登録情報 データベース : PDB / ID : 4lgt 構造の表示 ダウンロードとリンクタイトル Crystal structure of the catalytic domain of RluB in complex with a 21-nucleotide RNA substrate 要素Ribosomal large subunit pseudouridine synthase B stem-loop of 23S rRNA 詳細キーワード ISOMERASE/RNA / beta sheet alpha-beta protein / rRNA modification peudouridine synthase / E. coli ribosomal RNA / ISOMERASE-RNA complex機能・相同性 機能・相同性情報分子機能 ドメイン・相同性 構成要素
23S rRNA pseudouridine2605 synthase / 23S rRNA pseudouridine(2605) synthase activity / rRNA pseudouridine synthase activity / enzyme-directed rRNA pseudouridine synthesis / RNA binding / cytosol 類似検索 - 分子機能 : / Pseudouridine synthase, RsuA/RluB/E/F / Pseudouridine synthase, RsuA/RluB/E/F, conserved site / Rsu family of pseudouridine synthase signature. / Pseudouridine synthase, RsuA/RluA-like / RNA pseudouridylate synthase / Pseudouridine synthase / Pseudouridine synthase / Pseudouridine synthase, catalytic domain superfamily / RNA-binding S4 domain ... : / Pseudouridine synthase, RsuA/RluB/E/F / Pseudouridine synthase, RsuA/RluB/E/F, conserved site / Rsu family of pseudouridine synthase signature. / Pseudouridine synthase, RsuA/RluA-like / RNA pseudouridylate synthase / Pseudouridine synthase / Pseudouridine synthase / Pseudouridine synthase, catalytic domain superfamily / RNA-binding S4 domain / Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A / S4 RNA-binding domain profile. / S4 RNA-binding domain / S4 domain / RNA-binding S4 domain / RNA-binding S4 domain superfamily / Roll / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta 類似検索 - ドメイン・相同性 RNA / RNA (> 10) / Ribosomal large subunit pseudouridine synthase B 類似検索 - 構成要素生物種 Escherichia coli (大腸菌)手法 X線回折 / シンクロトロン / 分子置換 / 解像度 : 1.3 Å 詳細データ登録者 Czudnochowski, N. / Finer-Moore, J.S. / Stroud, R.M. 引用ジャーナル : Nucleic Acids Res. / 年 : 2014タイトル : The mechanism of pseudouridine synthases from a covalent complex with RNA, and alternate specificity for U2605 versus U2604 between close homologs.著者 : Czudnochowski, N. / Ashley, G.W. / Santi, D.V. / Alian, A. / Finer-Moore, J. / Stroud, R.M. 履歴 登録 2013年6月28日 登録サイト : RCSB / 処理サイト : RCSB改定 1.0 2013年11月20日 Provider : repository / タイプ : Initial release改定 1.1 2014年2月26日 Group : Database references改定 1.2 2017年11月15日 Group : Refinement description / カテゴリ : software / Item : _software.classification改定 1.3 2019年7月17日 Group : Data collection / Derived calculations / Refinement descriptionカテゴリ : software / struct_connItem : _software.name / _software.version / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag改定 1.4 2023年9月20日 Group : Data collection / Database references ... Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond ... chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_conn / struct_ref_seq_dif Item : _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ... _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id / _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_atom_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_conn.ptnr2_label_seq_id / _struct_ref_seq_dif.details 改定 1.5 2023年12月6日 Group : Data collection / カテゴリ : chem_comp_atom / chem_comp_bond / Item : _chem_comp_atom.atom_id / _chem_comp_bond.atom_id_2
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