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- PDB-4e86: Crystal structure of human alpha-defensin 5, HD5 (Leu29Aba mutant) -
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Open data
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Basic information
Entry | Database: PDB / ID: 4.0E+86 | ||||||
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Title | Crystal structure of human alpha-defensin 5, HD5 (Leu29Aba mutant) | ||||||
![]() | Defensin-5 | ||||||
![]() | ANTIMICROBIAL PROTEIN / mutant Leu29Aba / beta-sheet / antimicrobial peptide / Paneth cells | ||||||
Function / homology | ![]() positive regulation of membrane permeability / Defensins / disruption of plasma membrane integrity in another organism / killing by host of symbiont cells / Alpha-defensins / defense response to fungus / transport vesicle / extracellular matrix / innate immune response in mucosa / secretory granule ...positive regulation of membrane permeability / Defensins / disruption of plasma membrane integrity in another organism / killing by host of symbiont cells / Alpha-defensins / defense response to fungus / transport vesicle / extracellular matrix / innate immune response in mucosa / secretory granule / positive regulation of interleukin-8 production / Golgi lumen / antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide / midbody / antibacterial humoral response / cellular response to lipopolysaccharide / protein homotetramerization / secretory granule lumen / defense response to Gram-negative bacterium / killing of cells of another organism / defense response to Gram-positive bacterium / intracellular membrane-bounded organelle / innate immune response / protein homodimerization activity / extracellular space / extracellular region Similarity search - Function | ||||||
Biological species | ![]() | ||||||
Method | ![]() ![]() ![]() | ||||||
![]() | Wu, X. / Pazgier, M. | ||||||
![]() | ![]() Title: Functional determinants of human enteric {alpha}-defensin HD5: crucial role for hydrophobicity at dimer interface. Authors: Rajabi, M. / Ericksen, B. / Wu, X. / de Leeuw, E. / Zhao, L. / Pazgier, M. / Lu, W. | ||||||
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Structure visualization
Structure viewer | Molecule: ![]() ![]() |
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PDB format | ![]() | 101 KB | Display | ![]() |
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Full document | ![]() | 493.6 KB | Display | |
Data in XML | ![]() | 13.2 KB | Display | |
Data in CIF | ![]() | 17.9 KB | Display | |
Arichive directory | ![]() ![]() | HTTPS FTP |
-Related structure data
Related structure data | ![]() 4e82C ![]() 4e83C ![]() 1zmpS S: Starting model for refinement C: citing same article ( |
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Unit cell |
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Noncrystallographic symmetry (NCS) | NCS domain:
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