PDB-4gro: Crystallographic and biological characterization of N- and C- ter...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4gro

タイトル

Crystallographic and biological characterization of N- and C- terminus mutants of human MIF

要素

Macrophage migration inhibitory factor

キーワード

cytokine / Isomerase / alpha/beta mixture

機能・相同性

機能・相同性情報

positive regulation of prostaglandin secretion involved in immune response / positive regulation of myeloid leukocyte cytokine production involved in immune response / dopachrome isomerase activity / phenylpyruvate tautomerase / L-dopachrome isomerase / phenylpyruvate tautomerase activity / positive regulation of arachidonate secretion / cytokine receptor binding / negative regulation of myeloid cell apoptotic process / negative regulation of macrophage chemotaxis ...positive regulation of prostaglandin secretion involved in immune response / positive regulation of myeloid leukocyte cytokine production involved in immune response / dopachrome isomerase activity / phenylpyruvate tautomerase / L-dopachrome isomerase / phenylpyruvate tautomerase activity / positive regulation of arachidonate secretion / cytokine receptor binding / negative regulation of myeloid cell apoptotic process / negative regulation of macrophage chemotaxis / negative regulation of mature B cell apoptotic process / carboxylic acid metabolic process / positive regulation of lipopolysaccharide-mediated signaling pathway / positive regulation of chemokine (C-X-C motif) ligand 2 production / prostaglandin biosynthetic process / negative regulation of protein metabolic process / regulation of macrophage activation / negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator / chemoattractant activity / protein homotrimerization / negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator / positive regulation of cAMP/PKA signal transduction / negative regulation of cellular senescence / positive regulation of phosphorylation / positive regulation of B cell proliferation / Gene and protein expression by JAK-STAT signaling after Interleukin-12 stimulation / negative regulation of cell migration / positive regulation of cytokine production / cytokine activity / Cell surface interactions at the vascular wall / DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator / positive regulation of fibroblast proliferation / positive regulation of tumor necrosis factor production / cellular senescence / protease binding / vesicle / secretory granule lumen / ficolin-1-rich granule lumen / cell surface receptor signaling pathway / positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade / inflammatory response / negative regulation of gene expression / innate immune response / positive regulation of cell population proliferation / Neutrophil degranulation / negative regulation of apoptotic process / cell surface / extracellular space / extracellular exosome / extracellular region / nucleoplasm / identical protein binding / plasma membrane / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

分子置換 / 解像度: 2 Å

データ登録者

Fan, C. / Lolis, E.

引用

ジャーナル: To be Published
タイトル: crystallographic and biological characterization of N- and C- terminus mutants of human MIF
著者: Fan, C. / Lolis, E.

履歴

登録	2012年8月26日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年10月2日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2021年5月12日	Group: Database references / Derived calculations / カテゴリ: struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id ..._struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.2	2024年2月28日	Group: Data collection / Database references / カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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その他	その他のダウンロード

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関連構造データ

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類似構造データ	4z1u-2 3smc-d 4z15-d 4wrb-d 5hvv-d 5bsi-1 3dji-2 6cb5-d 4k9g-d 4wr8-3 3ijg-d 4p0h-d 4grp-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#128 - 2010年8月インターフェロン (Interferons) 類似性 (1) #94 - 2007年10月スーパーオキシドジスムターゼ (Superoxide Dismutase) 類似性 (1) #163 - 2013年7月 HIVカプシド (HIV Capsid) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Macrophage migration inhibitory factor

B: Macrophage migration inhibitory factor

C: Macrophage migration inhibitory factor

D: Macrophage migration inhibitory factor

E: Macrophage migration inhibitory factor

F: Macrophage migration inhibitory factor

G: Macrophage migration inhibitory factor

H: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

101 kDa, 8 ポリマー
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1

A: Macrophage migration inhibitory factor

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.7 kDa, 3 ポリマー
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2

B: Macrophage migration inhibitory factor

C: Macrophage migration inhibitory factor

D: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.8 kDa, 3 ポリマー
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3

