登録情報 | データベース: PDB / ID: 4lq3 |
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タイトル | Crystal structure of human norovirus RNA-dependent RNA-polymerase bound to the inhibitor PPNDS |
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要素 | - 5'-R(P*GP*G)-3'
- RNA-dependent RNA-polymerase
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キーワード | VIRAL PROTEIN/REPLICATION INHIBITOR/RNA / RNA-dependent-RNA-polymerase / RdRp-inhibotir complex / VIRAL PROTEIN-REPLICATION INHIBITOR-RNA complex |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
helicase activity / viral RNA genome replication / RNA-dependent RNA polymerase activity / DNA-templated transcription / RNA binding / ATP binding / metal ion binding類似検索 - 分子機能 Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Helix non-globular / Special / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase ...Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces - #3230 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A - #20 / Mitochondrial Import Receptor Subunit Tom20; Chain A / Helicase/polymerase/peptidase polyprotein, Calicivirus-type / Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Helix non-globular / Special / RNA-directed RNA polymerase, C-terminal domain / Viral RNA-dependent RNA polymerase / Reverse transcriptase/Diguanylate cyclase domain / Alpha-Beta Plaits / RNA-directed RNA polymerase, catalytic domain / RdRp of positive ssRNA viruses catalytic domain profile. / DNA/RNA polymerase superfamily / Up-down Bundle / 2-Layer Sandwich / Mainly Alpha / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 |
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生物種 | Norovirus (ウイルス) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度: 2.6 Å |
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データ登録者 | Milani, M. / Tarantino, D. / Mastrangelo, E. / Croci, R. |
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引用 | ジャーナル: Antiviral Res. / 年: 2014 タイトル: Naphthalene-sulfonate inhibitors of human norovirus RNA-dependent RNA-polymerase. 著者: Tarantino, D. / Pezzullo, M. / Mastrangelo, E. / Croci, R. / Rohayem, J. / Robel, I. / Bolognesi, M. / Milani, M. |
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履歴 | 登録 | 2013年7月17日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB |
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改定 1.0 | 2014年2月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年11月5日 | Group: Structure summary |
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改定 1.2 | 2024年2月28日 | Group: Data collection / Database references / Derived calculations カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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