登録情報 | データベース: PDB / ID: 4qjv |
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タイトル | The X-ray crystal structure of Rpo3/Rpo11 heterodimer of euryarchaeal RNA polymerase from Thermococcus kodakarensis |
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要素 | - DNA-directed RNA polymerase subunit D
- DNA-directed RNA polymerase subunit L
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キーワード | TRANSFERASE / Transcription / RNA polymerase |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
DNA-directed RNA polymerase complex / RNA polymerase II activity / DNA-directed RNA polymerase / protein dimerization activity / DNA binding / cytoplasm類似検索 - 分子機能 Alpha-Beta Plaits - #3110 / DNA-directed RNA polymerase, insert domain / RNA polymerase, RBP11-like subunit / RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2 / Gyrase A; domain 2 / DNA-directed RNA polymerase Rpb11, 13-16kDa subunit, conserved site / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo11 / RNA polymerases L / 13 to 16 Kd subunits signature. / DNA-directed RNA polymerase, 30-40kDa subunit, conserved site / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo3/Rpb3/RPAC1 ...Alpha-Beta Plaits - #3110 / DNA-directed RNA polymerase, insert domain / RNA polymerase, RBP11-like subunit / RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2 / Gyrase A; domain 2 / DNA-directed RNA polymerase Rpb11, 13-16kDa subunit, conserved site / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo11 / RNA polymerases L / 13 to 16 Kd subunits signature. / DNA-directed RNA polymerase, 30-40kDa subunit, conserved site / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo3/Rpb3/RPAC1 / RNA polymerases D / 30 to 40 Kd subunits signature. / DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like dimerisation domain / RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain / Beta Complex / DNA-directed RNA polymerase, insert domain / DNA-directed RNA polymerase, RpoA/D/Rpb3-type / RNA polymerase Rpb3/RpoA insert domain / RNA polymerase Rpb3/Rpb11 dimerisation domain / RNA polymerases D / DNA-directed RNA polymerase, insert domain superfamily / RNA polymerase, RBP11-like subunit / Alpha-Beta Plaits / 2-Layer Sandwich / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 PHOSPHATE ION / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo11 / DNA-directed RNA polymerase subunit Rpo3類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | ![](img/tx_archaea.gif) Thermococcus kodakarensis (古細菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 多波長異常分散 / 解像度: 1.601 Å |
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データ登録者 | Hirata, A. / Murakami, K.S. |
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引用 | ジャーナル: Nat Commun / 年: 2014 タイトル: The X-ray crystal structure of the euryarchaeal RNA polymerase in an open-clamp configuration 著者: Jun, S.H. / Hirata, A. / Kanai, T. / Santangelo, T.J. / Imanaka, T. / Murakami, K.S. |
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履歴 | 登録 | 2014年6月5日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年10月8日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年12月10日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2024年3月20日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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