E: Macrophage migration inhibitory factor

F: Macrophage migration inhibitory factor

H: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.9 kDa, 3 ポリマー
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4

G: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

G: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

G: Macrophage migration inhibitory factor

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
37.9 kDa, 3 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	156.960, 156.960, 96.121
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 120.00
Int Tables number	146
Space group name H-M	H3

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	A-268- HOH
2	1	A-272- HOH

#1: タンパク質	Macrophage migration inhibitory factor / MIF / Glycosylation-inhibiting factor / GIF / L-dopachrome isomerase / L-dopachrome tautomerase / ...MIF / Glycosylation-inhibiting factor / GIF / L-dopachrome isomerase / L-dopachrome tautomerase / Phenylpyruvate tautomerase 分子量: 12568.290 Da / 分子数: 8 / 変異: Pro1-Ala2 are insertions / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 株: human / 遺伝子: GLIF, MIF, MMIF / プラスミド: pET11b(+) / 発現宿主: Escherichia coli (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) 参照: UniProt: P14174, phenylpyruvate tautomerase, L-dopachrome isomerase
#2: 化合物	ChemComp-CL / CHLORIDE ION / クロリド分子量: 35.453 Da / 分子数: 10 / 由来タイプ: 合成 / 式: Cl
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 593 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.27 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.73 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 6.5 詳細: 2.0 ammonium sulfate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折	平均測定温度: 95 K
放射光源	由来: 回転陽極 / タイプ: RIGAKU / 波長: 1.54
検出器	タイプ: RIGAKU SATURN 944+ / 検出器: CCD / 日付: 2011年11月14日
放射	モノクロメーター: GRAPHITE / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 1.54 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 2→15.39 Å / Num. obs: 58450 / % possible obs: 98 % / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 7.5 % / R_merge(I) obs: 0.078 / R_sym value: 0.078 / Net I/σ(I): 14.1

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
CrystalClear		データ収集
PHASER		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.7.3_928)	精密化
MOSFLM		データ削減
SCALA		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換 / 解像度: 2→15.1 Å / SU ML: 0.21 / σ(F): 1.96 / 位相誤差: 28.52 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.23	1970	3.45 %
R_work	0.188	-	-
obs	0.189	57105	96 %
all	-	59642	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-0.0282 Å²	-0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.0282 Å²	0 Å²
3-	-	-	0.0564 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2→15.1 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	7044	0	10	593	7647

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.006	7204
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	0.957	9810
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	12.338	2598
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.068	1096
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.004	1294

