PDB-4ezk: Potent and Selective Inhibitors of PI3K-delta: Obtaining Isoform ...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4ezk

タイトル

Potent and Selective Inhibitors of PI3K-delta: Obtaining Isoform Selectivity from the Affinity Pocket and Tryptophan Shelf

要素

Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

キーワード

TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR / kinase p110 / p110-gamma / lipid kinase / cytoplasmic / TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex

機能・相同性

機能・相同性情報

secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis ...secretory granule localization / negative regulation of triglyceride catabolic process / natural killer cell chemotaxis / neutrophil extravasation / phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase / positive regulation of acute inflammatory response / respiratory burst involved in defense response / negative regulation of cardiac muscle contraction / regulation of calcium ion transmembrane transport / T cell chemotaxis / negative regulation of fibroblast apoptotic process / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IB / sphingosine-1-phosphate receptor signaling pathway / phosphatidylinositol 3-kinase complex, class IA / dendritic cell chemotaxis / 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 3-kinase activity / 1-phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase activity / phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase / phosphatidylinositol 3-kinase / phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process / 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity / mast cell degranulation / Erythropoietin activates Phosphoinositide-3-kinase (PI3K) / hepatocyte apoptotic process / positive regulation of Rac protein signal transduction / regulation of cell adhesion mediated by integrin / Synthesis of PIPs at the plasma membrane / phosphatidylinositol-mediated signaling / phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process / regulation of angiogenesis / T cell proliferation / cellular response to cAMP / GPVI-mediated activation cascade / T cell activation / ephrin receptor binding / positive regulation of endothelial cell migration / phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / neutrophil chemotaxis / positive regulation of cytokine production / positive regulation of MAP kinase activity / platelet aggregation / endocytosis / G beta:gamma signalling through PI3Kgamma / Signaling by CSF1 (M-CSF) in myeloid cells / kinase activity / positive regulation of cytosolic calcium ion concentration / angiogenesis / adaptive immune response / positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase/protein kinase B signal transduction / non-specific serine/threonine protein kinase / protein kinase activity / inflammatory response / phosphorylation / immune response / G protein-coupled receptor signaling pathway / innate immune response / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / ATP binding / identical protein binding / membrane / plasma membrane / cytoplasm / cytosol
類似検索 - 分子機能

PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. ...PIK3 catalytic subunit gamma, adaptor-binding domain / PIK3 catalytic subunit gamma adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, accessory domain (PIK) / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 4 / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, Domain 5 / C2 domain / Phosphatidylinositol 3-kinase, adaptor-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase adaptor-binding (PI3K ABD) domain profile. / PI3-kinase family, Ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain / PI3-kinase family, ras-binding domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Ras-binding (PI3K RBD) domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase C2 / Phosphoinositide 3-kinase, region postulated to contain C2 domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase-type domain / C2 phosphatidylinositol 3-kinase (PI3K)-type domain profile. / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase family, accessory domain (PIK domain) / Phosphoinositide 3-kinase, accessory (PIK) domain / Phosphatidylinositol kinase / PIK helical domain profile. / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 1. / Phosphatidylinositol 3/4-kinase, conserved site / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases signature 2. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain superfamily / Phosphoinositide 3-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinase / Phosphatidylinositol 3- and 4-kinases catalytic domain profile. / Phosphatidylinositol 3-/4-kinase, catalytic domain / Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1 / C2 domain superfamily / Serine Threonine Protein Phosphatase 5, Tetratricopeptide repeat / Ubiquitin-like (UB roll) / Alpha Horseshoe / Armadillo-type fold / Ubiquitin-like domain superfamily / Roll / Protein kinase-like domain superfamily / Immunoglobulin-like / Sandwich / 2-Layer Sandwich / Orthogonal Bundle / Mainly Beta / Mainly Alpha / Alpha Beta
類似検索 - ドメイン・相同性

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 2.803 Å

データ登録者

Murray, J.M.

引用

ジャーナル: Bioorg.Med.Chem.Lett. / 年: 2012
タイトル: Potent and selective inhibitors of PI3K-delta: obtaining isoform selectivity from the affinity pocket and tryptophan shelf
著者: Sutherlin, D.P. / Baker, S. / Bisconte, A. / Blaney, P.M. / Brown, A. / Chan, B.K. / Chantry, D. / Castanedo, G. / DePledge, P. / Goldsmith, P. / Goldstein, D.M. / Hancox, T. / Kaur, J. / ...

