PDB-4c38: PKA-S6K1 Chimera with compound 21e (CCT239066) bound

IDまたはキーワード:

登録情報

データベース: PDB / ID: 4c38

タイトル

PKA-S6K1 Chimera with compound 21e (CCT239066) bound

要素

CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA
CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE INHIBITOR PEPTIDE

キーワード

TRANSFERASE/INHIBITOR / TRANSFERASE-INHIBITOR COMPLEX

機能・相同性

機能・相同性情報

CD209 (DC-SIGN) signaling / HDL assembly / Regulation of insulin secretion / Rap1 signalling / Ion homeostasis / PKA activation in glucagon signalling / DARPP-32 events / CREB1 phosphorylation through the activation of Adenylate Cyclase / GPER1 signaling / Loss of Nlp from mitotic centrosomes ...CD209 (DC-SIGN) signaling / HDL assembly / Regulation of insulin secretion / Rap1 signalling / Ion homeostasis / PKA activation in glucagon signalling / DARPP-32 events / CREB1 phosphorylation through the activation of Adenylate Cyclase / GPER1 signaling / Loss of Nlp from mitotic centrosomes / Recruitment of mitotic centrosome proteins and complexes / Loss of proteins required for interphase microtubule organization from the centrosome / Anchoring of the basal body to the plasma membrane / AURKA Activation by TPX2 / Factors involved in megakaryocyte development and platelet production / RET signaling / Interleukin-3, Interleukin-5 and GM-CSF signaling / Recruitment of NuMA to mitotic centrosomes / VEGFA-VEGFR2 Pathway / PKA activation / MAPK6/MAPK4 signaling / GLI3 is processed to GLI3R by the proteasome / Regulation of PLK1 Activity at G2/M Transition / Hedgehog 'off' state / cAMP-dependent protein kinase inhibitor activity / cAMP-dependent protein kinase / regulation of protein processing / cAMP-dependent protein kinase activity / protein localization to lipid droplet / cAMP-dependent protein kinase complex / regulation of bicellular tight junction assembly / cellular response to parathyroid hormone stimulus / cellular response to cold / Glucagon-like Peptide-1 (GLP1) regulates insulin secretion / regulation of osteoblast differentiation / sperm capacitation / Mitochondrial protein degradation / High laminar flow shear stress activates signaling by PIEZO1 and PECAM1:CDH5:KDR in endothelial cells / Vasopressin regulates renal water homeostasis via Aquaporins / ciliary base / negative regulation of glycolytic process through fructose-6-phosphate / protein kinase A regulatory subunit binding / mesoderm formation / sperm flagellum / plasma membrane raft / axoneme / postsynaptic modulation of chemical synaptic transmission / negative regulation of TORC1 signaling / regulation of proteasomal protein catabolic process / positive regulation of gluconeogenesis / protein serine/threonine/tyrosine kinase activity / cellular response to glucagon stimulus / protein export from nucleus / acrosomal vesicle / positive regulation of protein export from nucleus / negative regulation of smoothened signaling pathway / neural tube closure / positive regulation of cholesterol biosynthetic process / cellular response to glucose stimulus / adenylate cyclase-inhibiting G protein-coupled receptor signaling pathway / neuromuscular junction / positive regulation of insulin secretion / adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway / mRNA processing / peptidyl-serine phosphorylation / manganese ion binding / cellular response to heat / postsynapse / protein kinase activity / regulation of cell cycle / nuclear speck / protein phosphorylation / protein domain specific binding / protein serine kinase activity / protein serine/threonine kinase activity / centrosome / ubiquitin protein ligase binding / protein kinase binding / perinuclear region of cytoplasm / glutamatergic synapse / magnesium ion binding / signal transduction / mitochondrion / ATP binding / nucleus / cytosol / cytoplasm
類似検索 - 分子機能

生物種

BOS TAURUS (ウシ)

手法

X線回折 /

シンクロトロン /

分子置換 / 解像度: 1.58 Å

データ登録者

Couty, S. / Westwood, I.M. / Kalusa, A. / Cano, C. / Travers, J. / Boxall, K. / Chow, C.L. / Burns, S. / Schmitt, J. / Pickard, L. ...