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.0005-2.0504	0.3791	126	0.3057	3435	X-RAY DIFFRACTION	83
2.0504-2.1057	0.4442	119	0.2703	3654	X-RAY DIFFRACTION	91
2.1057-2.1675	0.3895	143	0.2744	3999	X-RAY DIFFRACTION	97
2.1675-2.2372	0.3117	138	0.2572	4006	X-RAY DIFFRACTION	96
2.2372-2.3169	0.2981	134	0.2594	3783	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3169-2.4094	0.3304	151	0.2479	4008	X-RAY DIFFRACTION	96
2.4094-2.5185	0.2671	136	0.2563	3939	X-RAY DIFFRACTION	96
2.5185-2.6506	0.3219	148	0.2415	3919	X-RAY DIFFRACTION	96
2.6506-2.8157	0.3565	146	0.2303	4005	X-RAY DIFFRACTION	98
2.8157-3.0315	0.2694	145	0.2048	4039	X-RAY DIFFRACTION	99
3.0315-3.3336	0.2319	128	0.1804	4073	X-RAY DIFFRACTION	99
3.3336-3.8092	0.1555	168	0.1452	4087	X-RAY DIFFRACTION	100
3.8092-4.7739	0.1604	148	0.1216	4108	X-RAY DIFFRACTION	100
4.7739-15.1043	0.1516	140	0.1517	4080	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.0036	-2.3915	2.5583	9.6796	-6.827	7.6673	0.4401	-0.0584	-0.1621	0.1269	-0.2861	0.0622	0.097	0.6599	-0.1053	0.2406	0.0654	-0.0178	0.2986	-0.0345	0.2418	9.3129	-4.6701	26.1386
2	4.9043	-1.2409	-0.5428	0.4141	0.2049	0.1194	0.1688	0.3714	-0.1028	-0.4305	-0.1968	-0.3032	0.5637	0.6272	-0.1367	0.386	0.123	0.1233	0.432	-0.034	0.2307	13.2419	2.4303	9.9707
3	2.3684	0.101	0.2603	2.0992	0.5038	1.7713	0.2007	0.0338	-0.1117	-0.0875	0.0801	-0.4001	0.1275	0.1733	-0.2358	0.1873	0.0169	0.0026	0.2057	-0.0637	0.1955	12.0026	-0.4412	21.7634
4	1.7236	-0.0709	0.4829	1.5505	-0.7435	2.6323	0.1661	-0.2402	-0.0232	0.3979	-0.016	-0.6968	-0.1761	0.6039	-0.1042	0.3024	-0.0262	-0.0685	0.3036	-0.0964	0.3373	17.6698	2.2853	29.453
5	1.7908	0.8624	-0.1	4.2594	-0.6364	1.0458	0.073	-0.1032	0.0256	0.2302	0.0434	-0.2558	-0.2702	-0.0502	-0.1287	0.2756	0.0072	-0.027	0.2367	-0.0469	0.14	9.7657	4.4539	27.9741
6	2.2959	-0.7587	-1.5925	6.0793	1.7282	2.75	0.1615	-0.4645	-0.6948	0.9353	-0.6225	-0.0823	0.57	0.0957	0.179	0.4411	0.0131	-0.0649	0.3269	0.0727	0.3938	3.1282	-17.9618	31.2636
7	1.2787	0.1218	-0.0188	0.4645	0.3532	2.544	0.192	0.1106	-0.215	-0.1879	0.0392	0.5737	0.5464	-0.3361	-0.1801	0.2593	-0.0562	-0.0497	0.2249	-0.0061	0.372	28.0447	-35.186	66.535
8	2.0852	-0.2839	0.0551	2.03	0.7153	1.9839	0.2178	0.0372	-0.016	-0.1068	-0.2946	0.3357	0.0907	-0.2871	0.0468	0.1748	-0.013	-0.009	0.1408	-0.0344	0.2341	27.242	-31.3835	65.5352
9	1.6225	-0.454	-0.2077	1.8012	0.1187	2.7107	0.1004	0.0789	0.1135	0.1961	-0.2607	0.2773	-0.462	-0.4167	0.1471	0.253	0.0459	-0.007	0.1816	-0.0479	0.3028	25.2526	-23.4869	66.6315
10	3.0687	1.4212	-0.2477	3.1567	2.2022	5.5652	0.327	0.822	0.1314	-0.6683	0.1004	-0.0138	-0.6998	-0.6321	-0.3081	0.4367	0.072	-0.0629	0.3932	0.0401	0.307	36.1216	-28.2706	45.8413
