PDB-4n61: Crystal structure of hemagglutinin from an H7N9 influenza virus i...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4n61

タイトル

Crystal structure of hemagglutinin from an H7N9 influenza virus in complex with LSTa, extended soaking

要素

(Hemagglutinin ...) x 2

キーワード

VIRAL PROTEIN / viral envelope protein / hemagglutinin / viral fusion protein

機能・相同性

機能・相同性情報

viral budding from plasma membrane / clathrin-dependent endocytosis of virus by host cell / host cell surface receptor binding / fusion of virus membrane with host plasma membrane / fusion of virus membrane with host endosome membrane / viral envelope / virion attachment to host cell / host cell plasma membrane / virion membrane / metal ion binding / membrane
類似検索 - 分子機能

生物種

Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.6023 Å

データ登録者

Xu, R. / Wilson, I.A.

引用

ジャーナル: Science / 年: 2013
タイトル: Preferential recognition of avian-like receptors in human influenza A H7N9 viruses.
著者: Xu, R. / de Vries, R.P. / Zhu, X. / Nycholat, C.M. / McBride, R. / Yu, W. / Paulson, J.C. / Wilson, I.A.

履歴

登録	2013年10月11日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年12月18日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2017年11月15日	Group: Advisory / Refinement description / カテゴリ: pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / software / Item: _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Advisory / Atomic model ...Advisory / Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / chem_comp ...atom_site / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms / pdbx_validate_close_contact / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id / _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id / _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 / _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年10月30日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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検証レポート

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文書・詳細版	4n61_full_validation.pdf.gz	1.4 MB	表示
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アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n6/4n61 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/n6/4n61	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4n5jC 4n5kC 4n60C 4n62C 4n63C 4n64C C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	6idz-1 4kom-1 4n5k-1 4lkg-2 4n60-1 4ln8-5 4lcx-d 4ln8-1 4dj7-d 5xl1-1 4lkk-1 5vu4-d 6id2-2 5t6s-1 4n64-1 6idd-1 6icx-1 4dj6-d 6id8-1 6id9-1 Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#76 - 2006年4月赤血球凝集素 (Hemagglutinin) 類似性 (6) #170 - 2014年2月広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies) 類似性 (5) #113 - 2009年5月インフルエンザノイラミニダーゼ (Influenza Neuraminidase) 類似性 (1) #259 - 2021年7月人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science) 類似性 (5) #62 - 2005年2月主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex) 類似性 (5) #63 - 2005年3月 T細胞受容体 (T-Cell Receptor) 類似性 (5) #200 - 2016年8月正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses) 類似性 (1)

PDBのページ

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「今月の分子」の関連する項目

#76 - 2006年4月
赤血球凝集素 (Hemagglutinin)
類似性 (6)
#170 - 2014年2月
広域中和抗体 (Broadly Neutralizing Antibodies)
類似性 (5)
#113 - 2009年5月
インフルエンザノイラミニダーゼ (Influenza Neuraminidase)
類似性 (1)
#259 - 2021年7月
人工設計タンパク質と市民科学 (Designed Proteins and Citizen Science)
類似性 (5)
#62 - 2005年2月
主要組織適合性複合体 (Major Histocompatibility Complex)
類似性 (5)
#63 - 2005年3月
T細胞受容体 (T-Cell Receptor)
類似性 (5)
#200 - 2016年8月
正二十面体型ウイルスの準対称性 (Quasisymmetry in Icosahedral Viruses)
類似性 (1)

登録構造単位

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

113 kDa, 4 ポリマー
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1

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

A: Hemagglutinin HA1

B: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
171 kDa, 6 ポリマー
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2

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

C: Hemagglutinin HA1

D: Hemagglutinin HA2

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
168 kDa, 6 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	153.913, 153.913, 153.913
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	198
Space group name H-M	P2₁3

-
Hemagglutinin ... , 2種, 4分子 ACBD

#1: タンパク質	Hemagglutinin HA1 分子量: 34993.559 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) 株: A/Shanghai/2/2013 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFastbac-HT / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: R4NN21
#2: タンパク質	Hemagglutinin HA2 分子量: 20656.713 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現由来: (組換発現) Influenza A virus (A型インフルエンザウイルス) 株: A/Shanghai/2/2013 / 遺伝子: HA, hemagglutinin / プラスミド: pFastbac-HT / 発現宿主: Trichoplusia ni (イラクサキンウワバ) / 株 (発現宿主): Hi5 / 参照: UniProt: R4NN21

