0.0128	0.0392	0.2544	-0.0188	0.0107	0.2216	-0.0089	0.2695	45.9533	69.1159	109.4422
18	2.1088	-0.6482	0.5037	1.3907	0.0969	2.9782	-0.005	0.045	0.3126	-0.1232	-0.0604	0.183	-0.2695	-0.3451	0.0853	0.2972	0.0221	0.0056	0.2316	0.013	0.3743	36.6249	78.12	97.8019
19	1.7207	-0.6653	0.1609	1.1835	-0.0012	0.833	0.0052	0.1221	0.1555	-0.0257	-0.0164	-0.0092	-0.1411	0.1393	0.005	0.2052	-0.0358	0.0079	0.2124	0.0288	0.2219	54.5074	68.8728	93.8414
20	3.1728	-0.2401	0.3469	2.5829	0.1117	0.8078	0.035	0.1002	-0.0877	-0.1848	-0.1291	0.3255	-0.0295	-0.155	0.0811	0.2754	0.0336	-0.0626	0.342	-0.0388	0.2656	33.2986	59.4761	78.0359
21	1.8962	-0.666	0.8432	1.8653	-0.7063	1.2793	-0.0241	0.0877	0.0903	-0.0651	-0.0275	-0.1701	-0.0274	0.2136	0.074	0.1865	-0.0449	0.0286	0.3094	0.015	0.2733	77.8129	53.2716	102.5071
22	1.6563	-0.0861	0.5936	0.6079	-0.1605	0.5535	0.0644	0.0901	-0.1436	-0.0271	-0.0181	0.0518	0.1548	0.0802	-0.0525	0.2352	0.0149	-0.0035	0.2217	-0.0508	0.2322	58.4092	40.5954	99.0083
23	1.153	-0.4301	0.2508	0.7892	-0.3589	0.7765	-0.0532	-0.1787	0.0383	0.0695	0.0414	0.0307	-0.0726	-0.0577	0.0155	0.1836	0.0042	0.014	0.1928	-0.0163	0.1656	44.0956	55.3942	118.4907
24	3.4922	-1.4109	1.3258	2.2208	-0.5763	2.0977	-0.1245	-0.563	0.026	0.2268	0.0676	-0.1164	-0.0981	-0.1516	0.0286	0.2424	-0.0252	0.0002	0.3285	-0.0164	0.2602	49.0488	49.6248	130.4031
25	0.9207	-0.1966	0.2331	0.6949	0.2927	1.1033	0.0618	-0.0484	-0.1458	0.0296	-0.014	0.0858	0.1145	-0.0398	-0.0258	0.2169	-0.0042	-0.0113	0.2231	-0.0061	0.2738	49.4652	40.2566	112.6017
26	1.7171	0.2861	0.4568	1.1148	0.1264	2.003	0.0449	-0.1068	0.1005	0.0991	0.0162	-0.073	-0.0315	0.2309	-0.0756	0.1958	0.0333	-0.0061	0.259	-0.0151	0.2471	75.6987	44.0835	121.3833

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 10 through 58 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 59 through 135 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 136 through 171 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 172 through 230 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 231 through 342 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 343 through 397 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 398 through 431 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 432 through 471 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 11 through 58 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 59 through 135 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 136 through 230 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 231 through 277 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 278 through 397 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 398 through 471 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 10 through 58 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 59 through 135 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 136 through 226 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 227 through 277 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 278 through 375 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 376 through 471 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 11 through 58 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 59 through 135 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 136 through 230 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 231 through 277 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 278 through 375 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 376 through 471 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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