PDB-4x2q: Crystal Structure of Human Aldehyde Dehydrogenase, ALDH1a2

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4x2q

タイトル

Crystal Structure of Human Aldehyde Dehydrogenase, ALDH1a2

要素

Retinal dehydrogenase 2

キーワード

OXIDOREDUCTASE / dehydrogenase / isozyme / testis / spermatogenesis

機能・相同性

機能・相同性情報

determination of bilateral symmetry / regulation of vascular endothelial cell proliferation / 3-chloroallyl aldehyde dehydrogenase activity / 9-cis-retinoic acid biosynthetic process / retinoic acid biosynthetic process / retinal dehydrogenase / ureter maturation / embryonic camera-type eye development / pituitary gland development / morphogenesis of embryonic epithelium ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 2.94 Å

データ登録者

Stenkamp, R.E. / Le Trong, I. / Amory, J.K. / Paik, J. / Goldstein, A.S.

資金援助

米国, 2件

組織	認可番号	国
National Institutes of Health/Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health & Human Development (NIH/NICHD)	U01 HD060488	米国
National Institutes of Health/Eunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health & Human Development (NIH/NICHD)	U54 HD42454	米国

引用

ジャーナル: To Be Published
タイトル: Synthesis and In Vitro Testing of Bisdichloroacetyldiamine Analogs for Use as a Reversible Male Contraceptive
著者: Goldstein, A.S. / Paik, J. / Moreb, J. / Haenisch, M. / Le Trong, I. / Stenkamp, R.E. / Petrie, A.G. / Smith, N. / Mallochowski, W.P. / Amory, J.K.

履歴

登録	2014年11月26日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2015年12月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年9月20日	Group: Author supporting evidence / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.2	2019年12月11日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.3	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4x2q.cif.gz	737.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4x2q.ent.gz	616.4 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4x2q.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

-
検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x2/4x2q ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/x2/4x2q	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	1b19S S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	1bi9-d 4x0u-2 4zvx-1 4qf6-3 4x0u-1 3sz9-5 5gt6-d 4qf6-2 3inl-1 3620 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#92 - 2007年8月タンパク質同化性ステロイド (Anabolic Steroids) 類似性 (1) #127 - 2010年7月クリスタリン (Crystallins) 類似性 (7) #89 - 2007年5月アコニターゼと鉄調節タンパク質１ (Aconitase and Iron Regulatory Protein 1) 類似性 (7)

登録構造単位

A: Retinal dehydrogenase 2

B: Retinal dehydrogenase 2

C: Retinal dehydrogenase 2

D: Retinal dehydrogenase 2

ヘテロ分子

225 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	84.597, 140.508, 164.452
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 90.000, 90.000
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
3	1	C
4	1	D

NCSドメイン領域:

Dom-ID	Component-ID	Ens-ID	Refine code	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	1	1	4	A	2 - 500
2	1	1	4	B	2 - 500
3	1	1	4	C	2 - 500
4	1	1	4	D	2 - 500

#1: タンパク質	Retinal dehydrogenase 2 / RalDH2 / Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2 / Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2 / RALDH(II) 分子量: 55522.102 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ALDH1A2, RALDH2 / プラスミド: pETite / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21deltaE3 / 参照: UniProt: O94788, retinal dehydrogenase
#2: 化合物	ChemComp-NAD / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE 分子量: 663.425 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₇N₇O₁₄P₂ / コメント: NAD*YM

#1: タンパク質

Retinal dehydrogenase 2 / RalDH2 / Aldehyde dehydrogenase family 1 member A2 / Retinaldehyde-specific dehydrogenase type 2 / RALDH(II)

分子量: 55522.102 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現)

Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: ALDH1A2, RALDH2 / プラスミド: pETite / 発現宿主:

Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21deltaE3 / 参照: UniProt: O94788, retinal dehydrogenase

#2: 化合物

ChemComp-NAD / NICOTINAMIDE-ADENINE-DINUCLEOTIDE

分子量: 663.425 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₁H₂₇N₇O₁₄P₂ / コメント: NAD*YM

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.26 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.46 %
結晶化	温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 / 詳細: TCEP, HEPES, KCl, EDTA, PEG8000, imidazole

