PDB-4pc3: Elongation factor Tu:Ts complex with partially bound GDP

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4pc3

タイトル

Elongation factor Tu:Ts complex with partially bound GDP

要素

Elongation factor Ts
Elongation factor Tu 1

キーワード

TRANSLATION / G:GEF:GDP complex / Elongation factor / Protein synthesis

機能・相同性

機能・相同性情報

guanyl-nucleotide exchange factor complex / translational elongation / guanosine tetraphosphate binding / translation elongation factor activity / guanyl-nucleotide exchange factor activity / response to antibiotic / GTPase activity / GTP binding / RNA binding / zinc ion binding ...
類似検索 - 分子機能

GTP Cyclohydrolase I; Chain A, domain 1 - #20 / Elongation factor Ts, dimerisation domain / Translation elongation factor EFTs/EF1B / Translation elongation factor EFTs/EF1B, dimerisation / Translation elongation factor Ts, conserved site / Elongation factor Ts, dimerisation domain superfamily / Elongation factor TS / Elongation factor Ts signature 1. / Elongation factor Ts signature 2. / : ...
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Escherichia coli (大腸菌)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.8313 Å

データ登録者

Thirup, S.S.

引用

ジャーナル: J.Struct.Biol. / 年: 2015
タイトル: Structural outline of the detailed mechanism for elongation factor Ts-mediated guanine nucleotide exchange on elongation factor Tu.
著者: Thirup, S.S. / Van, L.B. / Nielsen, T.K. / Knudsen, C.R.

履歴

登録	2014年4月14日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2015年5月6日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2015年7月1日	Group: Database references
改定 1.2	2015年7月15日	Group: Database references
改定 1.3	2018年3月7日	Group: Advisory / Database references ...Advisory / Database references / Derived calculations / Source and taxonomy カテゴリ: citation / entity_src_gen ...citation / entity_src_gen / pdbx_struct_oper_list / pdbx_validate_close_contact Item: _citation.journal_id_CSD / _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag / _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation
改定 1.4	2023年9月27日	Group: Data collection / Database references / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

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PDB形式	pdb4pc3.ent.gz	646.7 KB	表示	PDB形式
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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4pc3_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4pc3_full_validation.pdf.gz	1.3 MB	表示
XML形式データ	4pc3_validation.xml.gz	57.2 KB	表示
CIF形式データ	4pc3_validation.cif.gz	86.5 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pc/4pc3 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/pc/4pc3	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4pc1SC 4pc2C 4pc6C 4pc7C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4pc6-2 4pc1-1 4pc2-2 4pc6-1 4pc1-2 4pc2-1 1xmx-2 1iye-d 2ej3-d 1iyd-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#81 - 2006年9月伸長因子 (Elongation Factors) 類似性 (23) #121 - 2010年1月 70Sリボソーム (70S Ribosomes) 類似性 (13) #157 - 2013年1月転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA) 類似性 (13) #104 - 2008年8月セレノシステイン合成酵素 (Selenocysteine Synthase) 類似性 (6) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (5) #60 - 2004年12月ユビキチン (Ubiquitin) 類似性 (1)

PDBのページ

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wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#81 - 2006年9月
伸長因子 (Elongation Factors)
類似性 (23)
#121 - 2010年1月
70Sリボソーム (70S Ribosomes)
類似性 (13)
#157 - 2013年1月
転移伝令RNA (Transfer-Messenger RNA)
類似性 (13)
#104 - 2008年8月
セレノシステイン合成酵素 (Selenocysteine Synthase)
類似性 (6)
#245 - 2020年5月
スプライソソーム (Spliceosomes)
類似性 (5)
#60 - 2004年12月
ユビキチン (Ubiquitin)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Elongation factor Tu 1

C: Elongation factor Ts

B: Elongation factor Tu 1

D: Elongation factor Ts

ヘテロ分子

149 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Elongation factor Tu 1

C: Elongation factor Ts

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
74.3 kDa, 2 ポリマー
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2

B: Elongation factor Tu 1

D: Elongation factor Ts

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
74.4 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

