+
データを開く
-
基本情報
登録情報 | データベース: PDB / ID: 4frz | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
タイトル | Arabidopsis KCBP motor domain dimerized via regulatory domain | ||||||
![]() | Kinesin-like calmodulin-binding protein | ||||||
![]() | MOTOR PROTEIN / kinesin motor domain / calmodulin binding motif / KCBP interacting calcium binding protein (KIC) / kinesin dimer | ||||||
機能・相同性 | ![]() trichome patterning / trichome branching / cortical microtubule / phragmoplast / cortical microtubule organization / minus-end-directed microtubule motor activity / microtubule bundle formation / microtubule motor activity / kinesin complex / microtubule-based movement ...trichome patterning / trichome branching / cortical microtubule / phragmoplast / cortical microtubule organization / minus-end-directed microtubule motor activity / microtubule bundle formation / microtubule motor activity / kinesin complex / microtubule-based movement / mitotic spindle / ADP binding / actin filament binding / microtubule binding / microtubule / oxidoreductase activity / cytoskeleton / calmodulin binding / calcium ion binding / protein kinase binding / protein homodimerization activity / ATP hydrolysis activity / ATP binding 類似検索 - 分子機能 | ||||||
生物種 | ![]() ![]() | ||||||
手法 | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Vinogradova, M. | ||||||
![]() | ![]() タイトル: Plant Kinesin-Like Calmodulin Binding Protein Employs Its Regulatory Domain for Dimerization. 著者: Vinogradova, M.V. / Malanina, G.G. / Waitzman, J.S. / Rice, S.E. / Fletterick, R.J. | ||||||
履歴 |
|
-
構造の表示
構造ビューア | 分子: ![]() ![]() |
---|
-
ダウンロードとリンク
-
ダウンロード
PDBx/mmCIF形式 | ![]() | 158 KB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
PDB形式 | ![]() | 123.2 KB | 表示 | ![]() |
PDBx/mmJSON形式 | ![]() | ツリー表示 | ![]() | |
その他 | ![]() |
-検証レポート
文書・要旨 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | ![]() |
---|---|---|---|---|
文書・詳細版 | ![]() | 1.1 MB | 表示 | |
XML形式データ | ![]() | 32 KB | 表示 | |
CIF形式データ | ![]() | 42.9 KB | 表示 | |
アーカイブディレクトリ | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-関連構造データ
関連構造データ | ![]() 1sdmS S: 精密化の開始モデル |
---|---|
類似構造データ |
-
リンク
-
集合体
登録構造単位 | ![]()
| ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 |
| ||||||||
単位格子 |
|
-
要素
-タンパク質 , 1種, 2分子 AB
#1: タンパク質 | 分子量: 44040.949 Da / 分子数: 2 / 断片: UNP residues 875-1260 / 変異: C1131N / 由来タイプ: 組換発現 由来: (組換発現) ![]() ![]() 遺伝子: KCBP, ZWI, At5g65930, K14B20.10 / 発現宿主: ![]() ![]() |
---|
-非ポリマー , 5種, 109分子 ![](data/chem/img/MG.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
![](data/chem/img/IMD.gif)
![](data/chem/img/EDO.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
![](data/chem/img/ADP.gif)
![](data/chem/img/IMD.gif)
![](data/chem/img/EDO.gif)
![](data/chem/img/HOH.gif)
#2: 化合物 | #3: 化合物 | #4: 化合物 | ChemComp-IMD / #5: 化合物 | #6: 水 | ChemComp-HOH / | |
---|
-実験情報
-実験
実験 | 手法: ![]() |
---|
-
試料調製
結晶 | マシュー密度: 2.35 Å3/Da / 溶媒含有率: 47.62 % |
---|---|
結晶化 | 温度: 277 K / 手法: 蒸気拡散法, シッティングドロップ法 / pH: 8 詳細: 10% PEG 3000, 100 mM imidazole (pH 8.0), 200 mM Li2SO4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K |
-データ収集
回折 | 平均測定温度: 200 K |
---|---|
放射光源 | 由来: ![]() ![]() ![]() |
検出器 | タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2008年11月20日 |
放射 | モノクロメーター: double flat crystal / プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray |
放射波長 | 波長: 1.1 Å / 相対比: 1 |
反射 | 解像度: 2.4→25 Å / Num. obs: 29651 / % possible obs: 91.9 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 |
反射 シェル | 解像度: 2.4→2.49 Å / 冗長度: 2.6 % / Mean I/σ(I) obs: 2.41 / % possible all: 81.9 |
-
解析
ソフトウェア |
| ||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
精密化 | 構造決定の手法: ![]() 開始モデル: 1SDM 解像度: 2.4→25 Å / σ(F): 0 / 立体化学のターゲット値: Engh & Huber
| ||||||||||||||||||||
精密化ステップ | サイクル: LAST / 解像度: 2.4→25 Å
|