antibiotic catabolic process / beta-lactamase activity / Β-ラクタマーゼ / outer membrane-bounded periplasmic space / response to antibiotic / metal ion binding 類似検索 - 分子機能
Beta-lactamase, class-C active site / Beta-lactamase class-C active site. / Beta-lactamase-related / Β-ラクタマーゼ / Β-ラクタマーゼ / DD-peptidase/beta-lactamase superfamily / Beta-lactamase/transpeptidase-like / 3-Layer(aba) Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性
ChemComp-AZR / 2-({[(1Z)-1-(2-amino-1,3-thiazol-4-yl)-2-oxo-2-{[(2S,3S)-1-oxo-3-(sulfoamino)butan-2-yl]amino}ethylidene]amino}oxy)-2-methylpropanoicacid / AZTREONAM, open form / アズトレオナム
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長
波長: 1 Å / 相対比: 1
反射
解像度: 1.9→60.95 Å / Num. obs: 27737 / % possible obs: 99.36 % / 冗長度: 6.77 % / Rmerge(I) obs: 0.079 / Net I/σ(I): 7.75
-
解析
ソフトウェア
名称: REFMAC / バージョン: 5.8.0069 / 分類: 精密化
精密化
解像度: 1.9→29.72 Å / Cor.coef. Fo:Fc: 0.95 / Cor.coef. Fo:Fc free: 0.927 / SU B: 3.008 / SU ML: 0.088 / 交差検証法: THROUGHOUT / ESU R: 0.148 / ESU R Free: 0.136 / 立体化学のターゲット値: MAXIMUM LIKELIHOOD / 詳細: HYDROGENS HAVE BEEN ADDED IN THE RIDING POSITIONS
Rfactor
反射数
%反射
Selection details
Rfree
0.21422
1348
4.9 %
RANDOM
Rwork
0.17524
-
-
-
obs
0.17716
26361
99.06 %
-
溶媒の処理
イオンプローブ半径: 0.8 Å / 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: BABINET MODEL WITH MASK