履歴

登録	2012年5月2日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2013年4月17日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年9月13日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_ref_seq_dif / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_ref_seq_dif.details / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4ezk.cif.gz	194.2 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4ezk.ent.gz	152.2 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4ezk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4ezk_validation.pdf.gz	729.9 KB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4ezk_full_validation.pdf.gz	754.3 KB	表示
XML形式データ	4ezk_validation.xml.gz	32.1 KB	表示
CIF形式データ	4ezk_validation.cif.gz	43.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/4ezk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/ez/4ezk	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4ezjC 4ezlC 1e8xS C: 同じ文献を引用 (文献) S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	4flh-d 3r7q-d 3apd-d 1e90-d 2chw-d 3zvv-d 1e8x-d 4g11-d 3l17-d 3apc-d 4hle-d 3r7r-d 4ful-d 2a5u-d 4gb9-d 3sd5-d 4anx-d 6xrm-d 3tl5-d 3l08-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#148 - 2012年4月 Rasタンパク質 (Ras Protein) 類似性 (35) #245 - 2020年5月スプライソソーム (Spliceosomes) 類似性 (1) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (1) #239 - 2019年11月ホスホリパーゼA2 (Phospholipase A2) 類似性 (1)

登録構造単位

A: Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform

ヘテロ分子

111 kDa, 1 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	140.730, 67.190, 106.020
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 96.76, 90.00
Int Tables number	5
Space group name H-M	C121

#1: タンパク質	Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform / PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / ...PI3-kinase subunit gamma / PI3K-gamma / PI3Kgamma / PtdIns-3-kinase subunit gamma / Phosphatidylinositol 4 / 5-bisphosphate 3-kinase 110 kDa catalytic subunit gamma / PtdIns-3-kinase subunit p110-gamma / p110gamma / Phosphoinositide-3-kinase catalytic gamma polypeptide / Serine/threonine protein kinase PIK3CG / p120-PI3K 分子量: 110699.023 Da / 分子数: 1 / 断片: UNP residues 144-1102 / 変異: K802T / 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: PIK3CG / 細胞株 (発現宿主): Sf9 発現宿主: Spodoptera frugiperda (ツマジロクサヨトウ) 参照: UniProt: P48736, phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate 3-kinase, non-specific serine/threonine protein kinase
#2: 化合物	ChemComp-0SD / 2-(1-{[2-(2H-indazol-4-yl)-4-(morpholin-4-yl)pyrido[3,2-d]pyrimidin-6-yl]methyl}piperidin-4-yl)propan-2-ol 分子量: 487.597 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₇H₃₃N₇O₂
#3: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 12 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.25 Å³/Da / 溶媒含有率: 45.28 %
結晶化	温度: 289 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 8.5 詳細: PEG 3350, 0.2M NH4SO4, 0.1M Tris-HCl 8.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 289K

-
データ収集

放射光源

由来:

シンクロトロン / サイト:

ALS

/ ビームライン: 5.0.2 / 波長: 1 Å

検出器

タイプ: ADSC QUANTUM 315 / 検出器: CCD / 日付: 2011年12月1日

放射

プロトコル: SINGLE / 散乱光タイプ: x-ray

放射波長

波長: 1 Å / 相対比: 1

反射

解像度: 2.8→34.392 Å / % possible obs: 95.6 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): 0 / 冗長度: 3.2 % / B_iso Wilson estimate: 85 Å² / R_sym value: 0.046 / Net I/σ(I): 22.5

反射シェル

解像度 (Å)	冗長度 (%)	R_merge(I) obs	Mean I/σ(I) obs	R_sym value	Diffraction-ID	% possible all
2.8-2.95	3.2	0.331	2.1	0.331	1	91
2.95-3.13	3.2	0.213	3.4	0.213	1	92.5
3.13-3.35	3.1	0.145	3.8	0.145	1	94.7
3.35-3.62	3.1	0.082	8	0.082	1	97.5
3.62-3.96	3.2	0.059	11.1	0.059	1	98.2
3.96-4.43	3.3	0.045	14.1	0.045	1	98.6
4.43-5.12	3.2	0.041	14.2	0.041	1	97.9
5.12-6.27	3	0.06	8.7	0.06	1	94.9
6.27-8.86	3.4	0.027	18.9	0.027	1	99.5
8.86-34.392	3.4	0.018	32	0.018	1	96.8