11	6.4192	-4.4521	-2.6717	3.6863	3.0397	3.6633	-0.0067	0.0347	0.5109	0.4282	-0.2682	-0.0024	-0.0757	-0.0637	0.1727	0.2717	-0.04	0.0268	0.2154	-0.0113	0.1902	39.847	-23.6353	74.2985
12	0.9629	0.3841	1.0566	0.2796	1.1509	5.6654	0.1744	-0.4779	-0.2092	0.8682	0.1091	0.2887	0.2578	-0.1401	0.4033	0.5363	0.0018	0.0489	0.3479	0.141	0.2121	47.9607	-38.9456	79.5633
13	2.1345	0.2546	-0.1857	1.8654	0.4711	2.263	0.0581	-0.3266	0.118	0.2972	-0.1835	0.1979	0.0464	0.2739	0.073	0.2214	-0.0556	0.0336	0.2226	0.0271	0.1791	44.8553	-27.701	75.9571
14	2.5182	0.2268	-0.3391	1.6903	0.4687	1.3749	0.0766	-0.4739	0.6548	0.3622	-0.1879	-0.1839	-0.3043	0.4191	0.0379	0.2694	-0.1137	0.022	0.3017	-0.0258	0.3046	50.0532	-19.2761	76.7136
15	4.5598	-1.2409	-0.4986	1.483	0.2251	1.6882	0.1483	-0.2523	0.3947	-0.244	-0.124	-0.2344	-0.0286	0.2073	-0.0056	0.242	-0.0431	0.0225	0.1411	0.0251	0.2298	48.0422	-23.3009	69.7492
16	4.8272	0.022	-2.5702	1.3083	-1.6535	4.0669	-0.136	-0.2966	1.3152	0.1328	0.3268	0.3308	-0.382	-0.6248	-0.1935	0.3797	0.0397	0.0429	0.3421	-0.0689	0.4153	25.2535	-18.371	73.8065
17	1.3836	-0.4311	0.3284	0.4917	0.5444	1.2908	0.0492	-0.02	-0.6406	-0.2237	-0.1805	-0.5365	0.2258	0.2974	0.0876	0.2412	0.0742	0.044	0.2183	0.0503	0.3712	45.4938	-38.0366	58.481
18	2.031	-0.2758	0.1317	1.5579	-0.1656	2.4927	0.1301	0.1652	-0.2262	-0.1095	-0.223	-0.0708	0.0045	0.4066	0.1264	0.1796	0.0663	-0.0082	0.2062	0.024	0.1804	45.621	-34.6312	56.3614
19	1.9439	0.4106	0.4857	1.7607	-0.1277	1.9505	-0.0093	0.503	0.0959	-0.3068	0.0198	0.2392	-0.0762	0.3146	-0.0469	0.2436	0.0355	-0.028	0.2751	0.0643	0.1754	43.418	-29.1787	50.6309
20	5.6952	-1.9347	2.3947	3.4648	0.3995	3.0207	-0.5231	0.0612	0.43	-0.0692	0.3083	-0.6985	-0.6976	0.4614	0.1825	0.3249	-0.1014	0.0047	0.3848	0.053	0.3996	56.3618	-20.1883	68.6875
21	1.361	0.3452	0.064	2.6138	0.0084	0.8753	-0.0953	-0.515	-0.0853	0.2178	-0.0505	-0.4891	-0.2652	0.0689	0.025	0.3362	-0.0129	-0.1144	0.5014	-0.0229	0.316	42.6954	-20.2747	28.1104
22	2.2247	-0.6077	0.0505	1.0879	-0.0322	0.7789	-0.1581	-1.0772	-0.3456	0.3443	0.0551	-0.1488	-0.2259	0.0305	0.026	0.2494	0.0835	-0.0908	0.4316	0.1113	0.2012	38.9608	-21.9824	27.6783
23	1.8346	-0.5526	-0.0955	2.8021	0.6997	1.6782	-0.2833	-0.732	-0.217	0.0805	0.0978	0.3129	-0.2779	-0.1986	0.1385	0.249	0.0778	-0.0172	0.4708	0.042	0.2577	30.9722	-21.9744	27.1025
24	2.1232	-2.2224	1.1349	2.403	-0.8715	2.9379	-0.2632	-0.2917	-0.8745	-0.1037	0.0677	-0.3672	0.7906	-0.0458	0.1464	0.2028	-0.0177	0.0653	0.3972	0.1295	0.5047	42.6034	-41.2489	17.4907
