PDB-4dlo: Crystal structure of the GAIN and HormR domains of brain angiogen...

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4dlo

タイトル

Crystal structure of the GAIN and HormR domains of brain angiogenesis inhibitor 3 (BAI3)

要素

Brain-specific angiogenesis inhibitor 3

キーワード

SIGNALING PROTEIN / GAIN domain / includes GPS motif / autoproteolytic fold / extracellular

機能・相同性

機能・相同性情報

motor learning / regulation of synapse pruning / cerebellar climbing fiber to Purkinje cell synapse / maintenance of synapse structure / regulation of synapse maturation / myoblast fusion / positive regulation of synapse assembly / neuron remodeling / regulation of dendrite morphogenesis / synaptic cleft ...
類似検索 - 分子機能

生物種

Homo sapiens (ヒト)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

単波長異常分散 / 解像度: 2.3 Å

データ登録者

Arac, D. / Boucard, A.A. / Bolliger, M.F. / Nguyen, J. / Soltis, M. / Sudhof, T.C. / Brunger, A.T.

引用

ジャーナル: Embo J. / 年: 2012
タイトル: A novel evolutionarily conserved domain of cell-adhesion GPCRs mediates autoproteolysis.
著者: Arac, D. / Boucard, A.A. / Bolliger, M.F. / Nguyen, J. / Soltis, S.M. / Sudhof, T.C. / Brunger, A.T.

履歴

登録	2012年2月6日	登録サイト: RCSB / 処理サイト: RCSB
改定 1.0	2012年2月22日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2012年4月4日	Group: Database references
改定 1.2	2014年7月16日	Group: Refinement description
改定 2.0	2020年7月29日	Group: Atomic model / Data collection ...Atomic model / Data collection / Database references / Derived calculations / Structure summary カテゴリ: atom_site / atom_site_anisotrop ...atom_site / atom_site_anisotrop / chem_comp / entity / pdbx_branch_scheme / pdbx_chem_comp_identifier / pdbx_entity_branch / pdbx_entity_branch_descriptor / pdbx_entity_branch_link / pdbx_entity_branch_list / pdbx_entity_nonpoly / pdbx_nonpoly_scheme / pdbx_struct_assembly_gen / struct_asym / struct_conn / struct_ref_seq_dif / struct_site / struct_site_gen Item: _atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x ..._atom_site.B_iso_or_equiv / _atom_site.Cartn_x / _atom_site.Cartn_y / _atom_site.Cartn_z / _atom_site.auth_asym_id / _atom_site.auth_atom_id / _atom_site.auth_comp_id / _atom_site.auth_seq_id / _atom_site.label_asym_id / _atom_site.label_atom_id / _atom_site.label_comp_id / _atom_site.label_entity_id / _atom_site.type_symbol / _atom_site_anisotrop.U[1][1] / _atom_site_anisotrop.U[1][2] / _atom_site_anisotrop.U[1][3] / _atom_site_anisotrop.U[2][2] / _atom_site_anisotrop.U[2][3] / _atom_site_anisotrop.U[3][3] / _atom_site_anisotrop.id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_comp_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_auth_seq_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_asym_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_atom_id / _atom_site_anisotrop.pdbx_label_comp_id / _atom_site_anisotrop.type_symbol / _chem_comp.name / _chem_comp.type / _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list / _struct_conn.pdbx_dist_value / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag / _struct_conn.pdbx_role / _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr1_label_asym_id / _struct_conn.ptnr1_label_atom_id / _struct_conn.ptnr1_label_comp_id / _struct_conn.ptnr1_label_seq_id / _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id / _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id / _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id / _struct_conn.ptnr2_label_asym_id / _struct_conn.ptnr2_label_comp_id / _struct_ref_seq_dif.details 解説: Carbohydrate remediation / Provider: repository / タイプ: Remediation
改定 2.1	2024年10月16日	Group: Data collection / Database references / Structure summary カテゴリ: chem_comp / chem_comp_atom ...chem_comp / chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _chem_comp.pdbx_synonyms / _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4dlo.cif.gz	300.4 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4dlo.ent.gz	246.6 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4dlo.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4dlo_validation.pdf.gz	1.5 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4dlo_full_validation.pdf.gz	1.6 MB	表示
XML形式データ	4dlo_validation.xml.gz	33.6 KB	表示
CIF形式データ	4dlo_validation.cif.gz	43.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/4dlo ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/dl/4dlo	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4dlqC C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	2qhf-d 2o12-d 3qrw-d 4hlq-3 1nkz-d 5ygp-4 5b3z-2 4726 4bai-d 6ae2-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

