PDB-4cqk: Crystal structure of ligand-bound NaD1

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4cqk

タイトル

Crystal structure of ligand-bound NaD1

要素

FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

キーワード

PLANT PROTEIN / INNATE IMMUNITY

機能・相同性

機能・相同性情報

vacuole / defense response to fungus / killing of cells of another organism / extracellular region
類似検索 - 分子機能

生物種

NICOTIANA ALATA (ヤバネタバコ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.6 Å

データ登録者

Lay, F.T. / Mills, G.M. / Poon, I.K.H. / Baxter, A.A. / Hulett, M.D. / Kvansakul, M.

引用

ジャーナル: Elife / 年: 2014
タイトル: Phosphoinositide-Mediated Oligomerization of a Defensin Induces Cell Lysis.
著者: Poon, I.K.H. / Baxter, A.A. / Lay, F.T. / Mills, G.D. / Adda, C.G. / Payne, J.A. / Phan, T.K. / Ryan, G.F. / White, J.A. / Veneer, P.K. / Van Der Weerden, N.L. / Anderson, M.A. / Kvansakul, M. / Hulett, M.D.

履歴

登録	2014年2月17日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2014年4月16日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_database_status / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.2	2024年11月13日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4cqk.cif.gz	297.3 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4cqk.ent.gz	253.3 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4cqk.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

文書・要旨	4cqk_validation.pdf.gz	4.1 MB	表示	wwPDB検証レポート
文書・詳細版	4cqk_full_validation.pdf.gz	4.1 MB	表示
XML形式データ	4cqk_validation.xml.gz	40.6 KB	表示
CIF形式データ	4cqk_validation.cif.gz	58.7 KB	表示
アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cq/4cqk ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/cq/4cqk	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4aazS S: 精密化の開始モデル
類似構造データ	3ux7-6 5z5u-d 1fv0-2 3cbi-1 1zr8-d 4uy1-1 5g3m-2 5wuu-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#199 - 2016年7月モネリン (Monellin) 類似性 (1) #38 - 2003年2月カリウムチャネル (Potassium Channels) 類似性 (1)

登録構造単位

A: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

B: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

C: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

D: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

E: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

F: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

G: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

H: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

I: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

J: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

K: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

L: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

M: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

N: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

87.3 kDa, 14 ポリマー
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1

A: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

C: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.6 kDa, 2 ポリマー
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2

I: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

K: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.3 kDa, 2 ポリマー
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3

F: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

H: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.4 kDa, 2 ポリマー
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4

L: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

M: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.5 kDa, 2 ポリマー
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5

E: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

N: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.7 kDa, 2 ポリマー
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6

D: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

G: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.4 kDa, 2 ポリマー
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7

B: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

J: FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN

ヘテロ分子

登録者・ソフトウェアが定義した集合体
12.2 kDa, 2 ポリマー
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単位格子

Length a, b, c (Å)	79.640, 132.040, 153.010
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	20
Space group name H-M	C222₁

Components on special symmetry positions

ID	モデル	要素
1	1	M-1049- SO4
2	1	M-2028- HOH

#1: タンパク質・ペプチド	FLOWER-SPECIFIC DEFENSIN / NAD1 分子量: 5315.377 Da / 分子数: 14 / 断片: RESIDUES 26-72 / 由来タイプ: 天然 / 由来: (天然) NICOTIANA ALATA (ヤバネタバコ) / 組織: FLOWER / 参照: UniProt: Q8GTM0
#2: 化合物	ChemComp-PIO / [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate / dioctanoyl l-alpha-phosphatidyl-d-myo-inositol 4,5-diphosphate / 1-O-(1-O,2-O-ジオクタノイル-L-グリセロ-3-ホスホ)-D-myo-イノシト-ル4,5-ビスりん酸分子量: 746.566 Da / 分子数: 14 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₂₅H₄₉O₁₉P₃
#3: 化合物	ChemComp-SO4 / SULFATE ION / 硫酸ジアニオン分子量: 96.063 Da / 分子数: 20 / 由来タイプ: 合成 / 式: SO₄
#4: 化合物	ChemComp-MRD / (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL / (4R)-2-メチル-2,4-ペンタンジオ-ル分子量: 118.174 Da / 分子数: 4 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₆H₁₄O₂ / コメント: 沈殿剤*YM
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 816 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.71 Å³/Da / 溶媒含有率: 55 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 7 詳細: 0.2 M AMMONIUM SULFATE, 7 % PEG3350, 32 % MPD, 0.1 M IMIDAZOLE PH 7