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

回転陽極 / タイプ: RIGAKU RU200 / 波長: 1.54178 Å

検出器

タイプ: RIGAKU RAXIS IV++ / 検出器: IMAGE PLATE / 日付: 2010年9月1日

放射

プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.54178 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.94→50 Å / Num. obs: 37839 / % possible obs: 89.6 % / 冗長度: 7.4 % / R_merge(I) obs: 0.183 / Χ²: 1.257 / Net I/av σ(I): 7.192 / Net I/σ(I): 7.2

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	冗長度 (%)	Mean I/σ(I) obs	Num. unique all	Χ²	% possible all	R_merge(I) obs
2.95-3.06	6.6	1.4	3773	1.431	91
3.06-3.18	6.6		3759	1.461	90.7
3.18-3.32	6.5		3741	1.473	89.9	0.846
3.32-3.5	6.6		3677	1.46	87.8	0.595
3.5-3.72	6.7		3633	1.368	86.8	0.413
3.72-4	7		3567	1.304	84.9	0.307
4-4.41	7.2		3485	1.181	82.8	0.207
4.41-5.04	7.7		3596	1.101	85	0.145
5.04-6.35	8.2		4125	1.082	96.4	0.159
6.35-50	9.9		4483	1.024	99.9	0.065

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ削減
REFMAC	5.5.0110	精密化
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
HKL-2000		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 1B19

1b19

解像度: 2.94→50 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.915 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.88 / SU B: 66.223 / SU ML: 0.538 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R Free: 0.624 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS U VALUES : RESIDUAL ONLY

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.3128	1911	5.1 %	RANDOM
R_work	0.2661	35882	-	-
obs	0.2684	35882	89 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.4 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 203.26 Å² / B_iso mean: 71.43 Å² / B_iso min: 27.54 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-2.26 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	0.96 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.3 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.94→50 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	14657	0	108	0	14765
B_iso mean	-	-	57.19	-	-
残基数	-	-	-	-	1892

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.006	0.022	15081
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	0.922	1.967	20446
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	4.383	5	1884
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	34.853	24.362	674
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	17.129	15	2522
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	16.346	15	92
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.062	0.2	2252
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.003	0.021	11460
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	0.115	1.5	9383
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	0.218	2	15112
X-RAY DIFFRACTION	r_scbond_it	0.277	3	5698
X-RAY DIFFRACTION	r_scangle_it	0.497	4.5	5334

Refine LS restraints NCS

Ens-ID: 1 / 数: 3657 / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

Dom-ID	Auth asym-ID	タイプ	Rms dev position (Å)	Weight position
1	A	MEDIUM POSITIONAL	0.3	0.5
2	B	MEDIUM POSITIONAL	0.28	0.5
3	C	MEDIUM POSITIONAL	0.31	0.5
4	D	MEDIUM POSITIONAL	0.31	0.5
1	A	MEDIUM THERMAL	0.09	2
2	B	MEDIUM THERMAL	0.1	2
3	C	MEDIUM THERMAL	0.08	2
4	D	MEDIUM THERMAL	0.1	2

