PDB-4wrr: A putative diacylglycerol kinase from Bacillus anthracis str. Sterne

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4wrr

タイトル

A putative diacylglycerol kinase from Bacillus anthracis str. Sterne

要素

putative diacylglycerol kinase

キーワード

TRANSFERASE / STRUCTURAL GENOMICS / CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS OF INFECTIOUS DISEASES / CSGID / Bacillus anthracis / Diacylglycerol kinase / DAGK

機能・相同性

機能・相同性情報

phospholipid biosynthetic process / kinase activity / ATP binding / metal ion binding
類似検索 - 分子機能

生物種

Bacillus anthracis (炭疽菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.16 Å

データ登録者

Hou, J. / Zheng, H. / Cooper, D.R. / Zimmerman, M.D. / Anderson, W.F. / Minor, W. / Center for Structural Genomics of Infectious Diseases (CSGID)

資金援助

米国, 1件

引用

ジャーナル: to be published
タイトル: Crystal structure of a putative diacylglycerol kinase from Bacillus anthracis str. Sterne
著者: Hou, J. / Zheng, H. / Cooper, D.R. / Zimmerman, M.D. / Minor, W.

履歴

登録	2014年10月24日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2014年11月5日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年6月3日	Group: Database references
改定 1.2	2015年10月14日	Group: Data collection
改定 1.3	2017年9月27日	Group: Author supporting evidence / Derived calculations / カテゴリ: pdbx_audit_support / pdbx_struct_oper_list Item: _pdbx_audit_support.funding_organization / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.4	2019年12月4日	Group: Author supporting evidence / カテゴリ: pdbx_audit_support / Item: _pdbx_audit_support.funding_organization
改定 1.5	2022年4月13日	Group: Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: audit_author / citation_author ...audit_author / citation_author / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn Item: _audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID ..._audit_author.identifier_ORCID / _citation_author.identifier_ORCID / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id
改定 1.6	2023年9月27日	Group: Data collection / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim Item: _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id ..._struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

-
ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4wrr.cif.gz	431.9 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4wrr.ent.gz	350.7 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4wrr.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4wrr_validation.pdf.gz	450.5 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4wrr_full_validation.pdf.gz	457.1 KB	表示
XML形式データ	4wrr_validation.xml.gz	40.2 KB	表示
CIF形式データ	4wrr_validation.cif.gz	57.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wr/4wrr ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/wr/4wrr	HTTPS FTP

-
関連構造データ

関連構造データ	3t5pSC S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	3t5p-1 3t5p-3 3s40-d 3bfd-d 1emc-d 5ulm-d 6ztf-d 3g5x-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索
その他のデータベース	TargetTrack: CSGID-IDP90228

-
リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI

登録構造単位

A: putative diacylglycerol kinase

B: putative diacylglycerol kinase

C: putative diacylglycerol kinase

D: putative diacylglycerol kinase

ヘテロ分子

132 kDa, 4 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	64.099, 138.486, 78.338
Angle α, β, γ (deg.)	90.000, 111.480, 90.000
Int Tables number	4
Space group name H-M	P12₁1

非結晶学的対称性 (NCS)

NCSドメイン:

ID	Ens-ID	詳細
1	1	A
2	1	B
1	2	A
2	2	C
1	3	A
2	3	D
1	4	B
2	4	C
1	5	B
2	5	D
1	6	C
2	6	D

NCSドメイン領域:

Component-ID: _ / Refine code: _

Dom-ID	Ens-ID	Beg auth comp-ID	Beg label comp-ID	End auth comp-ID	End label comp-ID	Auth asym-ID	Label asym-ID	Auth seq-ID	Label seq-ID
1	1	LYS	LYS	VAL	VAL	A	A	3 - 300	3 - 300
2	1	LYS	LYS	VAL	VAL	B	B	3 - 300	3 - 300
1	2	THR	THR	ALA	ALA	A	A	4 - 298	4 - 298
2	2	THR	THR	ALA	ALA	C	C	4 - 298	4 - 298
1	3	LYS	LYS	VAL	VAL	A	A	3 - 300	3 - 300
2	3	LYS	LYS	VAL	VAL	D	D	3 - 300	3 - 300
1	4	THR	THR	ALA	ALA	B	B	4 - 298	4 - 298
2	4	THR	THR	ALA	ALA	C	C	4 - 298	4 - 298
1	5	LYS	LYS	VAL	VAL	B	B	3 - 300	3 - 300
2	5	LYS	LYS	VAL	VAL	D	D	3 - 300	3 - 300
1	6	THR	THR	PRO	PRO	C	C	4 - 297	4 - 297
2	6	THR	THR	PRO	PRO	D	D	4 - 297	4 - 297

NCSアンサンブル:

ID
1
2
3
4
5
6

詳細

The biological assembly is a dimer.