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: Australian Synchrotron / ビームライン: MX2 / 波長: 0.95
検出器	タイプ: ADSC QUANTUM 315r / 検出器: CCD / 日付: 2011年3月8日
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.95 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.6→40.37 Å / Num. obs: 105745 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): 2 / 冗長度: 6.7 % / B_iso Wilson estimate: 14.97 Å² / R_merge(I) obs: 0.09 / Net I/σ(I): 11.6
反射シェル	解像度: 1.6→1.69 Å / 冗長度: 5.4 % / R_merge(I) obs: 0.62 / Mean I/σ(I) obs: 2.2 / % possible all: 94.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
PHENIX	(PHENIX.REFINE)	精密化
XDS		データ削減
SCALA		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 4AAZ

4aaz

解像度: 1.6→40.362 Å / SU ML: 0.17 / σ(F): 0 / 位相誤差: 17.19 / 立体化学のターゲット値: ML

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.1835	5084	5 %
R_work	0.1549	-	-
obs	0.1563	102135	96.24 %

溶媒の処理

減衰半径: 0.53 Å / VDWプローブ半径: 0.7 Å / 溶媒モデル: FLAT BULK SOLVENT MODEL / B_sol: 46.314 Å² / k_sol: 0.414 e/Å³

原子変位パラメータ

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	0.3844 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	1.9169 Å²	0 Å²
3-	-	-	-2.3012 Å²

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.6→40.362 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	5096	0	790	816	6702

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数
X-RAY DIFFRACTION	f_bond_d	0.01	6006
X-RAY DIFFRACTION	f_angle_d	1.651	8007
X-RAY DIFFRACTION	f_dihedral_angle_d	21.582	2559
X-RAY DIFFRACTION	f_chiral_restr	0.078	887
X-RAY DIFFRACTION	f_plane_restr	0.008	911

LS精密化シェル

解像度 (Å)	R_factor R_free	Num. reflection R_free	R_factor R_work	Num. reflection R_work	Refine-ID	% reflection obs (%)
1.6-1.6182	0.2924	149	0.2533	2726	X-RAY DIFFRACTION	82
1.6182-1.6372	0.2749	128	0.2307	2813	X-RAY DIFFRACTION	84
1.6372-1.6572	0.2878	146	0.2273	2920	X-RAY DIFFRACTION	87
1.6572-1.6782	0.2421	149	0.205	3004	X-RAY DIFFRACTION	90
1.6782-1.7003	0.2194	164	0.1903	3097	X-RAY DIFFRACTION	93
1.7003-1.7235	0.2157	174	0.1869	3109	X-RAY DIFFRACTION	93
1.7235-1.7482	0.2103	164	0.1704	3117	X-RAY DIFFRACTION	94
1.7482-1.7743	0.1919	164	0.1654	3109	X-RAY DIFFRACTION	94
1.7743-1.802	0.1984	178	0.1626	3200	X-RAY DIFFRACTION	95
1.802-1.8315	0.2181	155	0.163	3185	X-RAY DIFFRACTION	96
1.8315-1.8631	0.1801	182	0.1617	3177	X-RAY DIFFRACTION	96
1.8631-1.897	0.1983	172	0.1661	3222	X-RAY DIFFRACTION	96
1.897-1.9335	0.2074	174	0.1623	3243	X-RAY DIFFRACTION	97
1.9335-1.9729	0.1882	156	0.159	3288	X-RAY DIFFRACTION	98
1.9729-2.0158	0.204	170	0.1579	3269	X-RAY DIFFRACTION	98
2.0158-2.0627	0.178	158	0.1478	3337	X-RAY DIFFRACTION	99
2.0627-2.1143	0.1653	169	0.1448	3294	X-RAY DIFFRACTION	99
2.1143-2.1715	0.1597	169	0.1438	3339	X-RAY DIFFRACTION	99
2.1715-2.2354	0.1707	176	0.1445	3337	X-RAY DIFFRACTION	99
2.2354-2.3075	0.1639	190	0.1392	3308	X-RAY DIFFRACTION	99
2.3075-2.39	0.1869	170	0.1335	3350	X-RAY DIFFRACTION	99
2.39-2.4857	0.1692	177	0.1401	3365	X-RAY DIFFRACTION	100
2.4857-2.5988	0.1708	207	0.1418	3306	X-RAY DIFFRACTION	100
2.5988-2.7357	0.2046	193	0.1542	3360	X-RAY DIFFRACTION	100
2.7357-2.9071	0.1939	165	0.1451	3358	X-RAY DIFFRACTION	100
2.9071-3.1315	0.1988	174	0.1564	3393	X-RAY DIFFRACTION	100
3.1315-3.4465	0.1732	163	0.1497	3400	X-RAY DIFFRACTION	100
3.4465-3.9448	0.1415	168	0.1372	3435	X-RAY DIFFRACTION	100
3.9448-4.9686	0.1523	185	0.1334	3439	X-RAY DIFFRACTION	100
4.9686-40.3746	0.2006	195	0.1867	3551	X-RAY DIFFRACTION	99