25	2.4945	-0.3075	-0.3005	0.3135	0.0665	1.5103	-0.2102	-0.3532	0.5882	-0.1431	0.1086	-0.1899	-0.8136	0.064	0.0502	0.4822	-0.1073	-0.0185	0.2092	-0.0557	0.4118	43.0072	-9.5536	12.1346
26	0.7454	0.2443	0.4207	0.7441	0.403	1.8098	-0.3392	-0.1314	0.6568	-0.4137	-0.0024	-0.1707	-1.1771	-0.0669	-0.1344	0.5116	0.0662	-0.0616	0.0608	-0.1192	0.345	39.6613	-10.7649	10.0307
27	1.8877	0.2566	-0.1832	1.6199	0.1134	2.4112	-0.3064	0.1388	0.0463	-0.6157	0.0385	-0.0743	-0.7175	-0.2647	0.1818	0.5224	-0.0033	-0.0459	0.2117	-0.0342	0.2459	35.7061	-13.5959	3.7023
28	1.7192	-1.0578	-2.16	2.8986	1.2479	2.9109	-0.3015	-0.6606	0.0539	0.0262	-0.009	0.7129	-0.5679	-0.3722	0.2269	0.3316	0.0818	-0.11	0.4713	-0.0627	0.2758	24.8029	-16.1083	25.4953
29	1.1066	0.3236	0.082	2.4729	-0.3683	1.9552	0.1396	0.2706	-0.2668	-0.5868	0.1402	-0.2107	0.3699	0.3471	-0.2661	0.3929	0.0558	0.0563	0.4535	-0.1245	0.2895	9.778	-5.2638	70.573
30	1.2093	0.5564	0.4318	1.2153	0.6923	1.7771	0.2305	0.4264	-0.3932	-0.2243	0.2678	-0.6293	0.5317	0.603	-0.0916	0.3411	0.1032	-0.0231	0.2412	-0.1637	0.3416	10.7914	-5.3921	74.5468
31	1.4426	0.2535	0.0896	1.9749	0.2687	1.7835	0.3417	0.0608	-0.2124	0.0974	0.1555	-0.5262	0.0381	0.4879	-0.2603	0.2375	0.0334	-0.0242	0.3161	-0.1442	0.3467	14.3403	-2.8287	81.2723
32	2.3887	0.8988	-0.7241	4.2661	0.8268	0.5429	0.0808	0.1153	-0.8083	0.1984	0.2219	0.1738	0.5606	0.1328	-0.2442	0.3975	0.0051	-0.1814	0.3314	0.0021	0.3618	-4.8956	-17.7193	84.085
33	3.2739	-0.8426	-2.0528	2.7093	2.5233	2.9277	-0.1162	0.2449	0.2525	0.1204	-0.1547	0.1207	0.057	-0.3442	0.0988	0.1888	0.0407	-0.0276	0.2275	0.0344	0.303	45.421	-26.809	8.338
34	0.1282	-0.1913	0.1957	0.5015	-0.4458	0.4107	0.1434	0.2477	0.365	-0.1597	-0.0714	0.0807	-0.4401	-0.2856	0.2262	0.3982	0.3788	-0.0501	0.1927	0.0253	0.9697	59.962	-25.886	16.83
35	1.9944	-0.873	0.5463	0.6662	0.246	0.9423	0.1411	1.0864	0.9717	-0.371	0.0297	0.0958	-0.4281	0.2332	0.8771	0.3622	0.0355	-0.0889	0.5173	0.3786	0.5169	53.091	-32.176	3.479
36	2.3946	0.0635	0.6622	1.0334	0.4378	0.9527	-0.1664	0.3864	0.5668	0.0522	0.1087	-0.0944	-0.3892	-0.2129	0.0731	0.2633	0.0287	-0.0498	0.2113	0.0596	0.2923	46.9	-28.543	12.76
37	2.4806	-0.8598	-0.2277	2.0788	0.7307	2.3888	-0.2747	0.5313	1.1735	0.2226	0.2946	-0.5223	-0.3432	0.1382	0.0254	0.2897	-0.0642	-0.1358	0.3422	0.16	0.5918	49.087	-38.707	10.717
38	1.8854	0.4168	0.6649	0.8304	-0.1782	2.4756	-0.1016	0.3622	0.5665	0.444	-0.1262	-0.2658	0.0645	-0.0764	-0.003	0.2181	0.0459	-0.0661	0.2582	0.0417	0.3679	42.638	-32.514	13.729
39	1.5695	0.1792	2.0098	2.1145	-0.2217	2.7949	-0.273	0.7451	0.3558	-0.4795	0.0022	0.0975	0.2283	-0.1585	0.0329	0.2248	-0.0727	0.0438	0.5456	0.043	0.307	37.149	-18.128	-3.734

