登録情報 データベース : PDB / ID : 4q10 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル The catalytic core of Rad2 in complex with DNA substrate (complex IV) 要素DNA (5'-D(*TP*TP*TP*TP*CP*TP*GP*AP*GP*AP*CP*AP*AP*GP*GP*GP*AP*GP*CP*TP*TP*TP*T)-3')DNA (5'-D(*TP*TP*TP*TP*GP*CP*TP*CP*CP*CP*TP*TP*GP*TP*CP*TP*CP*AP*GP*TP*TP*TP*T)-3')DNA repair protein RAD2 詳細キーワード Hydrolase/DNA / ba Rossmann-like / DNA repair / TFIIH / nucleus / Hydrolase-DNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
nucleotide-excision repair factor 3 complex / single-stranded DNA endodeoxyribonuclease activity / Dual incision in TC-NER / DNA endonuclease activity / nucleotide-excision repair / single-stranded DNA binding / transcription by RNA polymerase II / 加水分解酵素; エステル加水分解酵素 / nucleus / metal ion binding 類似検索 - 分子機能 XPG/Rad2 endonuclease, eukaryotes / XPG protein signature 2. / XPG conserved site / XPG protein signature 1. / XPG/Rad2 endonuclease / XPG, N-terminal / XPG-I domain / XPG N-terminal domain / XPG I-region / Xeroderma pigmentosum G I-region ... XPG/Rad2 endonuclease, eukaryotes / XPG protein signature 2. / XPG conserved site / XPG protein signature 1. / XPG/Rad2 endonuclease / XPG, N-terminal / XPG-I domain / XPG N-terminal domain / XPG I-region / Xeroderma pigmentosum G I-region / Xeroderma pigmentosum G N-region / Helix-hairpin-helix motif, class 2 / Helix-hairpin-helix class 2 (Pol1 family) motifs / 5'-3' exonuclease, C-terminal domain superfamily / PIN-like domain superfamily 類似検索 - ドメイン・相同性 : / DNA / DNA (> 10) / DNA repair protein RAD2 類似検索 - 構成要素生物種 Saccharomyces cerevisiae (パン酵母)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 2.7 Å 詳細データ登録者 Mietus, M. / Nowak, E. / Jaciuk, M. / Kustosz, P. / Nowotny, M. 引用ジャーナル : Nucleic Acids Res. / 年 : 2014タイトル : Crystal structure of the catalytic core of Rad2: insights into the mechanism of substrate binding.著者 : Mietus, M. / Nowak, E. / Jaciuk, M. / Kustosz, P. / Studnicka, J. / Nowotny, M. 履歴 登録 2014年4月2日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2014年8月27日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年9月17日 Group : Structure summary改定 1.2 2014年10月1日 Group : Database references改定 1.3 2017年8月9日 Group : Refinement description / Source and taxonomy / カテゴリ : entity_src_gen / software改定 1.4 2017年11月22日 Group : Refinement description / カテゴリ : software / Item : _software.name改定 1.5 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_site Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
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