-
糖 , 4種, 5分子

#3: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#4: 多糖

N-acetyl-alpha-neuraminic acid-(2-3)-beta-D-galactopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 471.411 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca2-3DGalpb1-ROH	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,2,1/[a2112h-1b_1-5][Aad21122h-2a_2-6_5*NCC/3=O]/1-2/a3-b2	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[][D-1-deoxy-Galp]{[(3+2)][a-D-Neup5Ac]{}}	LINUCS	PDB-CARE

#5: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

#6: 糖

ChemComp-SIA / N-acetyl-alpha-neuraminic acid / N-acetylneuraminic acid / sialic acid / alpha-sialic acid / O-SIALIC ACID / N-アセチル-α-ノイラミン酸

タイプ: D-saccharide, alpha linking / 分子量: 309.270 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₁₁H₁₉NO₉

識別子	タイプ	プログラム
DNeup5Aca	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-a-D-neuraminic acid	COMMON NAME	GMML 1.0
a-D-Neup5Ac	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
Neu5Ac	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 1種, 52分子

#7: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 52 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.73 Å³/Da / 溶媒含有率: 54.94 %
結晶化	温度: 295.5 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8 詳細: 17-20% PEG3350, 0.2 M ammonium acetate, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K

-
データ収集

回折

平均測定温度: 110 K

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

APS

/ ビームライン: 23-ID-B / 波長: 1.0331 Å

検出器

タイプ: MARMOSAIC 300 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2013年6月16日 / 詳細: K-B pair of biomorph mirrors

放射

モノクロメーター: double crystal monochromator and K-B pair of biomorph mirrors for vertical and horizontal focusing
プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1.0331 Å / 相対比: 1

Reflection

冗長度: 6.3 % / 数: 234550 / R_merge(I) obs: 0.098 / Χ²: 1.02 / D res high: 2.6 Å / D res low: 50 Å / Num. obs: 37501 / % possible obs: 99.9

Diffraction reflection shell

最高解像度 (Å)	最低解像度 (Å)	% possible obs (%)	ID	R_merge(I) obs	Chi squared	Redundancy
5.6	50	99.5	1	0.062	0.944	6
4.45	5.6	100	1	0.082	0.961	6.2
3.88	4.45	100	1	0.084	1.01	6.3
3.53	3.88	100	1	0.11	0.993	6.3
3.28	3.53	100	1	0.142	1.011	6.3
3.08	3.28	100	1	0.189	1.094	6.3
2.93	3.08	100	1	0.29	1.085	6.3
2.8	2.93	100	1	0.412	1.052	6.3
2.69	2.8	100	1	0.668	1.004	6.3
2.6	2.69	100	1	0.94	1.098	6.3

反射

解像度: 2.6→50 Å / Num. obs: 37501 / % possible obs: 99.9 % / R_merge(I) obs: 0.098

-
位相決定

位相決定

手法:

分子置換

Phasing MR

R_factor: 36.04 / Model details: Phaser MODE: MR_AUTO

	最高解像度	最低解像度
Rotation	2.6 Å	48.67 Å
Translation	2.6 Å	48.67 Å

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
DENZO		データ削減
SCALEPACK		データスケーリング
PHASER	2.1.4	位相決定
PHENIX	1.8.2_1309	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
Blu-Ice		データ収集

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2.6023→48.672 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 1 / SU ML: 0.39 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 28.34 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2621	1873	5 %
R_work	0.2156	-	-
obs	0.218	37471	99.94 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 105.3024 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.6023→48.672 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7600	0	108	52	7760

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.004	7865
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.818	10615
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	15.932	2917
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.035	1159
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.003	1398