引用

ジャーナル: Oncotarget / 年: 2013
タイトル: The discovery of potent ribosomal S6 kinase inhibitors by high-throughput screening and structure-guided drug design.
著者: Couty, S. / Westwood, I.M. / Kalusa, A. / Cano, C. / Travers, J. / Boxall, K. / Chow, C.L. / Burns, S. / Schmitt, J. / Pickard, L. / Barillari, C. / McAndrew, P.C. / Clarke, P.A. / ...

履歴

登録	2013年8月21日	登録サイト: PDBE / 処理サイト: PDBE
改定 1.0	2013年10月9日	Provider: repository / タイプ: Initial release
改定 1.1	2013年11月20日	Group: Database references
改定 1.2	2019年10月9日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Other カテゴリ: citation / citation_author ...citation / citation_author / pdbx_database_status / struct_conn Item: _citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI ..._citation.page_last / _citation.pdbx_database_id_DOI / _citation.title / _citation_author.name / _pdbx_database_status.status_code_sf / _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag
改定 1.3	2023年12月20日	Group: Data collection / Database references ...Data collection / Database references / Derived calculations / Refinement description カテゴリ: chem_comp_atom / chem_comp_bond ...chem_comp_atom / chem_comp_bond / database_2 / pdbx_initial_refinement_model / struct_site Item: _database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession ..._database_2.pdbx_DOI / _database_2.pdbx_database_accession / _struct_site.pdbx_auth_asym_id / _struct_site.pdbx_auth_comp_id / _struct_site.pdbx_auth_seq_id
改定 1.4	2024年10月23日	Group: Structure summary カテゴリ: pdbx_entry_details / pdbx_modification_feature Item: _pdbx_entry_details.has_protein_modification

構造ビューア	分子: MolmilJmol/JSmol

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ダウンロード

PDBx/mmCIF形式	4c38.cif.gz	177.8 KB	表示	PDBx/mmCIF形式
PDB形式	pdb4c38.ent.gz	141 KB	表示	PDB形式
PDBx/mmJSON形式	4c38.json.gz		ツリー表示	PDBx/mmJSON形式
その他	その他のダウンロード

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検証レポート

アーカイブディレクトリ	https://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c3/4c38 ftp://data.pdbj.org/pub/pdb/validation_reports/c3/4c38	HTTPS FTP

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関連構造データ

関連構造データ	4c33SC 4c34C 4c35C 4c36C 4c37C S: 精密化の開始モデル C: 同じ文献を引用 (文献)
類似構造データ	4c36-d 2c1a-d 3zo4-d 1svh-d 3zo3-d 2erz-d 4dh3-d 2gu8-d 4iac-d 2vo7-d 5n1o-d 1xh6-d 2jds-d 4wb8-d 4z84-d 2c1b-d 4yxs-d 3l9m-2 3p0m-d 2uw5-d Omokage検索で類似形状データを探す (詳細) 類似検索 - 機能・相同性F&H 検索類似検索 - 機能F&H 検索類似検索 - 相同性F&H 検索

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リンク

PDBのページ	PDBj / wwPDB / NCBI
「今月の分子」の関連する項目	#152 - 2012年8月環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase) 類似性 (7) #251 - 2020年11月アデニリルシクラーゼ (Adenylyl Cyclase) 類似性 (1) #183 - 2015年3月フォトトロピン (Phototropin) 類似性 (7) #196 - 2016年4月鉛の毒 (Lead Poisoning) 類似性 (3) #142 - 2011年10月 PDBの先駆者たち (PDB Pioneers) 類似性 (1)