LS精密化シェル

解像度: 2.94→3.016 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.416	142	-
R_work	0.392	2424	-
all	-	2566	-
obs	-	-	82.72 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.9921	-0.9594	-1.1064	3.1603	0.5489	2.7218	0.0752	0.4186	-0.0937	-0.8175	-0.2789	-1.0274	0.1824	0.4536	0.2037	0.4832	0.1057	0.3309	0.9507	-0.1187	0.6981	45.3987	-8.527	-8.1689
2	2.5236	-0.0284	-1.5786	1.7189	1.125	2.8742	0.0454	0.3801	-0.2395	-0.2836	-0.1544	-0.4685	0.1448	0.1375	0.109	0.3229	0.1457	0.0864	0.3812	0.0581	0.2722	33.8064	-4.6821	3.3681
3	2.6605	0.2677	-2.3304	4.5283	-3.1134	3.8981	-0.953	-0.1634	-1.235	-0.55	-0.457	-0.8015	1.0819	0.4113	1.4099	0.7383	0.0837	0.2713	0.6193	0.0254	1.1361	31.6967	-23.5337	12.0678
4	2.0601	1.6438	-3.9899	2.4027	-2.4715	9.1214	-0.3731	0.0572	-0.8063	-0.383	-0.0877	-0.6939	0.829	-0.0555	0.4608	0.9226	0.3289	0.2269	0.4601	-0.2226	1.6904	31.2501	-36.4032	3.4297
5	3.4037	0.5867	-0.8808	2.46	-2.7272	5.4392	-0.2126	-1.0943	-1.1555	-0.2636	-0.3978	-0.3245	0.3247	1.3094	0.6104	0.692	0.1576	0.2257	0.842	0.0211	1.3603	32.5793	-36.5759	13.1516
6	0.9889	1.4093	0.0992	7.2462	-0.9215	0.2379	0.1309	0.513	0.0525	0.5347	0.0177	1.1373	-0.024	0.2306	-0.1486	0.6683	-0.1183	0.0923	0.6233	0.052	0.5289	24.3808	-6.6348	21.9945
7	6.3001	-2.4071	1.2068	4.7031	-2.7906	1.6681	-0.1674	-1.031	-0.4856	0.7131	0.13	-0.0514	-0.4164	-0.0694	0.0374	0.4047	-0.1505	0.0115	0.6244	0.1188	0.085	41.5902	-6.8199	56.0168
8	2.7931	-0.183	0.7266	0.499	-0.2649	0.6234	0.0212	-0.3222	-0.2772	-0.0663	0.0133	-0.0635	0.0724	-0.0065	-0.0345	0.1274	-0.0208	0.0282	0.1961	0.0603	0.1076	35.3363	-5.9422	42.0755
9	5.014	-0.4649	0.2969	17.0027	-5.4411	1.7524	-0.2494	0.6304	-0.2742	-1.2056	-0.0449	-0.9919	0.3136	0.0282	0.2943	0.7173	-0.0224	0.1679	0.4982	0.0955	0.1597	45.3353	0.3828	27.5564
10	7.0304	-4.9547	-0.7121	11.727	-12.2605	20.032	-0.2009	-0.5251	-0.1261	0.5425	0.2305	0.2046	-0.3195	0.1689	-0.0296	0.5179	-0.2396	-0.0788	0.2571	0.0602	0.903	44.2272	24.484	33.4426
11	3.7946	-0.9113	1.3502	2.0683	-2.5585	5.6246	0.1198	0.429	0.5745	-0.1773	-0.1359	-0.2222	0.0598	0.3113	0.0161	0.2559	-0.0633	0.0829	0.2494	0.0082	0.4706	51.9608	20.7644	35.0683
12	1.2426	1.753	-0.3195	5.5253	0.6751	0.5017	-0.2193	-0.1747	0.1603	-0.2864	0.0243	0.7464	0.0557	0.1378	0.195	0.5814	0.0765	-0.1122	0.5583	0.0381	0.5169	27.229	1.9355	21.2504
13	0.0914	0.0265	0.1517	8.0813	3.6029	3.0023	0.2183	0.3256	-0.1037	-1.6401	-1.6349	1.6513	-1.0878	-0.5331	1.4165	0.8903	0.4226	-0.9121	2.6123	-0.5553	1.0545	-4.4658	8.6061	-12.4084
14	1.9344	-0.0639	0.4761	2.4363	-0.4798	2.1526	0.1465	0.6633	0.0721	-0.5459	-0.2527	0.6651	-0.1661	-0.4017	0.1062	0.3896	0.1818	-0.115	0.4919	-0.0589	0.2852	1.3106	5.5271	1.4539
15	4.5733	3.692	2.831	11.1208	4.8329	2.5555	-0.1993	-0.3042	1.0103	0.5028	-0.6962	1.8064	0.0464	-0.3372	0.8955	0.5965	0.0414	0.1333	0.7393	-0.19	0.6186	-2.603	16.5096	16.1068
16	6.9905	2.1841	5.205	1.4627	1.0166	13.7109	0.2363	0.9174	0.8147	-0.7924	0.5494	0.7289	-0.2496	-1.0692	-0.7857	1.3248	0.1001	-0.2081	0.6172	0.2956	1.5174	12.597	35.1615	10.0392
17	4.9053	0.1662	2.8288	3.4096	1.8191	5.2146	-0.1369	-0.2812	1.1904	-0.476	-0.2818	0.5256	-0.5185	-0.7705	0.4188	0.7918	0.2388	-0.0872	0.2965	0.0976	1.0088	4.0958	36.8122	8.5057
18	0.696	1.0175	0.0864	4.8364	1.2954	0.4294	0.0716	0.6267	-0.1987	0.6685	0.1474	-0.9031	0.1256	-0.1926	-0.2189	0.7421	-0.0592	-0.2031	0.7657	0.0054	0.4335	12.7607	7.5096	21.5547
19	7.6539	-2.0029	-1.6669	2.3363	1.8433	1.4615	0.0592	-1.1503	0.4843	0.823	-0.0888	0.0093	0.6184	-0.0859	0.0295	0.4842	-0.2244	-0.0061	0.7375	-0.0997	0.0934	-4.4165	6.7286	56.1135
20	2.7967	0.2088	-0.564	1.0638	-0.0876	0.2637	0.0015	-0.4009	0.2766	-0.0664	-0.0204	0.049	0.003	0.0115	0.0188	0.1217	-0.0314	-0.0217	0.2053	-0.0172	0.0958	1.7926	6.0336	42.1631
21	5.1925	-1.6022	-0.4977	7.812	4.057	2.1365	-0.0109	0.5563	0.1542	-0.7704	-0.4002	0.7776	-0.3517	-0.1626	0.4111	0.6753	-0.0124	-0.1278	0.5144	0.0104	0.1905	-8.1551	-0.1615	27.5128
22	4.6615	-2.7581	-1.3559	4.9607	5.5503	15.2663	0.2648	-0.1889	-0.1545	0.6908	-0.1143	-0.178	-0.36	0.012	-0.1504	0.5526	-0.1831	0.0925	0.2469	-0.0992	0.9907	-7.0818	-24.2785	33.1444
23	4.4564	-1.3311	-1.9674	3.1087	3.2659	6.5137	0.1609	0.5842	-0.698	-0.2177	-0.2007	0.2372	-0.1327	-0.4088	0.0398	0.2046	-0.0915	-0.0707	0.2172	0.0468	0.5589	-14.8285	-20.5744	34.8124
24	0.0205	0.1023	-0.0331	5.0293	-0.9233	0.2503	-0.0196	0.0055	-0.1093	0.1853	-0.1823	-0.541	-0.1057	-0.1544	0.2019	0.4765	0.0005	0.0481	0.6323	-0.068	0.5949	9.6039	-2.1455	21.7988