-
位相決定

位相決定	手法: 分子置換

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
SCALA	3.3.20	データスケーリング
PHASER		位相決定
PHENIX	1.8_1066	精密化
PDB_EXTRACT	3.11	データ抽出
XSCALE		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 1E8X

1e8x

解像度: 2.803→34.392 Å / Occupancy max: 1 / Occupancy min: 0.1 / SU ML: 0.42 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 30.18 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2533	1202	5.16 %
R_work	0.2432	-	-
obs	0.2437	23292	95.51 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL

原子変位パラメータ

B_iso mean: 120.2513 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-11.2848 Å²	0 Å²	7.946 Å²
2-	-	0.4702 Å²	0 Å²
3-	-	-	10.8146 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.803→34.392 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	6818	0	36	12	6866

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	7005
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.463	9482
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	19.205	2635
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.094	1064
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.006	1225

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.8029-2.9151	0.3829	136	0.3504	2281	X-RAY DIFFRACTION	91
2.9151-3.0477	0.3286	134	0.3234	2355	X-RAY DIFFRACTION	92
3.0477-3.2082	0.3319	128	0.319	2372	X-RAY DIFFRACTION	93
3.2082-3.4091	0.3553	118	0.3097	2452	X-RAY DIFFRACTION	96
3.4091-3.672	0.3087	142	0.2772	2481	X-RAY DIFFRACTION	98
3.672-4.041	0.2648	127	0.2506	2535	X-RAY DIFFRACTION	98
4.041-4.6246	0.2098	153	0.2187	2525	X-RAY DIFFRACTION	99
4.6246-5.8219	0.2248	135	0.2115	2490	X-RAY DIFFRACTION	97
5.8219-34.3946	0.1998	129	0.2021	2599	X-RAY DIFFRACTION	97