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.6023-2.6727	0.425	127	0.3406	2729	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6727-2.7513	0.346	140	0.3141	2725	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7513-2.8401	0.3007	134	0.2768	2705	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8401-2.9416	0.2903	140	0.2625	2744	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9416-3.0594	0.3028	107	0.2568	2728	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0594-3.1986	0.2981	141	0.2625	2713	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1986-3.3672	0.2895	148	0.252	2727	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3672-3.5781	0.2774	136	0.2341	2736	X-RAY DIFFRACTION	100
3.5781-3.8543	0.2606	160	0.2163	2715	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8543-4.2419	0.2503	155	0.194	2726	X-RAY DIFFRACTION	100
4.2419-4.8553	0.2443	165	0.1701	2746	X-RAY DIFFRACTION	100
4.8553-6.1153	0.2336	159	0.196	2758	X-RAY DIFFRACTION	100
6.1153-48.6801	0.2457	161	0.1979	2846	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	8.0748	-5.1995	4.389	5.6568	-2.23	3.9845	-0.6129	-0.765	0.6556	0.6615	0.4122	-0.3526	-0.7009	-0.1881	0.2588	0.5653	-0.0508	-0.0381	0.4094	-0.0459	0.4104	-37.6611	-18.6691	40.7993
2	1.0302	-1.5441	2.1241	2.004	-3.0022	3.8065	-0.5859	0.2597	0.4051	0.892	-0.2901	-0.6585	-0.9603	0.6698	0.8641	0.7175	-0.1188	-0.2057	0.5167	0.184	0.6974	-51.7282	11.8026	3.9572
3	4.2979	-1.7504	-0.185	2.7525	-1.5355	5.5517	-0.2845	0.7752	-0.1741	0.5978	-0.0909	-0.0616	-0.0859	-0.2752	0.3667	0.5837	-0.1537	0.0313	0.4698	0.0646	0.4956	-62.3601	10.7681	-9.9534
4	6.313	-4.3939	-1.4038	6.8275	-0.3361	5.124	-0.2878	1.4604	-0.1379	0.442	-0.1194	0.3048	-0.1283	-0.6533	0.3577	0.4469	-0.1565	0.0839	0.7965	0.0693	0.4103	-71.0162	17.3194	-14.7392
5	7.9545	-5.4785	-2.2839	5.6794	1.0059	2.2179	-0.6804	0.6335	0.1658	0.7009	0.508	-0.1508	-0.0508	-0.424	0.0392	0.5961	0.0061	0.0565	0.6411	0.0716	0.4662	-73.2648	17.0379	-4.2991
6	4.0166	-0.3959	0.0158	2.8737	-0.3134	3.0156	-0.2121	1.0238	-0.1298	-0.1494	-0.3757	-0.3213	0.5658	-0.0194	0.5601	0.4942	-0.1557	0.1727	0.6908	0.0152	0.6138	-62.0777	7.5988	-12.9876
7	2.9922	0.4835	0.3158	4.8666	-2.2463	4.5483	-0.4003	0.5709	1.0029	0.0002	-0.5092	-1.0308	-0.7297	0.7735	0.814	0.6259	-0.0841	-0.2138	0.5142	0.2312	0.7798	-47.0449	0.424	15.3812
8	2.5521	-2.3862	6.1385	5.616	-2.8333	5.9781	-0.6845	-1.7114	0.2782	0.8687	0.8493	-0.1117	-1.0345	-0.976	0.185	0.6612	0.0174	-0.079	0.7067	0.04	0.4309	-41.8713	-14.3484	37.5588
9	3.0576	-0.3745	3.6163	2.0367	3.6697	2.0174	-0.0798	-1.9348	0.5483	-0.2062	-0.4627	0.029	-0.3677	-1.3813	0.6221	0.7201	-0.0886	-0.2024	0.7057	-0.0006	0.4815	-30.1781	-26.8785	50.8695
10	4.0148	-2.8272	2.3256	4.0073	-1.2946	4.1025	-0.026	-0.1736	0.6261	0.012	-0.0104	-0.6425	-0.2338	0.6827	-0.0358	0.4702	-0.1234	-0.1374	0.5688	0.0362	0.5369	-21.4078	-24.0297	44.6718
11	2.0426	-2.867	6.9151	8.5301	-4.2301	2.1095	0.4128	2.6628	0.5603	-1.0946	-0.5528	-0.1273	0.9097	1.3227	0.3082	0.631	0.0195	-0.0299	0.9823	0.1176	0.5491	-31.5802	-22.8737	26.7104
12	5.2114	-4.4914	4.9759	5.4585	-5.1572	6.0646	1.1155	1.8471	0.1482	-0.7204	-1.2493	-1.3323	1.7129	1.9155	0.1205	1.1637	0.1919	-0.1424	1.1737	0.1065	0.98	-46.965	-10.6831	10.8989
13	9.9676	1.7279	0.8712	7.3601	0.2979	6.759	-0.0511	0.0842	1.3101	0.8465	-0.1939	-0.098	-0.9469	-0.4663	0.2045	0.7711	0.0295	-0.0243	0.4951	0.0963	0.7248	-63.9561	5.243	9.7912