単位格子

Length a, b, c (Å)	74.000, 108.920, 194.770
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	Elongation factor Tu 1 / EF-Tu 1 / P-43 分子量: 43340.465 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 遺伝子: tufA, b3339, JW3301 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0CE47
#2: タンパク質	Elongation factor Ts / EF-Ts 分子量: 30332.795 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Escherichia coli (大腸菌) / 株: K12 / 遺伝子: tsf, b0170, JW0165 / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 参照: UniProt: P0A6P1
#3: 化合物	ChemComp-GDP / GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE / GDP タイプ: RNA linking / 分子量: 443.201 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₀H₁₅N₅O₁₁P₂ / コメント: GDP, エネルギー貯蔵分子*YM
#4: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 5 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 1158 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.66 Å³/Da / 溶媒含有率: 53.74 %
結晶化	温度: 292 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 100 mM MES, 15% PEG 6000, 2.5% glucose, 76mM NH4 CH3COO, 100mM NH4-citrate, 5mM MgCl2, 1mM GDP

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: MAX II / ビームライン: I711 / 波長: 1.033 Å
検出器	タイプ: MAR CCD 165 mm / 検出器: CCD / 日付: 2003年12月3日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.033 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.83→58.92 Å / Num. obs: 136637 / % possible obs: 98.5 % / 冗長度: 6.5 % / R_merge(I) obs: 0.052 / Net I/σ(I): 16.3
反射シェル	解像度: 1.83→1.95 Å / 冗長度: 4.9 % / R_merge(I) obs: 0.369 / Mean I/σ(I) obs: 3.9 / % possible all: 98.2

-
解析

ソフトウェア

名称: PHENIX / バージョン: (phenix.refine: dev_1702) / 分類: 精密化

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: 4PC1

4pc1

解像度: 1.8313→58.92 Å / SU ML: 0.18 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 1.99 / 位相誤差: 19.15 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1985	6098	4.51 %	random
R_work	0.1593	-	-	-
obs	0.1611	135282	97.39 %	-

溶媒の処理

減衰半径: 1 Å / VDWプローブ半径: 1 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.8313→58.92 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	9859	0	86	1158	11103

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.012	10301
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.276	13930
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	13.877	3893
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.054	1591
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.007	1807