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	1.0835	-0.3625	0.1472	5.2512	1.9129	4.8267	0.3362	2.2953	-2.8145	-1.1769	-0.3751	0.3557	1.9232	0.4689	-0.613	1.1478	0.2177	-0.205	1.6592	-0.8523	1.7284	27.0745	-37.9473	3.8396
2	5.0575	-1.2515	-0.7363	0.7993	1.0217	1.5299	0.6548	2.416	-1.8291	-0.4682	-0.1361	-0.199	0.4452	1.4014	-0.5729	0.9704	0.2025	-0.0278	1.5485	-0.729	1.07	42.5006	-33.0792	6.0641
3	3.5042	1.2161	1.2508	2.8157	-0.9364	2.0373	0.6839	0.9782	-2.0569	0.0218	-0.0146	0.267	1.5221	0.4465	-0.1547	1.0749	0.5435	-0.2838	0.2526	-0.6721	1.8098	36.5006	-42.3282	16.7985
4	6.3073	-1.0706	1.668	0.7073	-0.3866	4.1543	0.3531	-0.6529	-1.3681	0.5581	-0.0744	0.0553	0.6613	-0.8251	-0.5785	0.8532	-0.1878	-0.0318	0.9596	0.4783	1.3454	17.7827	-35.841	32.4349
5	1.9456	2.6199	-0.6446	6.5642	0.6029	7.4404	-0.4331	-2.846	-0.2224	0.8609	0.1285	0.7768	-0.2079	-2.4531	-0.0475	1.9661	0.1472	0.4103	2.0914	-0.4848	1.8409	12.7584	-19.6412	48.4595
6	3.5624	-1.2931	-0.5443	1.5375	-1.2999	2.1844	0.5439	-2.2078	-1.392	0.3941	-0.0464	1.1465	0.7365	-1.8055	-0.3034	0.9301	-0.216	0.4767	2.3544	0.739	1.7015	-0.7808	-31.929	40.1186
7	2.3613	0.3797	-0.4578	0.6431	1.0341	2.2102	0.4273	-1.0716	-2.3409	0.5343	-0.1833	0.9283	1.9213	-1.5939	-0.2729	1.1304	-0.5724	-0.0661	1.675	0.3073	1.9502	1.5771	-38.7654	29.8596
8	7.95	-1.936	3.9451	2.4778	-0.5848	8.8446	0.4815	-1.0728	-1.8533	0.5751	0.1341	0.6969	1.2597	-1.2872	-0.4519	0.683	-0.2494	0.0453	1.0775	0.2676	1.239	9.9123	-32.3336	31.7202
9	7.134	-1.4097	1.8325	4.2192	-0.7237	7.1667	0.1232	-1.6684	-0.9972	0.7344	0.4816	0.297	-0.3157	-0.9996	-0.179	0.9955	-0.1379	0.3054	1.7055	0.616	1.1738	11.8601	-25.1906	38.8325
10	8.4412	5.675	7.7301	3.8208	5.2287	7.3552	-0.0727	-1.8421	-0.1352	0.0975	0.1828	0.8217	-0.5194	-1.9431	0.0821	0.8974	0.246	0.0455	1.7818	0.1925	1.85	4.3185	-20.1267	36.2238
11	7.2898	-1.9991	0.485	2.6201	1.1958	3.7452	0.2098	-0.5338	-2.725	0.2733	-0.1647	0.8836	0.6747	-1.9837	-0.3732	0.9067	-0.2098	-0.0607	1.6348	0.2777	1.8384	3.5988	-36.9224	25.8723
12	3.233	-0.3599	3.395	3.5758	-1.3739	3.8441	0.3876	1.0352	-2.8027	-0.2737	0.1107	0.2442	1.7222	-0.0186	-0.5978	1.3146	-0.0765	-0.3277	0.9641	-0.0868	1.9081	18.3151	-44.3827	14.5951
13	3.0683	-0.4996	-0.8354	1.8149	-1.0919	3.2874	0.0756	0.6772	-1.0167	0.1133	0.1107	-0.3787	0.9756	1.9674	0.4011	-0.2451	0.754	0.4456	3.1074	-0.7541	0.9953	67.7046	-30.7853	12.6048
14	7.802	0.0701	-1.1866	1.8848	2.5167	6.0454	0.0042	1.8926	2.0385	-0.5151	-0.9429	0.001	-0.9471	0.6442	-0.2159	1.1905	-0.7017	0.2102	2.7168	0.4853	1.9722	59.835	-7.7804	2.584
15	2.8961	0.1422	-0.4705	0.1897	-0.3195	4.1894	0.3648	2.3285	-0.0732	-0.3277	0.3892	-0.2161	-0.0229	2.7221	-0.006	0.4947	0.0277	0.2114	2.3884	-0.1816	0.8326	64.8756	-24.2219	16.1701
16	2.0072	0.995	0.3687	4.6363	-1.1915	8.755	-0.2415	2.2356	1.1065	-0.5772	-0.0901	-0.7485	-0.4184	2.3469	-0.167	0.6571	-0.1732	0.1352	2.3034	-0.2871	0.8861	59.426	-19.3042	14.9545
17	6.7905	-0.4665	1.4588	1.0919	0.6366	6.1568	0.2589	1.8038	-0.4398	-0.6055	-0.517	-0.367	-0.3573	1.48	-0.1657	0.7196	0.5008	0.3601	1.8304	-0.1022	0.508	55.2771	-23.2183	14.241
18	5.1585	-2.262	-1.5269	2.4893	-1.4647	3.4995	0.8543	1.5324	-2.0458	-0.0438	-0.0619	0.0462	1.4494	1.564	-0.7269	0.8673	0.505	-0.0063	1.1101	-0.6015	2.0427	52.4103	-41.9216	17.4965
19	1.4539	-0.6231	-0.5041	3.9968	-2.6468	3.9823	0.1695	1.367	-0.6714	-0.4	-0.6708	-0.2313	0.9836	1.1066	-0.5872	0.8464	0.4331	0.0995	2.9034	-0.8978	0.4178	57.876	-31.6968	8.4078