#1: タンパク質	putative diacylglycerol kinase 分子量: 32889.426 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Bacillus anthracis (炭疽菌) / 株: Sterne / 遺伝子: BAK_5150 / プラスミド: pMCSG7 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21-CodonPlus(DE3)-RIL 参照: UniProt: B1EVN9, UniProt: A0A6L8P1L2*PLUS, diacylglycerol kinase (ATP)
#2: 化合物	ChemComp-MG / MAGNESIUM ION / マグネシウムジカチオン分子量: 24.305 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: Mg
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 241 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.46 Å³/Da / 溶媒含有率: 49.99 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法詳細: 0.2M sodium tartrate, 20% PEG3350 in Drop, 1.15M Sodium Chloride in Well

-
データ収集

回折

平均測定温度: 100 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 19-ID / 波長: 0.9792 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2014年3月23日 / 詳細: MIRROR

放射

モノクロメーター: SI 111 CHANNEL / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 0.9792 Å / 相対比: 1

Reflection

冗長度: 4.1 % / 数: 272427 / R_merge(I) obs: 0.088 / Χ²: 0.97 / D res high: 2.16 Å / D res low: 27 Å / Num. obs: 67013 / % possible obs: 97.8

Diffraction reflection shell

最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	ID	R_merge(I) obs	Chi squared	Redundancy
5.84	27	1	0.035	1.194	4.2
4.65	5.84	1	0.043	1.25	4.2
4.06	4.65	1	0.046	1.434	4.2
3.69	4.06	1	0.055	1.469	4.2
3.43	3.69	1	0.057	1.265	4.1
3.23	3.43	1	0.067	1.101	4.1
3.06	3.23	1	0.088	1.035	4.1
2.93	3.06	1	0.111	0.977	4.1
2.82	2.93	1	0.132	0.903	4.1
2.72	2.82	1	0.156	0.854	4
2.64	2.72	1	0.198	0.833	4
2.56	2.64	1	0.249	0.809	4
2.49	2.56	1	0.276	0.78	4
2.43	2.49	1	0.296	0.761	4
2.38	2.43	1	0.375	0.785	4.1
2.33	2.38	1	0.404	0.764	4
2.28	2.33	1	0.454	0.764	4
2.24	2.28	1	0.525	0.747	4
2.2	2.24	1	0.569	0.739	3.9
2.16	2.2	1	0.564	0.737	3.8

反射

解像度: 2.16→27 Å / Num. obs: 67013 / % possible obs: 97.8 % / 冗長度: 4.1 % / R_merge(I) obs: 0.088 / R_pim(I) all: 0.049 / R_rim(I) all: 0.101 / Χ²: 0.97 / Net I/av σ(I): 14.8 / Net I/σ(I): 6.8 / Num. measured all: 272427

反射シェル

Diffraction-ID: 1 / Rejects: _

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Num. unique all	CC_1/2	R_pim(I) all	R_rim(I) all	Χ²	% possible all
2.16-2.2	3.8	0.564	3166	0.773	0.319	0.65	0.737	92.8
2.2-2.24	3.9	0.569	3232	0.795	0.321	0.655	0.739	95.3
2.24-2.28	4	0.525	3312	0.803	0.297	0.605	0.747	96.4
2.28-2.33	4	0.454	3291	0.863	0.256	0.523	0.764	96.6
2.33-2.38	4	0.404	3365	0.887	0.228	0.465	0.764	97.5
2.38-2.43	4.1	0.375	3310	0.894	0.211	0.431	0.785	98
2.43-2.49	4	0.296	3320	0.938	0.166	0.34	0.761	97.8
2.49-2.56	4	0.276	3363	0.947	0.154	0.317	0.78	97.9
2.56-2.64	4	0.249	3345	0.947	0.14	0.286	0.809	98.4
2.64-2.72	4	0.198	3347	0.966	0.111	0.228	0.833	97.9
2.72-2.82	4	0.156	3348	0.977	0.087	0.179	0.854	97.9
2.82-2.93	4.1	0.132	3366	0.985	0.073	0.152	0.903	97.9
2.93-3.06	4.1	0.111	3334	0.989	0.061	0.127	0.977	98
3.06-3.23	4.1	0.088	3364	0.993	0.048	0.1	1.035	98.1
3.23-3.43	4.1	0.067	3352	0.995	0.037	0.077	1.101	97.8
3.43-3.69	4.1	0.057	3397	0.997	0.031	0.065	1.265	99.1
3.69-4.06	4.2	0.055	3435	0.996	0.03	0.062	1.469	99.9
4.06-4.65	4.2	0.046	3430	0.997	0.025	0.053	1.434	99.9
4.65-5.84	4.2	0.043	3453	0.998	0.024	0.049	1.25	99.9
5.84-27	4.2	0.035	3483	0.997	0.019	0.04	1.194	99.9