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	0.1541	0.0637	0.005	0.2781	0.0238	0.1957	0.1442	-0.021	0.0221	0.0454	-0.024	0.0022	-0.0046	0.0824	-0.0145	0.125	-0.0031	0.0135	0.1126	-0.0213	0.1127	-41.9891	-9.8605	26.3583
2	0.3164	0.0278	-0.193	0.4874	-0.084	0.1421	-0.0036	0.0695	0.0632	0.1349	-0.012	0.0189	-0.0644	-0.0419	0.0105	0.1222	0.0079	0.0019	0.091	-0.0023	0.0994	-48.4735	-0.1519	30.5437
3	0.0476	-0.017	-0.0349	0.6123	-0.1448	0.0681	-0.0867	-0.0658	0.0566	0.0628	-0.0063	-0.0841	-0.1229	-0.0025	0.0431	0.1501	0.0008	-0.0006	0.0899	0.0128	0.1024	-44.2426	-9.2632	36.5026
4	0.1134	0.0314	0.1817	0.064	0.0577	0.2508	-0.0055	0.1083	0.0582	0.0807	-0.0364	-0.0475	0.0885	0.1836	0.0055	0.1251	0.0115	-0.0168	0.1027	0.0032	0.0778	-43.0114	-4.6749	25.4425
5	0.8094	-0.2382	-0.2578	0.2144	0.1489	0.1531	-0.1098	0.1396	-0.1132	0.1007	-0.0164	0.0156	0.1455	-0.0447	0.0179	0.1322	0.0096	0.0015	0.1383	-0.033	0.1158	-46.1543	-26.6371	10.3888
6	0.37	-0.1778	0.1324	0.1745	0.0581	0.2524	-0.0079	0.0328	-0.1484	0.0414	0.0722	0.0598	0.1386	0.1673	-0.0484	0.121	0.019	-0.0033	0.0829	-0.017	0.1207	-45.6879	-32.6566	3.7839
7	0.1219	-0.1071	-0.0069	0.9548	-0.1801	0.1413	-0.1572	-0.1456	0.008	-0.0192	0.0153	0.0867	0.0195	0.0758	0.0675	0.1624	0.0296	0.0058	0.1005	0.0047	0.1311	-47.5081	-34.2522	13.8408
8	0.094	0.0757	0.0799	0.1154	0.0509	0.0526	0.0053	-0.0723	0.0732	0.0864	-0.0604	0.1168	0.0482	-0.013	-0.0111	0.151	0.0068	0.0029	0.0932	-0.0229	0.1291	-49.1278	-25.1737	7.0708
9	0.3705	-0.0293	0.1768	0.3664	0.1124	0.2964	-0.0798	-0.033	-0.0861	0.2077	-0.0795	-0.0054	-0.0865	-0.0952	0.022	0.1555	0.0049	0.0247	0.113	-0.0413	0.1328	-42.6877	-15.5161	24.007
10	0.4562	0.1468	0.2341	0.4791	0.1886	0.2095	0.0347	0.1149	-0.0337	0.07	0.021	-0.0713	0.1172	0.0794	-0.0312	0.1218	0.0255	0	0.132	-0.0093	0.1122	-31.6631	-18.9429	12.4432
11	0.0552	-0.1019	0.0717	0.2994	-0.2293	0.1867	0.0001	-0	-0.0889	0.0876	0.0267	-0.1195	0.1184	0.0107	-0.0236	0.1711	0.0482	-0.0209	0.1722	0.0189	0.1484	-28.97	-22.0402	21.8986
12	0.2892	0.0529	0.0301	0.3257	0.0485	0.024	-0.0501	0.0172	0.0155	0.1027	0.0517	0.0535	0.0329	-0.0046	-0.0062	0.1322	0.0259	0.0053	0.1119	0.0002	0.1153	-37.5688	-16.2527	15.8806
13	0.6542	0.2887	-0.1674	0.7776	0.0069	0.5334	0.1051	-0.0266	0.0326	-0.0398	-0.0887	-0.1906	-0.2136	0.0491	-0.0409	0.1985	-0.036	0.0054	0.1842	-0.0166	0.1966	-26.6145	8.1985	21.7803
14	0.1074	-0.0121	-0.0124	0.3009	-0.2082	0.2046	-0.1304	0.0395	0.0682	-0.0063	0.1076	-0.0629	-0.081	-0.0273	0.0202	0.1319	-0.0099	-0.024	0.0885	0.0158	0.1018	-41.3495	12.114	28.8669