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21	6.7008	0.2156	3.4652	5.0082	1.4218	9.1893	-0.1683	0.9307	0.7646	-0.1627	0.0431	-0.6748	-1.3607	1.7941	-0.0393	0.8733	-0.1554	0.2751	1.4776	-0.2133	0.7895	48.8505	-18.5075	20.6866
22	7.4448	-0.6293	1.0797	5.8774	0.9822	4.6159	0.3704	2.2017	-0.9211	-0.5298	-0.0481	-0.217	0.5081	1.7565	-0.2453	0.5771	0.124	-0.1564	1.3097	-0.2553	0.5303	48.4887	-25.3368	11.2581
23	5.9261	3.6256	-2.446	9.6825	-4.1961	1.9862	0.4034	3.3591	-0.0061	-1.2361	-0.2538	-0.5139	-0.2258	2.1618	-0.1524	1.1466	-0.0748	0.0259	2.405	-0.331	1.0667	47.6972	-20.6993	0.1257
24	4.257	-4.2498	2.8475	4.8279	-1.8026	3.7529	0.5772	2.7032	0.1062	-0.41	-0.1342	-0.2061	-0.0937	1.8215	-0.3224	0.7623	-0.134	0.0703	2.6032	-0.2786	0.9312	57.1972	-21.4908	4.3995
25	1.4988	0.1078	0.6729	2.3133	-1.4784	1.3117	0.095	1.1893	-0.7085	-0.1486	-0.0226	-0.146	0.8541	1.5851	0.367	0.8161	0.9346	0.7304	2.9477	-0.4775	0.5683	65.0247	-34.6515	10.3311
26	8.8303	-2.7606	2.8283	5.1857	-0.8424	6.7084	-0.3075	-1.7578	-1.3152	0.6332	0.3937	-0.7751	0.4435	0.8014	-0.372	0.6864	0.0776	0.131	1.3159	-0.0297	1.0352	56.4281	-27.0699	54.8948
27	7.5825	-1.4585	1.9814	3.3636	-0.2174	5.1811	-0.0813	-0.5377	0.1838	0.5017	0.63	-0.0147	0.2362	0.3859	-0.3098	0.6243	-0.0259	0.0643	0.8424	0.0309	0.7539	55.8473	-26.2776	45.1388
28	8.9393	-1.368	0.4154	4.4312	0.32	6.5868	0.3472	0.0482	-1.5588	-0.2759	0.2045	-0.1406	0.7113	1.2357	-0.5294	0.6624	0.2225	-0.0954	0.9115	-0.0067	0.8086	55.5718	-33.7559	38.0794
29	7.7082	-0.7833	1.2339	2.5941	-0.077	5.8402	0.0554	-1.1138	-1.1721	0.5523	0.2749	-0.0407	0.5104	-0.049	-0.5042	0.8193	0.0716	-0.0296	0.7664	0.267	0.9748	43.7204	-31.5138	38.8373
30	2.0652	0.3696	1.0259	1.8675	-1.1633	4.8861	0.2636	-0.3101	-2.1953	0.678	0.092	0.1833	0.9301	0.1025	-0.4161	0.9012	0.0813	-0.0606	0.6952	0.1689	0.9827	39.3865	-35.0632	34.6809
31	6.6992	-0.4296	2.6503	2.0481	-0.1651	4.2886	0.2677	0.3088	-1.2644	-0.0575	0.1081	0.4759	0.4345	0.3131	-0.3839	0.5106	0.0856	-0.0151	0.3877	-0.1087	0.6442	32.9074	-29.8725	21.5461
32	7.9099	-0.6154	1.5747	9.9249	-2.6575	7.392	0.7351	1.7354	0.1809	-1.0968	0.133	0.4802	-0.3448	-0.5025	-0.0276	0.578	0.1487	0.1855	0.8641	-0.1434	0.9541	20.2066	-20.2349	7.7745
33	7.1312	-0.7509	2.1426	3.8935	0.1476	5.8663	0.248	0.8052	0.3362	-0.603	-0.5387	0.8051	-0.8326	-0.4729	0.1317	0.852	0.2859	0.028	0.9538	0.0585	0.7748	12.6957	-13.4987	11.9514
34	5.7269	-1.1984	1.3581	2.6336	0.2367	4.1325	-0.3593	-0.2566	1.456	0.4188	-0.0926	0.0063	-1.0665	-0.7531	0.335	0.7786	0.2204	-0.0005	0.4081	-0.0721	0.8911	20.1907	-4.6737	31.4163
35	6.295	-2.7769	1.3716	3.6738	0.4757	6.3469	-0.7225	-1.5809	2.4357	0.9064	-0.5931	0.1578	-1.7663	-0.3701	0.3533	1.799	0.3262	-0.3857	0.8906	-0.4814	1.6983	23.9669	7.043	40.8659
36	7.2326	-0.9667	1.4604	3.4343	0.1016	3.6698	-0.3639	-1.2197	0.5098	0.6921	0.0171	0.0942	-1.2453	-0.8097	0.1469	0.9352	0.2292	-0.0479	0.6574	-0.0106	0.548	31.8627	-10.4702	41.8619
37	5.6122	-0.7489	4.6652	1.7322	-0.2998	9.3153	-0.3597	1.1914	0.7497	0.0726	0.0782	-0.348	-0.9706	1.464	0.2548	2.1927	-0.333	0.1103	1.9698	0.1297	2.0733	46.9559	-11.1812	25.2611
38	5.2377	-2.6016	1.9093	4.6512	-1.68	3.4112	-0.9667	-0.8479	2.0738	-0.0017	-0.1575	-0.6637	-1.9807	-0.1378	0.2982	1.4571	-0.1213	-0.3241	0.3502	-0.3374	1.4931	35.4067	1.4832	39.1695