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.8313-1.8522	0.3057	178	0.2704	3569	X-RAY DIFFRACTION	81
1.8522-1.874	0.3135	179	0.2547	4274	X-RAY DIFFRACTION	97
1.874-1.8968	0.2749	181	0.2327	4279	X-RAY DIFFRACTION	97
1.8968-1.9208	0.2606	175	0.2182	4213	X-RAY DIFFRACTION	97
1.9208-1.9461	0.2411	182	0.2075	4311	X-RAY DIFFRACTION	97
1.9461-1.9728	0.2267	179	0.207	4241	X-RAY DIFFRACTION	97
1.9728-2.0009	0.2558	180	0.2035	4284	X-RAY DIFFRACTION	97
2.0009-2.0308	0.2179	173	0.2065	4240	X-RAY DIFFRACTION	97
2.0308-2.0625	0.2141	179	0.1911	4271	X-RAY DIFFRACTION	97
2.0625-2.0964	0.2284	177	0.184	4253	X-RAY DIFFRACTION	96
2.0964-2.1325	0.2089	174	0.179	4227	X-RAY DIFFRACTION	96
2.1325-2.1713	0.2057	180	0.1806	4251	X-RAY DIFFRACTION	96
2.1713-2.2131	0.1946	171	0.1708	4245	X-RAY DIFFRACTION	96
2.2131-2.2582	0.2253	188	0.1611	4206	X-RAY DIFFRACTION	96
2.2582-2.3073	0.185	195	0.1632	4232	X-RAY DIFFRACTION	96
2.3073-2.361	0.2003	174	0.169	4193	X-RAY DIFFRACTION	95
2.361-2.42	0.2119	213	0.1696	4196	X-RAY DIFFRACTION	96
2.42-2.4855	0.2079	235	0.17	4382	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4855-2.5586	0.2108	278	0.1607	4342	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5586-2.6412	0.2012	273	0.1601	4366	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6412-2.7356	0.2151	243	0.162	4385	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7356-2.8451	0.2056	272	0.1613	4351	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8451-2.9746	0.2237	242	0.1677	4407	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9746-3.1314	0.2113	210	0.1647	4410	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1314-3.3276	0.1879	303	0.1539	4337	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3276-3.5845	0.2	274	0.1463	4418	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5845-3.9452	0.1889	205	0.1429	4494	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9452-4.5159	0.1521	177	0.1245	4536	X-RAY DIFFRACTION	100
4.5159-5.6888	0.1574	151	0.1287	4617	X-RAY DIFFRACTION	100
5.6888-58.9502	0.1723	157	0.1609	4654	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	4.6776	5.3601	4.7611	7.9781	5.5881	4.898	-0.1565	0.4885	0.123	-0.4654	0.8201	-0.61	-0.1352	1.3836	-0.6082	0.4358	0.0502	0.0148	0.6371	-0.0717	0.4415	18.5579	58.0748	71.5489
2	6.6721	4.8421	4.3696	5.0803	3.1361	5.1279	-0.1646	0.7684	0.2274	-0.3937	0.5316	-0.7753	-0.7418	0.6409	-0.2861	0.6009	-0.2667	0.0288	0.521	-0.0954	0.5865	23.7294	68.4113	71.0199
3	3.4673	0.7686	0.5061	5.3006	1.6913	3.5848	-0.2127	-0.0486	0.3588	0.0343	0.3102	-0.0398	-0.3939	0.0227	-0.0934	0.4216	0.0148	-0.0145	0.3777	-0.0027	0.3284	12.7427	60.1134	73.4761
4	6.2684	-2.3749	2.8388	6.8352	-3.8709	3.2032	-0.4063	-0.3794	0.632	0.613	0.17	-0.9616	-0.5364	0.104	0.3042	0.3848	0.1178	-0.0678	0.5496	-0.1712	0.3792	33.3224	45.3814	101.5942
5	1.1266	0.0619	-0.2919	1.5549	1.2292	2.8062	-0.0731	-0.3529	0.1654	0.0401	-0.0346	0.0093	-0.12	-0.0634	0.1485	0.189	0.0746	-0.0303	0.3275	-0.1094	0.2516	27.0872	35.5103	93.2231
6	5.087	-2.5359	3.9446	7.2734	-1.8557	5.4551	-0.3374	-0.8358	-0.0563	0.4035	0.6306	0.2442	-0.6695	-1.5828	-0.2499	0.4799	0.1618	-0.0322	0.7445	0.1736	0.4245	-7.0573	61.9533	57.4995
7	9.8562	-7.7895	-1.5068	9.1246	0.6394	1.234	0.1512	-0.1539	-0.7023	-0.5942	0.1435	0.7482	0.0542	-0.54	-0.2861	0.4335	-0.0107	-0.0659	0.4206	0.1668	0.3711	-0.9364	55.5042	48.8984
8	2.1983	1.2718	0.3093	6.3193	0.4711	1.6929	-0.1057	0.1403	0.1196	0.2303	0.1081	0.1499	-0.1487	-0.016	-0.0094	0.1365	-0.0112	-0.0114	0.1494	0.0485	0.1678	7.135	34.899	56.1218
9	1.776	-1.1054	0.7141	6.3744	-1.3135	2.2414	-0.0918	0.1	0.0471	-0.028	0.1645	0.1611	-0.1659	-0.1427	-0.0664	0.1013	-0.046	0.0293	0.2127	0.0188	0.1746	8.0849	32.4452	54.2187
10	8.1147	-0.0444	-2.2828	0.8699	0.2542	2.1631	0.0237	0.3663	-0.3245	-0.1637	-0.0905	-0.0583	0.0783	-0.0124	0.058	0.2703	0.0282	-0.0351	0.1484	-0.0061	0.2183	30.821	16.9833	54.2901
11	9.2603	-3.9202	0.055	5.4947	-1.3862	1.4295	0.2378	0.6377	-0.0243	-0.3812	-0.1215	-0.092	0.2795	0.0321	-0.0391	0.3742	0.0071	-0.0235	0.354	-0.0716	0.2613	42.4093	12.2897	53.434
12	2.7781	0.5777	0.3179	1.3432	0.4717	2.5968	0.0872	-0.1077	-0.4784	0.0103	-0.0325	0.0499	0.5058	0.0373	-0.0243	0.1843	-0.0257	-0.0429	0.1338	-0.0205	0.2386	20.5483	12.8984	62.0652
13	3.5256	3.8363	2.1882	4.1446	2.4185	1.4395	-0.0631	-0.1061	0.2953	-0.5206	0.5988	-0.86	-0.6165	0.6198	-0.3807	0.5831	-0.1944	0.2224	0.4558	-0.1392	0.6018	26.2655	51.7241	60.5517