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「今月の分子」の関連する項目	#184 - 2015年4月グルカゴン (Glucagon) 類似性 (11)

登録構造単位

A: Brain-specific angiogenesis inhibitor 3

B: Brain-specific angiogenesis inhibitor 3

ヘテロ分子

89.1 kDa, 2 ポリマー
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1

A: Brain-specific angiogenesis inhibitor 3

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.7 kDa, 1 ポリマー
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2

B: Brain-specific angiogenesis inhibitor 3

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
44.4 kDa, 1 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	123.364, 128.008, 160.320
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

-
タンパク質 , 1種, 2分子 AB

#1: タンパク質	Brain-specific angiogenesis inhibitor 3 分子量: 43255.230 Da / 分子数: 2 断片: GAIN and HormR domains of BAI3, UNP residues 498-868 由来タイプ: 組換発現 / 由来: (組換発現) Homo sapiens (ヒト) / 遺伝子: BAI3, KIAA0550 / プラスミド: pACGP67a / 発現宿主: Trichoplusia Ni (イラクサキンウワバ) / 参照: UniProt: O60242

-
糖 , 3種, 4分子

#2: 多糖

beta-L-fucopyranose-(1-3)-[2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)]2-acetamido-2-deoxy-beta- ...

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 570.542 Da / 分子数: 2 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
LFucpb1-3[DGlcpNAcb1-4]DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1221m-1b_1-5]/1-2-1/a3-b1_a4-c1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(3+1)][b-L-Fucp]{}[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#3: 多糖

2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose

タイプ: oligosaccharide / 分子量: 424.401 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現

記述子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-	Glycam Condensed Sequence	GMML 1.0
WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1	WURCS	PDB2Glycan 1.1.0
[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}	LINUCS	PDB-CARE

#5: 糖

ChemComp-NAG / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose / N-acetyl-beta-D-glucosamine / 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose / 2-acetamido-2-deoxy-glucose / N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE / N-アセチル-β-D-グルコサミン

タイプ: D-saccharide, beta linking / 分子量: 221.208 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 組換発現 / 式: C₈H₁₅NO₆

識別子	タイプ	プログラム
DGlcpNAcb	CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0
N-acetyl-b-D-glucopyranosamine	COMMON NAME	GMML 1.0
b-D-GlcpNAc	IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL	PDB-CARE 1.0
GlcNAc	SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL	GMML 1.0

-
非ポリマー , 2種, 175分子

#4: 化合物	ChemComp-GOL / GLYCEROL / GLYCERIN / PROPANE-1,2,3-TRIOL / グリセロ-ル分子量: 92.094 Da / 分子数: 9 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₃H₈O₃
#6: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 166 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O

-
詳細

Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 2

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 3.66 Å³/Da / 溶媒含有率: 66.38 %
結晶化	温度: 293 K / 手法: 蒸気拡散法, ハンギングドロップ法 / pH: 5.5 詳細: 15% PEG6000, 0.1M sodium citrate, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K

-
データ収集

回折

ID	平均測定温度 (K)	Crystal-ID
1	70	1
2	70	1

放射光源

由来	サイト	ビームライン	ID	波長 (Å)
シンクロトロン	SSRL	BL9-2	1	1
シンクロトロン	SSRL	BL9-2	2	1.6

検出器

タイプ: MARMOSAIC 325 mm CCD / 検出器: CCD / 日付: 2009年7月7日

放射

ID	モノクロメーター	プロトコル	単色(M)・ラウエ(L)	散乱光タイプ	Wavelength-ID
1	double crystal monochromator	SINGLE WAVELENGTH	M	x-ray	1
2	double crystal monochromator	SINGLE WAVELENGTH	M	x-ray	1

放射波長

ID	波長 (Å)	相対比
1	1	1
2	1.6	1

反射

解像度: 2.3→44.4 Å / Num. all: 56590 / Num. obs: 56485 / % possible obs: 99.67 % / Observed criterion σ(F): 0 / Observed criterion σ(I): -3

反射シェル

解像度 (Å)	Diffraction-ID	% possible all
2.3-2.38	1,2	100
2.38-2.48	1,2	100
2.48-2.59	1,2	100
2.59-2.73	1,2	100
2.73-2.9	1,2	100
4.95-50	1,2	99.9

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
HKL-2000		データ収集
SHARP		位相決定
PHENIX	(phenix.refine: 1.6.1_357)	精密化
HKL-2000		データ削減
HKL-2000		データスケーリング

精密化

構造決定の手法:

単波長異常分散 / 解像度: 2.3→44.4 Å / SU ML: 0.3 / σ(F): 1.34 / 位相誤差: 21.98 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.2281	2903	5.14 %	random
R_work	0.186	-	-	-
obs	0.1882	56485	99.67 %	-
all	-	56590	-	-

