登録情報 | データベース: PDB / ID: 4mtk |
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タイトル | Crystal structure of PA0091 VgrG1, the central spike of the Type VI Secretion System |
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要素 | VgrG1 |
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キーワード | TOXIN / Beta-barrel / OB-fold / Beta-helix / Type VI secretion system central spike / Secreted outside of the cell |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
type VI protein secretion system complex / protein secretion by the type VI secretion system / extracellular region類似検索 - 分子機能 Light-harvesting Protein - #110 / Pnp Oxidase; Chain A - #50 / Gp5 N-terminal domain / Baseplate protein-like domains / Light-harvesting Protein / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr family subset / Phage tail baseplate hub (GPD) / Phage tail protein beta-alpha-beta fold / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr protein / : ...Light-harvesting Protein - #110 / Pnp Oxidase; Chain A - #50 / Gp5 N-terminal domain / Baseplate protein-like domains / Light-harvesting Protein / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr family subset / Phage tail baseplate hub (GPD) / Phage tail protein beta-alpha-beta fold / Type VI secretion system, RhsGE-associated Vgr protein / : / Gp5/Type VI secretion system Vgr protein, OB-fold domain / Type VI secretion system/phage-baseplate injector OB domain / Vgr protein, OB-fold domain superfamily / 3-Layer(bab) Sandwich / Pnp Oxidase; Chain A / Few Secondary Structures / Irregular / OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) / Roll / Beta Barrel / Mainly Beta / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 Type VI secretion system spike protein VgrG1a類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Pseudomonas aeruginosa (緑膿菌) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 3.322 Å |
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データ登録者 | Sycheva, L.V. / Shneider, M.M. / Leiman, P.G. |
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引用 | ジャーナル: To be Published タイトル: The conserved architecture of the T6SS central spike complex 著者: Sycheva, L.V. / Shneider, M.M. / Basler, M. / Ho, B.T. / Mekalanos, J.J. / Leiman, P.G. |
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履歴 | 登録 | 2013年9月19日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年10月1日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.2 | 2023年9月20日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ncs_dom_lim / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id / _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id / _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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