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-3000		データ削減
MOLREP		位相決定
REFMAC	5.8.0073	精密化
PDB_EXTRACT	3.15	データ抽出
HKL-3000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 3T5P

3t5p

解像度: 2.16→27 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.949 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.928 / SU B: 12.684 / SU ML: 0.16 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / ESU R: 0.244 / ESU R Free: 0.191 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD
詳細: U VALUES : WITH TLS ADDED HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2345	3263	4.9 %	RANDOM
R_work	0.2022	63322	-	-
obs	0.2037	63322	97.8 %	-

溶媒の処理

イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: MASK

原子変位パラメータ

B_iso max: 109.88 Å² / B_iso mean: 41.376 Å² / B_iso min: 11.9 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.44 Å²	0 Å²	0.82 Å²
2-	-	-1.09 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.68 Å²

精密化ステップ

サイクル: final / 解像度: 2.16→27 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	8358	0	4	241	8603
B_iso mean	-	-	27.9	33.7	-
残基数	-	-	-	-	1140

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	Dev ideal target	数
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_refined_d	0.012	0.019	8535
X-RAY DIFFRACTION	r_bond_other_d	0.006	0.02	7991
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_refined_deg	1.462	1.957	11632
X-RAY DIFFRACTION	r_angle_other_deg	1.091	3	18333
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_1_deg	6.344	5	1125
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_2_deg	39.137	25.287	314
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_3_deg	13.162	15	1257
X-RAY DIFFRACTION	r_dihedral_angle_4_deg	9.716	15	8
X-RAY DIFFRACTION	r_chiral_restr	0.082	0.2	1389
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_refined	0.008	0.021	9723
X-RAY DIFFRACTION	r_gen_planes_other	0.005	0.02	1837
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_it	1.744	2.561	4545
X-RAY DIFFRACTION	r_mcbond_other	1.744	2.561	4544
X-RAY DIFFRACTION	r_mcangle_it	2.748	3.824	5655

Refine LS restraints NCS

Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / タイプ: interatomic distance / Weight position: 0.05

Ens-ID	Dom-ID	Auth asym-ID	数	Rms dev position (Å)
1	1	A	16064	0.08
1	2	B	16064	0.08
2	1	A	15703	0.08
2	2	C	15703	0.08
3	1	A	15698	0.06
3	2	D	15698	0.06
4	1	B	15634	0.07
4	2	C	15634	0.07
5	1	B	15179	0.08
5	2	D	15179	0.08
6	1	C	15133	0.08
6	2	D	15133	0.08