PDBのページ

PDBj /

wwPDB /

NCBI

「今月の分子」の関連する項目

#152 - 2012年8月
環状AMP依存性タンパク質リン酸化酵素 (cAMP-dependent Protein Kinase)
類似性 (7)
#251 - 2020年11月
アデニリルシクラーゼ (Adenylyl Cyclase)
類似性 (1)
#183 - 2015年3月
フォトトロピン (Phototropin)
類似性 (7)
#196 - 2016年4月
鉛の毒 (Lead Poisoning)
類似性 (3)
#142 - 2011年10月
PDBの先駆者たち (PDB Pioneers)
類似性 (1)

登録構造単位

A: CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA

I: CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE INHIBITOR PEPTIDE

ヘテロ分子

43.5 kDa, 2 ポリマー
Omokage検索でこの集合体の類似形状データを探す (詳細)

1

登録構造と同一
登録者・ソフトウェアが定義した集合体

単位格子

Length a, b, c (Å)	72.140, 75.090, 80.190
Angle α, β, γ (deg.)	90.00, 90.00, 90.00
Int Tables number	19
Space group name H-M	P2₁2₁2₁

#1: タンパク質	CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE CATALYTIC SUBUNIT ALPHA / PKA C-ALPHA 分子量: 40948.664 Da / 分子数: 1 / 変異: YES / 由来タイプ: 組換発現 / 詳細: PKA-S6K1 CHIMERA / 由来: (組換発現) BOS TAURUS (ウシ) / 発現宿主: ESCHERICHIA COLI (大腸菌) / 株 (発現宿主): BL21(DE3) / 参照: UniProt: P00517, cAMP-dependent protein kinase
#2: タンパク質・ペプチド	CAMP-DEPENDENT PROTEIN KINASE INHIBITOR PEPTIDE 分子量: 2226.411 Da / 分子数: 1 / Fragment: RESIDUES 5-24 / 由来タイプ: 合成 / 由来: (合成) BOS TAURUS (ウシ) / 参照: UniProt: Q3SX13*PLUS
#3: 化合物	ChemComp-VUP / 4-(1-ethyl-6-methyl-imidazo[4,5-c]pyridin-2-yl)-1,2,5-oxadiazol-3-amine 分子量: 244.253 Da / 分子数: 1 / 由来タイプ: 合成 / 式: C₁₁H₁₂N₆O
#4: 化合物	ChemComp-MOH / METHANOL / メタノ-ル分子量: 32.042 Da / 分子数: 3 / 由来タイプ: 合成 / 式: CH₄O
#5: 水	ChemComp-HOH / water 分子量: 18.015 Da / 分子数: 633 / 由来タイプ: 天然 / 式: H₂O
Has protein modification	Y
配列の詳細	PKA-S6K1 CHIMERA MUTATIONS ARE F54Y, M120L, V123L, L173M AND Q181K

-
実験

実験	手法: X線回折 / 使用した結晶の数: 1

-
試料調製

結晶	マシュー密度: 2.7 Å³/Da / 溶媒含有率: 55.1 % / 解説: NONE
結晶化	pH: 6.4 詳細: 18 MG/ML PROTEIN IN 25MM MES-BIS-TRIS PH 6.5, 75MM LICL, 0.1MM EDTA, 1MM MEGA-8, 1MM DTT AND 1MM PKI PEPTIDE MIXED 1:1 WITH 8-16% AQUEOUS METHANOL

-
データ収集

回折	平均測定温度: 100 K
放射光源	由来: シンクロトロン / サイト: ESRF / ビームライン: ID14-4 / 波長: 0.9795
検出器	タイプ: ADSC CCD / 検出器: CCD
放射	プロトコル: SINGLE WAVELENGTH / 単色(M)・ラウエ(L): M / 散乱光タイプ: x-ray
放射波長	波長: 0.9795 Å / 相対比: 1
反射	解像度: 1.58→40.1 Å / Num. obs: 59724 / % possible obs: 99.7 % / Observed criterion σ(I): 1.5 / 冗長度: 4 % / B_iso Wilson estimate: 19.31 Å² / R_merge(I) obs: 0.06 / Net I/σ(I): 49.1
反射シェル	解像度: 1.58→1.61 Å / 冗長度: 3.8 % / R_merge(I) obs: 0.48 / Mean I/σ(I) obs: 1.4 / % possible all: 99.7