14	7.1241	0.8285	-1.5311	0.5667	-1.3444	3.2342	0.2656	-1.086	-0.604	1.5654	-0.0664	1.9065	0.5912	-1.9904	-0.2789	0.7092	-0.1807	0.2454	0.8104	0.1478	0.7678	30.7895	-17.4876	87.7901
15	9.4238	1.867	-2.0088	2.9081	-1.242	2.0619	0.2077	0.4271	0.4487	-0.6453	0.2669	-0.0322	0.1189	-0.1633	-0.4801	0.5413	-0.0722	-0.0054	0.4099	0.0367	0.4589	49.0271	-12.6176	74.5478
16	8.0906	5.4913	-5.187	4.1753	-4.9399	8.1956	0.0042	0.3925	-0.4501	-0.3289	-0.026	0.0375	0.8335	-0.1004	0.1353	0.6684	-0.191	-0.0557	0.4462	-0.0435	0.5783	39.7168	-23.5231	74.0771
17	3.9834	1.37	-0.824	4.4686	-0.7325	2.3871	0.0199	-0.2912	-0.57	0.1876	-0.0624	-0.0447	0.4752	0.033	0.0384	0.5452	-0.091	0.0136	0.3679	0.0205	0.4318	49.064	-15.5749	80.3557
18	2.9237	0.6836	0.0998	3.0115	-0.2028	1.5143	0.2839	-1.0737	-0.21	0.6701	-0.2646	0.2756	0.0513	-0.2306	-0.0182	0.2819	-0.1139	0.0323	0.5776	0.0413	0.1989	29.5936	7.5268	95.2438
19	5.5092	-3.3488	0.1612	7.2676	0.0707	3.639	-0.4997	-0.4035	-1.5638	0.2296	0.0936	-0.2141	1.335	1.2327	0.1659	0.6877	0.2706	0.0832	0.6161	0.0269	0.9234	73.5114	-21.3146	71.6214
20	8.329	-2.3789	4.9757	5.3486	-4.2434	6.6685	0.2002	-0.1607	-0.3734	-0.2591	-0.1085	-0.7771	0.6431	0.4721	-0.1034	0.3855	0.0375	0.0458	0.3489	-0.1377	0.4859	72.0752	-13.6937	62.2782
21	2.8652	1.5438	-0.2486	4.2439	-0.5424	1.2979	-0.0527	0.0034	0.099	0.1891	0.043	0.0896	-0.0053	0.1016	0.0075	0.2011	-0.0213	0.0267	0.1672	-0.058	0.1543	63.1274	8.4639	66.854
22	1.9217	-1.2824	-0.3707	5.2097	1.1135	1.3241	-0.1133	0.0036	0.088	-0.09	0.1709	-0.304	0.03	0.1308	-0.0369	0.1609	-0.0562	0.0021	0.1782	-0.0376	0.1449	62.885	11.0207	64.5477
23	5.0872	0.4584	2.2202	1.1025	-0.2582	3.5131	-0.1632	0.3704	0.6119	-0.0728	-0.0777	-0.0153	-0.2508	0.1016	0.1878	0.2476	0.0234	0.0275	0.1044	-0.0023	0.2577	43.1749	26.8671	57.0031
24	9.431	0.4896	5.5133	4.9193	1.7018	4.2575	0.193	0.0493	0.4964	-0.4258	-0.0616	0.0134	0.0277	-0.0289	-0.0833	0.3616	0.0123	0.0498	0.3823	0.0891	0.3659	30.3239	31.321	51.0062
25	0.8256	0.6759	-0.2923	2.0684	0.5644	2.3545	0.1058	0.0682	0.6463	0.0228	-0.1097	-0.1588	-0.5046	-0.2136	0.0501	0.2614	-0.0042	-0.0121	0.1144	-0.0395	0.3556	49.1841	30.6197	67.3065
26	5.8798	5.1461	-1.232	4.454	-1.1079	0.2462	-0.1524	-0.0842	-0.3388	-0.5774	0.4409	0.3474	0.7204	-1.0408	-0.0089	0.744	-0.3572	-0.1642	0.5678	0.1172	0.4745	42.2652	-6.7539	63.9549

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 8 through 23 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 24 through 41 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 65 through 198 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 199 through 230 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 231 through 393 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'C' and (resid 2 through 32 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'C' and (resid 33 through 51 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'C' and (resid 52 through 106 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'C' and (resid 107 through 161 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'C' and (resid 162 through 207 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 208 through 225 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 226 through 259 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 260 through 280 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 8 through 12 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 13 through 23 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'B' and (resid 24 through 41 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'B' and (resid 56 through 198 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'B' and (resid 199 through 393 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 2 through 32 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 33 through 51 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'D' and (resid 52 through 106 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'D' and (resid 107 through 161 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'D' and (resid 162 through 204 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'D' and (resid 205 through 225 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'D' and (resid 226 through 259 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 260 through 280 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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新型コロナ情報

URL: https://pdbjlvh1.pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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