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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4k34 | ||||||
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タイトル | Crystal structures of CusC review conformational changes accompanying folding and transmembrane channel formation | ||||||
![]() | Cation efflux system protein CusC | ||||||
![]() | MEMBRANE PROTEIN / beta barrel | ||||||
機能・相同性 | ![]() protein palmitoylation / copper ion transmembrane transport / response to silver ion / silver ion transmembrane transport / diacylglycerol binding / copper ion transmembrane transporter activity / copper ion export / detoxification of copper ion / response to copper ion / porin activity ...protein palmitoylation / copper ion transmembrane transport / response to silver ion / silver ion transmembrane transport / diacylglycerol binding / copper ion transmembrane transporter activity / copper ion export / detoxification of copper ion / response to copper ion / porin activity / pore complex / protein homotrimerization / efflux transmembrane transporter activity / transmembrane transporter activity / intracellular copper ion homeostasis / cell outer membrane / response to toxic substance / transmembrane transport / copper ion binding / identical protein binding / membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Su, C.-C. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal Structures of CusC Review Conformational Changes Accompanying Folding and Transmembrane Channel Formation. 著者: Lei, H.T. / Bolla, J.R. / Bishop, N.R. / Su, C.C. / Yu, E.W. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 152.5 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 120.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 437.9 KB | 表示 | ![]() |
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文書・詳細版 | ![]() | 448.8 KB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 26.3 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 36.1 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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3 | ![]()
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単位格子 |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 49375.914 Da / 分子数: 2 / 変異: C1S / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: b0572, cusC, Escherichia coli, ibeB, JW0561, ylcB プラスミド: pBAD22 / 発現宿主: ![]() ![]() #2: 水 | ChemComp-HOH / | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.34 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.37 % |
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結晶化 | 温度: 298 K / 手法: 蒸気拡散法 / pH: 7.5 詳細: 12% PEG3350, 0.1M NaAc, 0.1M Na-Citric (6.5) and 15% 2-3 Butanediol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2012年2月3日 |
放射 | モノクロメーター: Si(111) / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 0.98 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.69→50 Å / Num. obs: 24838 / % possible obs: 98.5 % / Observed criterion σ(F): 2 / Observed criterion σ(I): 2 |
反射 シェル | 解像度: 2.69→2.84 Å / % possible all: 95 |
-位相決定
位相決定 | 手法: ![]() |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]()
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.98 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / Bsol: 46.385 Å2 / ksol: 0.346 e/Å3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso max: 138.2 Å2 / Biso mean: 50.7801 Å2 / Biso min: 12.42 Å2
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精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.69→42.321 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル | Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION / Total num. of bins used: 9
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