溶媒の処理

減衰半径: 0.9 Å / VDWプローブ半径: 1.11 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 64.135 Å² / k_sol: 0.37 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	1.1237 Å²	0 Å²	-0 Å²
2-	-	4.9356 Å²	0 Å²
3-	-	-	-6.0593 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 2.3→44.4 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5417	0	172	166	5755

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.009	5707
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.14	7724
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	17.986	2127
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.074	904
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.005	960

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
2.3-2.3358	0.3175	125	0.2605	2408	X-RAY DIFFRACTION	95
2.3358-2.3761	0.2851	124	0.2369	2539	X-RAY DIFFRACTION	100
2.3761-2.4193	0.271	165	0.2322	2495	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4193-2.4658	0.2819	136	0.2333	2532	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4658-2.5161	0.2852	128	0.2211	2518	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5161-2.5708	0.2682	149	0.2038	2522	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5708-2.6306	0.2303	137	0.1958	2554	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6306-2.6964	0.2387	143	0.1887	2538	X-RAY DIFFRACTION	100
2.6964-2.7693	0.2717	136	0.1884	2518	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7693-2.8508	0.2422	142	0.1912	2539	X-RAY DIFFRACTION	100
2.8508-2.9428	0.2381	129	0.1804	2546	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9428-3.0479	0.2212	136	0.1757	2550	X-RAY DIFFRACTION	100
3.0479-3.1699	0.2113	138	0.1657	2561	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1699-3.3141	0.2033	118	0.1709	2559	X-RAY DIFFRACTION	100
3.3141-3.4888	0.1957	134	0.17	2560	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4888-3.7073	0.1978	150	0.1651	2568	X-RAY DIFFRACTION	100
3.7073-3.9934	0.2252	144	0.1693	2567	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9934-4.3949	0.2036	129	0.1614	2584	X-RAY DIFFRACTION	100
4.3949-5.0301	0.1962	148	0.1463	2588	X-RAY DIFFRACTION	100
5.0301-6.3345	0.2154	147	0.1894	2621	X-RAY DIFFRACTION	100
6.3345-44.4222	0.2387	145	0.1997	2715	X-RAY DIFFRACTION	100