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	8 - 70
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	71 - 252
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	253 - 300
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	301 - 360
5	X-RAY DIFFRACTION	5	A	361 - 436
6	X-RAY DIFFRACTION	6	A	437 - 500
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	8 - 34
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	35 - 238
9	X-RAY DIFFRACTION	9	B	239 - 281
10	X-RAY DIFFRACTION	10	B	282 - 317
11	X-RAY DIFFRACTION	11	B	318 - 436
12	X-RAY DIFFRACTION	12	B	437 - 500
13	X-RAY DIFFRACTION	13	C	8 - 34
14	X-RAY DIFFRACTION	14	C	35 - 238
15	X-RAY DIFFRACTION	15	C	239 - 281
16	X-RAY DIFFRACTION	16	C	282 - 317
17	X-RAY DIFFRACTION	17	C	318 - 436
18	X-RAY DIFFRACTION	18	C	437 - 500
19	X-RAY DIFFRACTION	19	D	8 - 34
20	X-RAY DIFFRACTION	20	D	35 - 238
21	X-RAY DIFFRACTION	21	D	239 - 281
22	X-RAY DIFFRACTION	22	D	282 - 317
23	X-RAY DIFFRACTION	23	D	318 - 436
24	X-RAY DIFFRACTION	24	D	437 - 500

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

すべてのお知らせ

-
万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

他の情報も見る

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)

-ムービー

-構造ビューア

+ビューアのログ

-このページ

-このウェブサイト

-オプション

+データを開く

-基本情報

-構造の表示

-ダウンロードとリンク

-ダウンロード

-検証レポート

-関連構造データ

-リンク

-集合体

-要素

-実験情報

-実験

-試料調製

-データ収集

-解析

+万見について

-お知らせ

-2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-2020年8月12日: 新型コロナ情報

+2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-万見 (Yorodumi)

-
ムービー

-
構造ビューア

+
ビューアのログ

-
このページ

-
このウェブサイト

-
オプション

+
データを開く

-
基本情報

-
構造の表示

-
ダウンロードとリンク

-
ダウンロード

-
検証レポート

-
関連構造データ

-
リンク

-
集合体

-
要素

-
実験情報

-
実験

-
試料調製

-
データ収集

-
解析

+
万見について

-
お知らせ

-
2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

-
2020年8月12日: 新型コロナ情報

+
2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

+
2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

+
2017年7月12日: PDB大規模アップデート

-
万見 (Yorodumi)