14	5.0975	-3.3121	4.0901	1.5406	-2.5158	3.4465	0.1589	-0.0743	-0.4428	0.0209	0.0617	0.2481	0.0446	0.0492	-0.2144	0.4649	-0.0399	-0.1151	0.4159	0.0632	0.5541	-44.2932	-23.6602	31.3607
15	5.9186	-0.1213	-1.6203	6.5709	-0.4511	3.446	0.107	-0.956	-1.0938	0.3817	-0.0116	-0.4499	0.2824	0.5852	-0.0591	0.4381	0.0988	-0.1577	0.7285	0.0803	0.66	-15.3653	-41.0847	47.5198
16	0.9641	1.0183	-0.1092	2.8737	-1.1621	1.2332	-0.3757	-0.8134	-0.642	0.6685	0.2049	-0.3945	0.1292	-0.5843	0.0428	2.0053	-0.5585	0.4195	1.9118	0.9499	1.9564	-55.1266	-2.1339	73.2229
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18	2.4546	1.2549	-0.2517	1.555	-1.225	3.4115	-0.2404	-0.613	-1.1877	0.1594	-0.4013	-0.3306	1.0916	-0.1911	0.6503	1.1162	-0.2644	0.3553	0.8397	0.1578	1.3554	-28.1775	20.5052	29.5815
19	4.8502	1.0239	0.8791	3.7436	2.178	7.1178	-0.6286	0.2795	-0.5356	-0.9118	-0.1227	0.629	-0.3789	0.6459	0.6945	0.8657	-0.3795	0.0174	0.7328	0.0831	0.7973	-23.0032	31.7953	15.5566
20	9.5517	-0.7697	-5.0572	1.3631	-0.7129	6.526	0.2225	-0.9545	1.5929	0.1914	-0.8206	1.0412	-0.9612	-0.2923	0.7684	1.3	-0.1158	-0.5232	0.8627	-0.3479	1.6129	-30.9133	43.265	19.7588
21	8.7741	3.7285	0.7715	4.9972	2.9048	6.7031	-0.4862	-0.4793	-0.2116	0.3327	-0.2734	0.9073	-0.1712	0.9722	0.6746	1.0184	-0.3485	-0.0193	0.9053	0.1962	0.9542	-21.2394	34.7127	27.7265
22	4.6698	1.4831	0.8501	2.3976	1.5361	5.5642	-0.6151	0.1094	-0.3089	-0.4239	-0.2142	1.0233	0.0952	-1.1969	0.8838	0.7634	-0.2125	-0.0717	0.7803	-0.2314	1.3839	-34.481	27.9953	19.6282
23	0.9854	0.239	0.3549	0.2191	-0.3808	1.5474	-0.3041	0.7183	-1.4593	0.7756	-0.0531	-0.3776	1.1083	-0.1972	0.4262	1.8123	-0.7556	0.1669	1.5483	0.3931	1.759	-34.7703	5.7955	41.7759
24	1.2296	0.5655	0.0592	1.5178	0.3959	1.0202	0.4015	-0.0969	-0.0348	0.31	-0.5475	-0.2622	0.1694	0.5161	0.0791	1.3888	-0.4897	1.0291	1.669	1.2291	1.916	-43.1528	11.5247	50.022
25	2.6033	0.4332	-0.1327	2.2923	-1.1586	0.8244	0.1685	-0.9342	0.1824	0.4369	0.1672	-0.9248	-0.0541	-0.6427	0.0002	1.7358	-0.4635	0.2329	2.1233	0.8988	1.5341	-50.5198	1.7906	69.781
26	0.9591	0.0459	0.1017	-0.0075	-0.0147	-0.0065	-0.2317	0.2038	0.5143	1.61	0.4469	0.57	-0.8587	0.4177	-0.2415	2.577	-0.3568	-0.0603	1.2163	0.3334	1.6819	-62.7801	-9.8952	83.395
27	0.6922	0.4087	-0.5744	1.6219	-0.6853	0.9987	0.7577	0.7988	0.3507	1.5282	0.0103	0.9924	-0.0183	0.2805	-0.8787	2.1804	-0.6738	0.0434	1.7975	0.5468	1.5929	-62.7775	-17.8479	75.6276
28	2.0249	-0.5067	-0.5912	1.1076	1.7387	2.6471	0.7623	1.5362	0.9291	-1.8063	-0.5346	-0.849	-2.3194	1.0602	-0.2024	2.593	-0.8653	0.3842	1.9189	0.5502	1.947	-62.5894	-4.8053	59.3969
29	3.9746	1.9399	-2.4499	1.852	-2.628	3.6959	-0.7966	0.7764	-1.0405	-0.4241	0.0745	-0.5785	0.4774	-0.2358	0.6334	1.6598	-0.4767	0.3032	1.2628	0.1372	1.4671	-41.4609	18.1743	43.2075
30	2.2567	2.5273	-1.4628	3.0378	-1.3179	2.1835	0.4563	-0.9577	-0.3643	0.9338	-0.092	0.3739	0.1725	-0.2253	-0.3735	1.5534	-0.4814	0.3129	1.6429	0.8597	1.6847	-57.1393	10.4548	62.5692
31	2.1495	0.9235	4.2437	2.4522	1.3829	8.4436	0.1977	-0.8325	-1.0457	0.5026	0.1828	0.8656	0.09	-1.6542	-0.3911	2.2718	-1.1225	0.1932	2.1729	0.6826	1.851	-76.8664	-12.0089	83.6306
32	0.5875	-0.7246	-0.2644	0.8584	0.3084	0.1107	0.0238	0.0583	0.4471	-0.15	-0.0709	0.41	-0.0284	0.1801	0.0081	2.6766	-1.0481	0.7169	2.0322	1.1234	1.6366	-76.2001	-21.2153	83.7923
