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データを開く
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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4ncd | ||||||
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タイトル | Crystal Structure of Class 5 Fimbriae Chaperone CfaA | ||||||
![]() | Gram-negative pili assembly chaperone, N-terminal domain protein | ||||||
![]() | CHAPERONE / immunoglobulin fold | ||||||
機能・相同性 | Immunoglobulin-like - #3970 / Immunoglobulins / Immunoglobulin-like / Sandwich / Mainly Beta / : ![]() | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Bao, R. / Xia, D. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Structure of CfaA Suggests a New Family of Chaperones Essential for Assembly of Class 5 Fimbriae. 著者: Bao, R. / Fordyce, A. / Chen, Y.X. / McVeigh, A. / Savarino, S.J. / Xia, D. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 54.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 41.8 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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2 |
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 28329.703 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() ![]() ![]() |
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#2: 水 | ChemComp-HOH / |
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.06 Å3/Da / 溶媒含有率: 40.16 % |
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結晶化 | 温度: 293 K / 手法: 蒸発脱水法 / pH: 5.3 詳細: 22% PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M MES pH 5.3, EVAPORATION, temperature 293K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: MARMOSAIC 225 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2010年8月6日 |
放射 | モノクロメーター: APS BM22 / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.54178 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.03→50 Å / Num. obs: 15399 / % possible obs: 97.4 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -1 |
反射 シェル | 解像度: 2.03→2.08 Å / % possible all: 72.9 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.037→39.715 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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