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	(CHAIN A AND RESID 143:158 )	A	143 - 158
2	X-RAY DIFFRACTION	2	(CHAIN A AND RESID 159:171 )	A	159 - 171
3	X-RAY DIFFRACTION	3	(CHAIN A AND RESID 172:188 )	A	172 - 188
4	X-RAY DIFFRACTION	4	(CHAIN A AND RESID 189:208 )	A	189 - 208
5	X-RAY DIFFRACTION	5	(CHAIN A AND RESID 209:214 )	A	209 - 214
6	X-RAY DIFFRACTION	6	(CHAIN A AND RESID 215:251 )	A	215 - 251
7	X-RAY DIFFRACTION	7	(CHAIN A AND RESID 267:274 )	A	267 - 274
8	X-RAY DIFFRACTION	8	(CHAIN A AND RESID 275:286 )	A	275 - 286
9	X-RAY DIFFRACTION	9	(CHAIN A AND RESID 287:298 )	A	287 - 298
10	X-RAY DIFFRACTION	10	(CHAIN A AND RESID 299:304 )	A	299 - 304
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(CHAIN A AND RESID 305:312 )	A	305 - 312
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(CHAIN A AND RESID 313:320 )	A	313 - 320
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(CHAIN A AND RESID 357:369 )	A	357 - 369
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(CHAIN A AND RESID 370:381 )	A	370 - 381
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(CHAIN A AND RESID 382:427 )	A	382 - 427
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(CHAIN A AND RESID 428:435 )	A	428 - 435
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(CHAIN A AND RESID 460:469 )	A	460 - 469
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(CHAIN A AND RESID 470:474 )	A	470 - 474
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(CHAIN A AND RESID 475:484 )	A	475 - 484
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(CHAIN A AND RESID 485:489 )	A	485 - 489
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(CHAIN A AND RESID 497:502 )	A	497 - 502
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(CHAIN A AND RESID 503:507 )	A	503 - 507
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(CHAIN A AND RESID 508:512 )	A	508 - 512
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(CHAIN A AND RESID 513:517 )	A	513 - 517
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(CHAIN A AND RESID 518:522 )	A	518 - 522
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(CHAIN A AND RESID 544:560 )	A	544 - 560
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(CHAIN A AND RESID 561:585 )	A	561 - 585
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(CHAIN A AND RESID 586:612 )	A	586 - 612
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(CHAIN A AND RESID 613:637 )	A	613 - 637
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(CHAIN A AND RESID 638:652 )	A	638 - 652
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(CHAIN A AND RESID 653:725 )	A	653 - 725
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(CHAIN A AND RESID 726:753 )	A	726 - 753
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(CHAIN A AND RESID 760:837 )	A	760 - 837
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(CHAIN A AND RESID 838:967 )	A	838 - 967
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(CHAIN A AND RESID 981:1003 )	A	981 - 1003
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(CHAIN A AND RESID 1004:1038 )	A	1004 - 1038
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(CHAIN A AND RESID 1039:1045 )	A	1039 - 1045
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(CHAIN A AND RESID 1046:1091 )	A	1046 - 1091

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新型コロナ情報

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