登録情報 | データベース: PDB / ID: 4jj2 |
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タイトル | High resolution structure of a C-terminal fragment of the T4 phage gp5 beta-helix |
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要素 | Tail-associated lysozyme |
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キーワード | HYDROLASE / PAAR-binding / triple beta-helix / intertwined beta-helix / cell-puncturing device / T4 gp5.4 |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
symbiont entry into host cell via disruption of host cell wall peptidoglycan / virus tail, baseplate / viral tail assembly / symbiont entry into host cell via disruption of host cell envelope / virus tail / symbiont entry into host / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity ...symbiont entry into host cell via disruption of host cell wall peptidoglycan / virus tail, baseplate / viral tail assembly / symbiont entry into host cell via disruption of host cell envelope / virus tail / symbiont entry into host / peptidoglycan catabolic process / cell wall macromolecule catabolic process / lysozyme / lysozyme activity / killing of cells of another organism / defense response to bacterium / symbiont entry into host cell / identical protein binding類似検索 - 分子機能 Protein Gp5, N-terminal OB-fold domain / Gp5, C-terminal / Pre-baseplate central spike protein Gp5 / Gp5 N-terminal OB domain / Gp5 C-terminal repeat (3 copies) / : / T4-type lysozyme / Glycoside hydrolase, family 24 / Lysozyme domain superfamily / Phage lysozyme / Lysozyme-like domain superfamily類似検索 - ドメイン・相同性 9-OCTADECENOIC ACID / PALMITIC ACID / STEARIC ACID / Pre-baseplate central spike protein Gp5類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Enterobacteria phage T4 (ファージ) |
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手法 | X線回折 / シンクロトロン / 単波長異常分散 / 解像度: 1.28 Å |
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データ登録者 | Buth, S.A. / Leiman, P.G. / Boudko, S.P. |
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引用 | ジャーナル: Viruses / 年: 2015 タイトル: Structure and Biophysical Properties of a Triple-Stranded Beta-Helix Comprising the Central Spike of Bacteriophage T4. 著者: Buth, S.A. / Menin, L. / Shneider, M.M. / Engel, J. / Boudko, S.P. / Leiman, P.G. |
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履歴 | 登録 | 2013年3月7日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2014年3月12日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software |
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改定 1.2 | 2023年2月8日 | Group: Database references / Derived calculations カテゴリ: citation / citation_author ...citation / citation_author / database_2 / pdbx_struct_conn_angle / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _citation.country / _citation.journal_abbrev ..._citation.country / _citation.journal_abbrev / _citation.journal_id_CSD / _citation.journal_id_ISSN / _citation.journal_volume / _citation.page_first / _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.pdbx_database_id_PubMed / _citation.title / _citation.year / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id / _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id / _pdbx_struct_conn_angle.value / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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改定 1.3 | 2024年5月29日 | Group: Data collection / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond |
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