15	0.0605	0.1307	0.0328	0.4142	0.0826	0.1062	-0.0869	-0.0492	0.1169	0.1737	-0.1016	-0.0939	-0.1895	-0.0306	0.0341	0.1833	-0.0116	-0.0633	0.0976	0.0105	0.1094	-34.6236	13.6159	33.7931
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10	X-RAY DIFFRACTION	10	(CHAIN C AND RESID 5:24)
11	X-RAY DIFFRACTION	11	(CHAIN C AND RESID 25:28)
12	X-RAY DIFFRACTION	12	(CHAIN C AND RESID 29:47)
13	X-RAY DIFFRACTION	13	(CHAIN D AND RESID 1:4)
14	X-RAY DIFFRACTION	14	(CHAIN D AND RESID 5:20)
15	X-RAY DIFFRACTION	15	(CHAIN D AND RESID 21:27)
16	X-RAY DIFFRACTION	16	(CHAIN D AND RESID 28:47)
17	X-RAY DIFFRACTION	17	(CHAIN E AND RESID 1:4)
18	X-RAY DIFFRACTION	18	(CHAIN E AND RESID 5:17)
19	X-RAY DIFFRACTION	19	(CHAIN E AND RESID 18:25)
20	X-RAY DIFFRACTION	20	(CHAIN E AND RESID 26:47)
21	X-RAY DIFFRACTION	21	(CHAIN F AND RESID 1:9)
22	X-RAY DIFFRACTION	22	(CHAIN F AND RESID 10:27)
23	X-RAY DIFFRACTION	23	(CHAIN F AND RESID 28:40)
24	X-RAY DIFFRACTION	24	(CHAIN F AND RESID 41:47)
25	X-RAY DIFFRACTION	25	(CHAIN G AND RESID 1:4)
26	X-RAY DIFFRACTION	26	(CHAIN G AND RESID 5:21)
27	X-RAY DIFFRACTION	27	(CHAIN G AND RESID 22:38)
28	X-RAY DIFFRACTION	28	(CHAIN G AND RESID 39:47)
29	X-RAY DIFFRACTION	29	(CHAIN H AND RESID 1:7)
30	X-RAY DIFFRACTION	30	(CHAIN H AND RESID 8:24)
31	X-RAY DIFFRACTION	31	(CHAIN H AND RESID 25:42)
32	X-RAY DIFFRACTION	32	(CHAIN H AND RESID 43:47)
33	X-RAY DIFFRACTION	33	(CHAIN I AND RESID 1:8)
34	X-RAY DIFFRACTION	34	(CHAIN I AND RESID 9:27)
35	X-RAY DIFFRACTION	35	(CHAIN I AND RESID 28:39)
36	X-RAY DIFFRACTION	36	(CHAIN I AND RESID 40:47)
37	X-RAY DIFFRACTION	37	(CHAIN J AND RESID 1:11)
38	X-RAY DIFFRACTION	38	(CHAIN J AND RESID 12:27)
39	X-RAY DIFFRACTION	39	(CHAIN J AND RESID 28:40)
40	X-RAY DIFFRACTION	40	(CHAIN J AND RESID 41:47)
41	X-RAY DIFFRACTION	41	(CHAIN K AND RESID 1:9)
42	X-RAY DIFFRACTION	42	(CHAIN K AND RESID 10:27)
43	X-RAY DIFFRACTION	43	(CHAIN K AND RESID 28:43)
44	X-RAY DIFFRACTION	44	(CHAIN K AND RESID 44:47)
45	X-RAY DIFFRACTION	45	(CHAIN L AND RESID 1:7)
46	X-RAY DIFFRACTION	46	(CHAIN L AND RESID 8:20)
47	X-RAY DIFFRACTION	47	(CHAIN L AND RESID 21:39)
48	X-RAY DIFFRACTION	48	(CHAIN L AND RESID 40:47)
49	X-RAY DIFFRACTION	49	(CHAIN M AND RESID 1:10)
50	X-RAY DIFFRACTION	50	(CHAIN M AND RESID 11:26)
51	X-RAY DIFFRACTION	51	(CHAIN M AND RESID 27:34)
52	X-RAY DIFFRACTION	52	(CHAIN M AND RESID 35:47)
53	X-RAY DIFFRACTION	53	(CHAIN N AND RESID 1:10)
54	X-RAY DIFFRACTION	54	(CHAIN N AND RESID 11:27)
55	X-RAY DIFFRACTION	55	(CHAIN N AND RESID 28:39)
56	X-RAY DIFFRACTION	56	(CHAIN N AND RESID 40:47)

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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