登録情報 データベース : PDB / ID : 4up8 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of Entamoeba histolytica lysyl-tRNA synthetase apo form 要素LYSINE--TRNA LIGASE 詳細 キーワード LIGASE / AMINOACYLATION機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
lysine-tRNA ligase / lysine-tRNA ligase activity / lysyl-tRNA aminoacylation / tRNA binding / ATP binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 Lysine-tRNA ligase, class II, N-terminal / Lysine-tRNA ligase, class II / Lysyl-tRNA synthetase, class II, C-terminal / tRNA-binding domain / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / Putative tRNA binding domain / tRNA-binding domain profile. / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain ... Lysine-tRNA ligase, class II, N-terminal / Lysine-tRNA ligase, class II / Lysyl-tRNA synthetase, class II, C-terminal / tRNA-binding domain / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II (D/K/N) / tRNA synthetases class II (D, K and N) / Putative tRNA binding domain / tRNA-binding domain profile. / OB-fold nucleic acid binding domain, AA-tRNA synthetase-type / OB-fold nucleic acid binding domain / Bira Bifunctional Protein; Domain 2 / BirA Bifunctional Protein; domain 2 / Aminoacyl-tRNA synthetase, class II / Aminoacyl-transfer RNA synthetases class-II family profile. / Class II Aminoacyl-tRNA synthetase/Biotinyl protein ligase (BPL) and lipoyl protein ligase (LPL) / Nucleic acid-binding proteins / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Nucleic acid-binding, OB-fold / Beta Barrel / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性生物種 ENTAMOEBA HISTOLYTICA (赤痢アメーバ)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.896 Å 詳細データ登録者 Bonnefond, L. / Nureki, O. 引用ジャーナル : FEBS Lett. / 年 : 2014タイトル : Crystal Structures of Entamoeba Histolytica Lysyl-tRNA Synthetase Reveal Conformational Changes Upon Lysine Binding and a Specific Helix Bundle Domain.著者 : Bonnefond, L. / Castro De Moura, M. / Ribas De Pouplana, L. / Nureki, O. 履歴 登録 2014年6月14日 登録サイト : PDBE / 処理サイト : PDBE改定 1.0 2014年10月29日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年11月5日 Group : Database references / Refinement description改定 1.2 2014年11月26日 Group : Database references改定 1.3 2014年12月10日 Group : Database references改定 1.4 2015年1月21日 Group : Atomic model改定 1.5 2024年1月10日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Other / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf
すべて表示 表示を減らす Remark 700 SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW ... SHEET DETERMINATION METHOD: DSSP THE SHEETS PRESENTED AS "AA" IN EACH CHAIN ON SHEET RECORDS BELOW IS ACTUALLY AN 6-STRANDED BARREL THIS IS REPRESENTED BY A 7-STRANDED SHEET IN WHICH THE FIRST AND LAST STRANDS ARE IDENTICAL.