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	chain 'A' and (resid 1 through 10 )
2	X-RAY DIFFRACTION	2	chain 'A' and (resid 11 through 20 )
3	X-RAY DIFFRACTION	3	chain 'A' and (resid 21 through 66 )
4	X-RAY DIFFRACTION	4	chain 'A' and (resid 67 through 90 )
5	X-RAY DIFFRACTION	5	chain 'A' and (resid 91 through 108 )
6	X-RAY DIFFRACTION	6	chain 'A' and (resid 109 through 117 )
7	X-RAY DIFFRACTION	7	chain 'B' and (resid 1 through 20 )
8	X-RAY DIFFRACTION	8	chain 'B' and (resid 21 through 66 )
9	X-RAY DIFFRACTION	9	chain 'B' and (resid 67 through 108 )
10	X-RAY DIFFRACTION	10	chain 'B' and (resid 109 through 117 )
11	X-RAY DIFFRACTION	11	chain 'C' and (resid 1 through 10 )
12	X-RAY DIFFRACTION	12	chain 'C' and (resid 11 through 20 )
13	X-RAY DIFFRACTION	13	chain 'C' and (resid 21 through 66 )
14	X-RAY DIFFRACTION	14	chain 'C' and (resid 67 through 90 )
15	X-RAY DIFFRACTION	15	chain 'C' and (resid 91 through 108 )
16	X-RAY DIFFRACTION	16	chain 'C' and (resid 109 through 117 )
17	X-RAY DIFFRACTION	17	chain 'D' and (resid 1 through 20 )
18	X-RAY DIFFRACTION	18	chain 'D' and (resid 21 through 66 )
19	X-RAY DIFFRACTION	19	chain 'D' and (resid 67 through 108 )
20	X-RAY DIFFRACTION	20	chain 'D' and (resid 109 through 117 )
21	X-RAY DIFFRACTION	21	chain 'E' and (resid 1 through 20 )
22	X-RAY DIFFRACTION	22	chain 'E' and (resid 21 through 66 )
23	X-RAY DIFFRACTION	23	chain 'E' and (resid 67 through 108 )
24	X-RAY DIFFRACTION	24	chain 'E' and (resid 109 through 117 )
25	X-RAY DIFFRACTION	25	chain 'F' and (resid 1 through 20 )
26	X-RAY DIFFRACTION	26	chain 'F' and (resid 21 through 66 )
27	X-RAY DIFFRACTION	27	chain 'F' and (resid 67 through 108 )
28	X-RAY DIFFRACTION	28	chain 'F' and (resid 109 through 117 )
29	X-RAY DIFFRACTION	29	chain 'G' and (resid 1 through 20 )
30	X-RAY DIFFRACTION	30	chain 'G' and (resid 21 through 66 )
31	X-RAY DIFFRACTION	31	chain 'G' and (resid 67 through 108 )
32	X-RAY DIFFRACTION	32	chain 'G' and (resid 109 through 117 )
33	X-RAY DIFFRACTION	33	chain 'H' and (resid 1 through 10 )
34	X-RAY DIFFRACTION	34	chain 'H' and (resid 11 through 20 )
35	X-RAY DIFFRACTION	35	chain 'H' and (resid 21 through 33 )
36	X-RAY DIFFRACTION	36	chain 'H' and (resid 34 through 71 )
37	X-RAY DIFFRACTION	37	chain 'H' and (resid 72 through 90 )
38	X-RAY DIFFRACTION	38	chain 'H' and (resid 91 through 108 )
39	X-RAY DIFFRACTION	39	chain 'H' and (resid 109 through 117 )

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

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関連情報:EMDBヘッダ

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新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
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