-
解析

ソフトウェア

名称	バージョン	分類
BUSTER	2.11.2	精密化
MOSFLM		データ削減
Aimless		データスケーリング
PHASER		位相決定

精密化

構造決定の手法:

分子置換
開始モデル: PDB ENTRY 4C33

4c33

解像度: 1.58→36.07 Å / Cor.coef. F_o:F_c: 0.9689 / Cor.coef. F_o:F_c free: 0.9619 / SU R Cruickshank DPI: 0.07 / 交差検証法: THROUGHOUT / σ(F): 0 / SU R Blow DPI: 0.078 / SU R_free Blow DPI: 0.076 / SU R_free Cruickshank DPI: 0.071

	R_factor	反射数	%反射	Selection details
R_free	0.1778	2969	5.07 %	RANDOM
R_work	0.1532	-	-	-
obs	0.1545	58599	97.12 %	-

原子変位パラメータ

B_iso mean: 24.15 Å²

	B_aniso -1	B_aniso -2	B_aniso -3
1-	-1.5499 Å²	0 Å²	0 Å²
2-	-	-0.0799 Å²	0 Å²
3-	-	-	1.6298 Å²

Refine analyze

Luzzati coordinate error obs: 0.184 Å

精密化ステップ

サイクル: LAST / 解像度: 1.58→36.07 Å

	タンパク質	核酸	リガンド	溶媒	全体
原子数	2896	0	24	633	3553

拘束条件

Refine-ID	タイプ	Dev ideal	数	Restraint function	Weight
X-RAY DIFFRACTION	t_bond_d	0.01	3101	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_angle_deg	0.92	4217	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_dihedral_angle_d		1066	SINUSOIDAL	2
X-RAY DIFFRACTION	t_incorr_chiral_ct
X-RAY DIFFRACTION	t_pseud_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_trig_c_planes		73	HARMONIC	2
X-RAY DIFFRACTION	t_gen_planes		478	HARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_it		3101	HARMONIC	20
X-RAY DIFFRACTION	t_nbd
X-RAY DIFFRACTION	t_omega_torsion	3.26
X-RAY DIFFRACTION	t_other_torsion	15.28
X-RAY DIFFRACTION	t_improper_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_chiral_improper_torsion		390	SEMIHARMONIC	5
X-RAY DIFFRACTION	t_sum_occupancies
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_distance
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_angle
X-RAY DIFFRACTION	t_utility_torsion
X-RAY DIFFRACTION	t_ideal_dist_contact		4309	SEMIHARMONIC	4

LS精密化シェル

解像度: 1.58→1.62 Å / Total num. of bins used: 20

	R_factor	反射数	%反射
R_free	0.2632	182	4.87 %
R_work	0.2178	3554	-
all	0.22	3736	-
obs	-	-	97.12 %