33	9.1726	-1.9535	5.7664	1.9342	-1.885	2.0073	0.5616	0.0181	-0.127	-0.4977	0.2024	0.2435	0.8473	-0.1154	-0.5967	2.296	-0.8575	0.2416	1.7683	0.4083	1.4097	-73.0228	-24.0622	74.4419
34	1.8408	-1.8258	-1.0545	1.8287	1.0445	0.5916	0.4803	0.5801	1.0708	-0.1348	-0.1535	1.2469	-0.6303	0.0975	-0.4133	2.4699	-1.002	0.1433	1.9386	0.473	1.624	-81.8918	-21.687	74.1691
35	0.0816	-0.0311	0.1033	0.0152	-0.0265	0.1451	0.2838	-0.7744	0.0813	0.803	-0.4017	0.0354	0.5614	-1.8703	0.1309	2.0035	-0.5538	0.1314	1.57	0.6547	1.9216	-86.0631	-20.0658	88.4811

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 11 through 41 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 42 through 99 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 100 through 132 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 133 through 213 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 214 through 237 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 238 through 269 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'A' and (resid 270 through 308 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'A' and (resid 309 through 327 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 4 through 13 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 14 through 37 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'B' and (resid 38 through 54 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'B' and (resid 55 through 64 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'B' and (resid 65 through 74 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'B' and (resid 75 through 137 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'B' and (resid 138 through 172 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 11 through 41 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'C' and (resid 42 through 60 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'C' and (resid 61 through 114 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'C' and (resid 115 through 195 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'C' and (resid 196 through 214 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'C' and (resid 215 through 237 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'C' and (resid 238 through 269 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'C' and (resid 270 through 288 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'C' and (resid 289 through 308 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'C' and (resid 309 through 327 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'D' and (resid 4 through 13 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'D' and (resid 14 through 37 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'D' and (resid 38 through 54 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'D' and (resid 55 through 74 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'D' and (resid 75 through 126 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'D' and (resid 127 through 137 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'D' and (resid 138 through 145 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'D' and (resid 146 through 153 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'D' and (resid 154 through 162 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'D' and (resid 163 through 172 )

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