登録情報 | データベース: PDB / ID: 4fwm |
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タイトル | Crystal structure of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD) in complex with ATP |
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要素 | Propionate kinase |
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キーワード | TRANSFERASE / Kinase / Acetate and Sugar Kinases/Hsc70/Actin (ASKHA) superfamily / Propionate kinase / TdcD / Short-Chain Fatty Acid |
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機能・相同性 | 機能・相同性情報
propionate kinase / propionate kinase activity / L-threonine catabolic process to propionate / acetate kinase activity / acetate metabolic process / ATP binding / metal ion binding / cytosol類似検索 - 分子機能 Propionate kinase / Acetate and butyrate kinases family signature 2. / Acetate/propionate kinase / Aliphatic acid kinase, short-chain, conserved site / Acetate and butyrate kinases family signature 1. / Aliphatic acid kinase, short-chain / Acetokinase family / ATPase, nucleotide binding domain / ATPase, nucleotide binding domain / Nucleotidyltransferase; domain 5 ...Propionate kinase / Acetate and butyrate kinases family signature 2. / Acetate/propionate kinase / Aliphatic acid kinase, short-chain, conserved site / Acetate and butyrate kinases family signature 1. / Aliphatic acid kinase, short-chain / Acetokinase family / ATPase, nucleotide binding domain / ATPase, nucleotide binding domain / Nucleotidyltransferase; domain 5 / 2-Layer Sandwich / Alpha Beta類似検索 - ドメイン・相同性 ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE / Propionate kinase類似検索 - 構成要素 |
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生物種 | Salmonella typhimurium (サルモネラ菌) |
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手法 | X線回折 / 分子置換 / 解像度: 2.95 Å |
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データ登録者 | Chittori, S. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. |
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引用 | ジャーナル: Biochim.Biophys.Acta / 年: 2013 タイトル: Mechanistic features of Salmonella typhimurium propionate kinase (TdcD): insights from kinetic and crystallographic studies. 著者: Chittori, S. / Simanshu, D.K. / Banerjee, S. / Murthy, A.M.V. / Mathivanan, S. / Savithri, H.S. / Murthy, M.R.N. |
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履歴 | 登録 | 2012年7月1日 | 登録サイト: RCSB / 処理サイト: PDBJ |
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改定 1.0 | 2013年6月19日 | Provider: repository / タイプ: Initial release |
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改定 1.1 | 2014年1月29日 | Group: Database references |
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改定 1.2 | 2017年11月15日 | Group: Refinement description / カテゴリ: software Item: _software.classification / _software.contact_author ..._software.classification / _software.contact_author / _software.contact_author_email / _software.date / _software.language / _software.location / _software.name / _software.type / _software.version |
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改定 1.3 | 2023年11月8日 | Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id |
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