精密化 TLS

手法: refined / Refine-ID: X-RAY DIFFRACTION

ID	L11 (°²)	L12 (°²)	L13 (°²)	L22 (°²)	L23 (°²)	L33 (°²)	S11 (Å °)	S12 (Å °)	S13 (Å °)	S21 (Å °)	S22 (Å °)	S23 (Å °)	S31 (Å °)	S32 (Å °)	S33 (Å °)	T11 (Å²)	T12 (Å²)	T13 (Å²)	T22 (Å²)	T23 (Å²)	T33 (Å²)	Origin x (Å)	Origin y (Å)	Origin z (Å)
1	3.2112	0.7207	-1.4181	6.6644	2.2455	3.5295	0.148	-0.1252	0.2309	-0.5819	0.2353	-0.5177	-0.554	0.7105	-0.3833	0.0822	-0.1017	0.108	0.1385	-0.0224	0.054	39.039	-2.7207	-18.7342
2	1.1717	-1.0404	0.7207	2.1985	0.5885	1.6285	-0.0611	-0.1165	-0.1845	0.1492	0.1042	0.0244	0.3902	0.0291	-0.0431	0.0583	0.0423	-0.0078	0.0528	0.0219	0.0744	32.6523	-23.0752	0.517
3	3.6548	-0.7176	1.4784	0.5455	-0.067	1.2082	-0.0789	-0.1248	-0.1784	0.0874	0.1393	-0.0666	0.2083	0.0513	-0.0605	0.068	0.0346	-0.0036	0.0922	0.0135	0.1003	30.1687	-19.4243	0.8499
4	0.602	-0.2857	-0.1714	1.0948	0.2403	1.7885	-0.0227	0.036	0.0047	-0.0796	0.0439	-0.0188	-0.0464	0.0978	-0.0212	0.017	0.0023	0.0149	0.0417	0.0058	0.0358	27.4064	-9.7903	-9.7155
5	0.1651	-0.2346	-0.044	1.8872	1.4666	2.1362	-0.0176	-0.0695	-0.0268	0.1412	0.0622	-0.0393	0.1056	0.1821	-0.0446	0.0337	0.0158	-0.0031	0.055	0.0054	0.0645	30.388	-13.3608	0.5166
6	0.0333	-0.7239	0.1036	0.1699	-1.8884	5.2488	0.0696	-0.2962	0.1253	0.2147	-0.039	-0.0843	-0.3001	0.3039	-0.0306	0.1206	-0.0151	-0.0169	0.1162	-0.0326	0.0583	26.881	5.8832	15.1116
7	0.4455	-0.2989	-0.4155	0.851	0.6797	1.39	-0.0097	0.0122	0.0882	-0.1202	0.0579	-0.1579	-0.3565	0.1899	-0.0483	0.119	-0.0463	0.0174	0.0599	0.0017	0.0605	29.665	4.246	-3.5959
8	1.4307	0.6833	2.082	1.2068	1.9714	3.1109	-0.1337	0.0197	0.0645	-0.0714	0.1843	-0.1255	-0.2486	0.2089	-0.0506	0.0414	-0.0333	-0.0025	0.0937	-0.007	0.0668	33.7849	-2.5967	1.884
9	0.4773	0.0191	-0.1757	0.6786	0.7758	1.4304	0.0126	0.0358	0.0814	-0.1112	-0.0716	0.0424	-0.298	-0.1236	0.059	0.1433	0.0341	-0.0102	0.0601	0.0077	0.0575	17.6629	4.6091	-6.6064
10	5.57	-2.501	0.7157	6.0347	2.6897	5.9625	-0.083	-0.0903	-0.0619	-0.1327	-0.1643	0.5197	-0.3739	-0.467	0.2473	0.1177	0.0893	-0.0442	0.098	-0.0374	0.1012	6.5476	7.2792	0.2559
11	0.9831	-0.8759	-1.4221	1.5604	0.1113	0	0.0101	-0.2006	0.1443	-0.4145	-0.1879	0.3247	-0.4368	-0.3726	0.1778	0.3544	0.0842	-0.0109	0.0946	-0.0625	0.1875	14.0667	18.1066	5.5158
12	1.8199	0.6188	0.2508	3.6353	2.0644	5.8557	0.0379	0.0182	0.4215	-0.5209	-0.043	0.1136	-1.1598	-0.1644	0.0051	0.4084	0.0518	0.0206	0.0479	0.0119	0.1559	21.4393	18.3214	-2.7106
13	3.123	-1.0489	0.6646	3.644	-0.1514	1.1519	0.0563	0.1862	0.3884	-0.3176	0.1212	-0.4238	-0.7573	0.5087	-0.1775	0.3211	-0.1608	0.072	0.1665	-0.0187	0.1776	36.9009	13.8899	-3.9911
14	1.9563	2.3319	0.69	3.5169	0.8786	1.5655	0.0009	-0.0887	0.1322	0.4228	0.0855	-0.1873	-0.1546	0.2105	-0.0864	0.2007	0.0743	-0.0002	0.1736	-0.0226	0.0849	34.3802	-6.7096	13.7128
15	0	1.5346	1.4008	0	0.9426	1.9083	0.1971	-0.1479	-0.1051	0.2374	-0.3674	0.5478	0.751	-0.8969	0.1703	0.2891	-0.0498	0.0506	0.1971	0.0208	0.1988	21.5637	-26.2639	5.0235
16	2.5873	1.02	0.6491	4.362	-0.4448	2.3889	0.1363	0.1048	-0.4035	-0.0935	-0.1277	0.2322	0.5543	-0.0543	-0.0086	0.1654	0.0119	0.0042	0.0556	-0.0287	0.1474	21.8981	-26.1704	-13.088
17	0.2824	0.0171	-2.1407	2.6212	1.4837	5.8776	0.0262	-0.0731	-0.0096	-0.2283	-0.0622	-0.0411	-0.1429	-0.1064	0.0361	0.0909	0.0319	-0.0023	0.0803	-0.0047	0.0354	13.1305	8.1424	16.1596
18	0.2176	0.7394	-1.3517	3.2828	2.2206	0.8064	-0.0715	-0.1395	-0.0116	0.2854	0.0071	-0.197	0.1579	-0.0527	0.0643	0.1237	0.0422	-0.0008	0.0944	-0.0024	0.0758	15.7772	-2.5135	9.6782
19	1.9304	-2.0252	1.9781	2.7659	2.4219	5.3834	0.3514	0.3562	-0.2666	0.2059	-0.2747	0.4029	0.6111	-0.0604	-0.0767	0.121	0.0061	-0.0128	0.1008	-0.0313	0.1179	13.2815	-5.7862	-1.3344