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.2417	-0.1039	0.1048	4.8877	-1.1339	1.2259	0.0129	0.0526	-0.1002	0.2972	0.2379	1.0919	-0.2445	-0.2418	-0.2808	0.1848	-0.0135	0.0507	0.3032	0.0685	0.4385	-53.0245	23.1004	1.3773
2	3.627	0.9778	0.1706	1.0124	0.2559	0.4329	0.3986	0.3034	0.2426	0.0975	-0.2602	-0.1392	-0.0706	0.3914	-0.1184	0.234	-0.0311	0.0489	0.3626	0.0454	0.4059	-41.2561	23.7607	5.4364
3	9.5984	4.493	3.828	4.7386	1.5817	2.1381	0.399	-2.3275	-0.4324	1.5572	-0.8808	-0.2846	0.0696	-0.6003	0.1072	0.734	-0.1621	-0.146	0.7721	0.1387	0.4586	-17.0915	27.4378	22.7916
4	4.1893	-0.2253	1.302	0.1295	0.47	3.1841	0.3996	0.4402	-1.0619	-0.1539	-0.1949	0.1875	1.0074	-0.0135	-0.1168	0.5487	-0.023	-0.0022	0.2662	-0.0638	0.729	-20.1115	19.8483	7.8851
5	3.2973	2.1095	-0.7867	2.4656	-0.8937	1.5285	0.2582	-0.0997	-0.0547	0.2259	-0.2072	0.0347	-0.0417	-0.1102	-0.0172	0.2114	-0.0944	0.0294	0.279	-0.0222	0.2898	-18.8168	33.422	9.5386
6	0.86	0.4004	-0.4738	1.0961	-0.6311	0.2817	-0.0377	0.1317	-0.1673	-0.1915	-0.1872	-0.19	0.0574	0.1302	0.1816	0.2279	-0.0052	0.028	0.3385	0.0009	0.3208	-3.1792	39.0451	-2.9666
7	1.3778	0.209	-0.8425	0.8713	-0.8857	4.3433	0.0714	-0.0688	0.3058	0.0603	-0.0973	0.2126	-0.5785	-0.5612	0.0095	0.209	0.0469	0.0147	0.2731	0.0033	0.3122	-13.5387	47.7484	-0.663
8	0.501	0.1946	0.2983	1.0041	-1.8757	2.6398	-0.1917	0.0775	0.0842	0.0301	0.1621	0.2586	-0.0485	-0.8267	0.0083	0.1724	-0.02	0.0082	0.4589	-0.0097	0.2806	-20.927	46.9623	-10.2622
9	1.7178	3.6129	-0.2845	7.8519	-1.9465	9.7774	0.5065	0.755	1.142	-0.4432	-0.1683	2.1721	-0.0612	-0.8028	-0.3369	0.4582	0.0407	-0.1115	0.5625	0.1136	0.8944	-21.6947	76.6955	-79.4547
10	0.4313	0.9773	-0.5131	1.4583	-0.6078	1.3413	0.1901	0.008	-0.0847	0.3052	-0.1377	-0.078	-0.1049	0.0776	-0.0442	0.2454	-0.0739	0.0008	0.2776	-0.0176	0.2919	-13.6044	59.1171	-65.9456
11	2.5444	0.4019	0.3372	2.6534	-0.8784	0.5853	-0.106	0.2094	-0.3268	-0.6941	0.2201	0.1375	1.1478	-0.6103	-0.3097	0.479	-0.3854	-0.094	0.4585	0.001	0.2464	-27.6779	44.6493	-46.649
12	0.963	0.2362	0.8428	0.2533	0.1672	5.2204	-0.1894	-0.0719	-0.2841	-0.0081	0.0497	0.099	0.8159	-0.6978	0.0749	0.4059	-0.095	0.0133	0.4199	0.0661	0.3149	-22.3528	48.0676	-42.1666
13	1.2612	-0.4749	2.3787	1.9155	-1.272	9.8574	-0.5212	-0.208	-0.0543	0.4261	0.2042	-0.0869	-1.0771	-1.2092	0.2239	0.3917	0.0637	-0.064	0.4535	0.0228	0.243	-22.8873	54.9443	-33.1928
14	4.0021	-0.5638	2.5468	2.428	-3.5174	6.3899	-1.1743	-0.9231	0.3494	1.2285	0.362	-0.2645	-3.0221	-0.1875	0.7021	1.3157	0.2383	-0.2581	0.4523	-0.1128	0.3286	-18.736	64.0151	-18.3488
15	0.43	-0.5879	1.3348	0.6196	-2.0146	6.2427	-1.1349	0.4907	0.6704	0.5765	0.3409	-0.258	-2.9279	-0.1816	0.8344	1.5639	-0.1081	-0.3406	0.4134	0.0716	0.4385	-17.8403	68.6609	-35.1951
16	1.7173	-0.6511	1.3435	0.2225	-0.3343	4.9045	-0.949	0.1008	0.9861	1.0053	-0.095	-0.6899	-3.3651	0.2583	0.9565	2.4944	-0.0526	-0.6746	0.2373	0.0541	0.8087	-16.867	76.6891	-31.1689

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details	Auth asym-ID	Auth seq-ID
1	X-RAY DIFFRACTION	1	( CHAIN A AND RESID 508:527 )	A	508 - 527
2	X-RAY DIFFRACTION	2	( CHAIN A AND RESID 528:572 )	A	528 - 572
3	X-RAY DIFFRACTION	3	( CHAIN A AND RESID 573:601 )	A	573 - 601
4	X-RAY DIFFRACTION	4	( CHAIN A AND RESID 602:611 )	A	602 - 611
5	X-RAY DIFFRACTION	5	( CHAIN A AND RESID 612:690 )	A	612 - 690
6	X-RAY DIFFRACTION	6	( CHAIN A AND RESID 691:740 )	A	691 - 740
7	X-RAY DIFFRACTION	7	( CHAIN A AND RESID 741:803 )	A	741 - 803
8	X-RAY DIFFRACTION	8	( CHAIN A AND RESID 804:866 )	A	804 - 866
9	X-RAY DIFFRACTION	9	( CHAIN B AND RESID 501:509 )	B	501 - 509
10	X-RAY DIFFRACTION	10	( CHAIN B AND RESID 510:563 )	B	510 - 563
11	X-RAY DIFFRACTION	11	( CHAIN B AND RESID 564:595 )	B	564 - 595
12	X-RAY DIFFRACTION	12	( CHAIN B AND RESID 596:627 )	B	596 - 627
13	X-RAY DIFFRACTION	13	( CHAIN B AND RESID 628:702 )	B	628 - 702
14	X-RAY DIFFRACTION	14	( CHAIN B AND RESID 703:765 )	B	703 - 765
15	X-RAY DIFFRACTION	15	( CHAIN B AND RESID 766:796 )	B	766 - 796
16	X-RAY DIFFRACTION	16	( CHAIN B AND RESID 801:864 )	B	801 - 864

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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