LS精密化シェル

解像度: 2.16→2.216 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.271	244	-
R_work	0.271	4449	-
all	-	4693	-
obs	-	-	93.5 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.2726	-0.0857	-0.5826	0.6341	0.1433	1.0206	0.0406	0.0228	-0.0814	0.0766	-0.0592	-0.0448	-0.0238	0.0247	0.0185	0.0124	-0.0017	-0.0087	0.0667	0.0262	0.2462	1.073	-16.398	6.627
2	1.44	0.1931	-0.5625	2.1723	-1.7525	3.5533	-0.0949	-0.0791	-0.0593	0.4391	-0.1658	-0.0227	-0.3165	-0.0394	0.2607	0.1062	-0.0206	0.014	0.0499	-0.0219	0.1475	-19.288	-20.211	24.064
3	3.5709	-0.6494	-0.1831	1.5474	-1.986	6.3956	-0.1092	-0.0327	0.1797	0.6238	0.0368	-0.0447	-1.0241	-0.3062	0.0724	0.2684	0.0292	-0.0229	0.0241	-0.0231	0.0883	-20.477	-11.18	23.723
4	1.1428	-0.9197	-2.0505	8.3219	3.7389	4.3696	0.0032	0.2273	0.0311	0.0519	0.047	0.0157	-0.0048	-0.2469	-0.0502	0.0097	-0.0127	-0.0305	0.1387	0.0238	0.1306	-11.491	-14.522	3.805
5	1.0485	0.1298	-0.5574	0.3717	-0.1626	0.63	0.0316	0.007	-0.1109	-0.0577	-0.0549	0.0279	-0.0216	-0.0369	0.0233	0.0133	0.0091	-0.0117	0.0875	-0.0031	0.2402	25.707	-15.015	-4.88
6	2.9634	1.5768	-0.3368	1.2376	-1.1165	7.14	0.1094	0.0841	0.0219	-0.269	0.0476	0.0958	0.2512	-0.1311	-0.1571	0.3226	0.0191	-0.0628	0.1859	-0.0466	0.1824	34.595	-26.1	-26.985
7	1.2902	0.1862	0.0066	2.4751	0.9908	3.3923	-0.0506	0.1571	-0.1033	-0.3911	-0.0142	-0.0388	-0.1907	0.3155	0.0648	0.0647	0.0003	0.0241	0.1391	0.0001	0.1629	49.067	-17.711	-18.939
8	2.5539	0.3402	-1.4094	2.0241	0.838	3.9659	0.1068	-0.1033	0.1541	-0.412	-0.0444	0.1057	-0.7313	0.1874	-0.0624	0.1781	-0.0223	-0.0311	0.0319	0.019	0.158	42.655	-9.627	-14.369
9	1.6623	0.2101	-0.2734	1.7097	-0.5747	1.2205	0.1058	0.0005	0.1279	0.1551	-0.0037	0.1537	-0.154	-0.0336	-0.1021	0.0538	-0.0053	0.0872	0.0037	-0.0186	0.1758	4.752	15.245	10.956
10	2.5442	-1.1778	-1.2357	1.478	-0.1587	1.2893	0.1921	-0.0094	0.0355	0.1012	-0.0702	0.2146	-0.2337	-0.021	-0.1219	0.153	-0.0192	0.0928	0.0692	-0.0903	0.1973	-7.231	19.32	22.937
11	3.9086	-2.2138	1.3623	3.3667	-0.1757	1.9003	0.0147	-0.4354	-0.2763	0.197	0.1302	0.5153	0.0016	-0.128	-0.1449	0.1343	-0.0571	0.1702	0.077	-0.0466	0.25	-16.07	17.149	33.91
12	3.1522	-1.9461	0.3617	1.6095	-0.1207	0.7111	0.1655	-0.1989	-0.516	-0.0391	0.0104	0.4561	-0.0071	0.0996	-0.1758	0.175	-0.0409	0.0973	0.0805	-0.0507	0.2612	-11.622	12.181	28.87
13	1.2891	-0.3295	-0.3694	1.2937	-0.0792	1.5113	0.0984	-0.0645	0.1526	0.0637	-0.0318	-0.0666	-0.0815	0.0501	-0.0666	0.026	-0.0072	0.0538	0.006	0.0009	0.1939	21.302	17.747	-4.184
14	4.2238	-0.641	-0.653	1.9392	1.0711	1.8712	0.2959	0.2389	-0.1203	-0.0265	-0.1013	-0.074	-0.0114	0.0006	-0.1946	0.1295	0.0067	0.0164	0.0437	0.04	0.1742	28.442	16.47	-15.68
15	3.5861	3.0994	1.3433	4.1441	3.4961	6.866	0.421	0.015	-0.1634	0.1049	-0.0639	-0.563	-0.2031	0.3542	-0.357	0.1005	0.0425	0.0528	0.1706	0.0023	0.3859	46.632	20.914	-17.455
16	4.8057	0.9567	0.6342	1.4669	1.1303	1.9143	0.2252	0.6918	-0.1549	-0.0687	0.1722	-0.3616	-0.0681	0.3139	-0.3974	0.0612	0.0501	0.0779	0.1617	-0.0001	0.2205	38.873	18.551	-22.617

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	A	3 - 129
2	X-RAY DIFFRACTION	2	A	130 - 244
3	X-RAY DIFFRACTION	3	A	245 - 286
4	X-RAY DIFFRACTION	4	A	287 - 300
5	X-RAY DIFFRACTION	5	B	3 - 147
6	X-RAY DIFFRACTION	6	B	148 - 176
7	X-RAY DIFFRACTION	7	B	177 - 245
8	X-RAY DIFFRACTION	8	B	246 - 300
9	X-RAY DIFFRACTION	9	C	4 - 98
10	X-RAY DIFFRACTION	10	C	99 - 183
11	X-RAY DIFFRACTION	11	C	184 - 237
12	X-RAY DIFFRACTION	12	C	238 - 298
13	X-RAY DIFFRACTION	13	D	3 - 115
14	X-RAY DIFFRACTION	14	D	116 - 145
15	X-RAY DIFFRACTION	15	D	154 - 188
16	X-RAY DIFFRACTION	16	D	189 - 300

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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