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基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4hkr | ||||||
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タイトル | Calcium release-activated calcium (CRAC) channel ORAI | ||||||
![]() | Calcium release-activated calcium channel protein 1 | ||||||
![]() | TRANSPORT PROTEIN / calcium channel / Orai1 / eukaryotic membrane protein / membrane protein / ion channel / STIM / membrane | ||||||
機能・相同性 | ![]() store-operated calcium entry / store-operated calcium channel activity / positive regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade / positive regulation of calcium ion transport / calcium channel regulator activity / calcium channel complex / calcium ion transmembrane transport / calcium channel activity / identical protein binding / membrane / plasma membrane 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Long, S.B. / Hou, X. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Crystal structure of the calcium release-activated calcium channel Orai. 著者: Hou, X. / Pedi, L. / Diver, M.M. / Long, S.B. | ||||||
履歴 |
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構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
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ダウンロードとリンク
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ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 73.9 KB | 表示 | ![]() |
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PDB形式 | ![]() | 53.6 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
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-関連構造データ
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リンク
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集合体
登録構造単位 | ![]()
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1 | ![]()
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単位格子 |
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Components on special symmetry positions |
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詳細 | The biological assembly is a hexamer generated from the dimer in the asymmetric unit by the three fold crystallographic axis |
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要素
#1: タンパク質 | 分子量: 24347.395 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP Residues 133-341 / 変異: C224S, C283T, P276R, P277R / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: olf186-F, CRACM1, olf186, CG11430 / 発現宿主: ![]() #2: 化合物 | ChemComp-BA / | #3: 化合物 | ChemComp-ZN / | #4: 化合物 | |
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-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
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試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.81 Å3/Da / 溶媒含有率: 56.16 % |
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結晶化 | 温度: 290 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 26% PEG 400, 1 M Ammonium Formate, 100 mM MES pH 6.5. The crystal was soaked in: 50 % PEG 400, 1 M Ammonium Formate, 100 mM MES pH 6.5, 50 mM barium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 100 K |
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放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: DECTRIS PILATUS 6M / 検出器: PIXEL / 日付: 2012年4月22日 |
放射 | プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 3.35→40 Å / Num. all: 8116 / Num. obs: 8116 / % possible obs: 100 % / Observed criterion σ(I): -3 / 冗長度: 40.5 % / Biso Wilson estimate: 152 Å2 / Rsym value: 0.072 / Net I/σ(I): 59.7 |
反射 シェル | 解像度: 3.35→3.41 Å / 冗長度: 40.7 % / Mean I/σ(I) obs: 1.2 / Num. unique all: 386 / % possible all: 100 |
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解析
ソフトウェア |
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精密化 | 構造決定の手法: ![]() ![]() 開始モデル: PDB ENTRY 4HKS 解像度: 3.3511→19.93 Å / SU ML: 0.31 / Isotropic thermal model: isotropic / σ(F): 0 / 位相誤差: 39.72 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
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溶媒の処理 | 減衰半径: 0.8 Å / VDWプローブ半径: 1.2 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL | ||||||||||||||||||||||||||||
原子変位パラメータ | Biso mean: 170 Å2 | ||||||||||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 3.3511→19.93 Å
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拘束条件 |
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LS精密化 シェル |
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