精密化 TLSグループ

ID	Refine-ID	Refine TLS-ID	Selection details
1	X-RAY DIFFRACTION	1	{ A\|15 - A\|35 }
2	X-RAY DIFFRACTION	2	{ A\|36 - A\|52 }
3	X-RAY DIFFRACTION	3	{ A\|53 - A\|79 }
4	X-RAY DIFFRACTION	4	{ A\|80 - A\|106 }
5	X-RAY DIFFRACTION	5	{ A\|107 - A\|133 }
6	X-RAY DIFFRACTION	6	{ A\|134 - A\|140 }
7	X-RAY DIFFRACTION	7	{ A\|141 - A\|173 }
8	X-RAY DIFFRACTION	8	{ A\|174 - A\|187 }
9	X-RAY DIFFRACTION	9	{ A\|188 - A\|243 }
10	X-RAY DIFFRACTION	10	{ A\|244 - A\|254 }
11	X-RAY DIFFRACTION	11	{ A\|255 - A\|259 }
12	X-RAY DIFFRACTION	12	{ A\|260 - A\|284 }
13	X-RAY DIFFRACTION	13	{ A\|285 - A\|311 }
14	X-RAY DIFFRACTION	14	{ A\|312 - A\|331 }
15	X-RAY DIFFRACTION	15	{ A\|332 - A\|338 }
16	X-RAY DIFFRACTION	16	{ A\|339 - A\|351 }
17	X-RAY DIFFRACTION	17	{ I\|5 - I\|12 }
18	X-RAY DIFFRACTION	18	{ I\|13 - I\|18 }
19	X-RAY DIFFRACTION	19	{ I\|19 - I\|24 }

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お知らせ

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2022年2月9日: EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBエントリの付随情報ファイルのフォーマットが新しくなりました

EMDBのヘッダファイルのバージョン3が、公式のフォーマットとなりました。
これまでは公式だったバージョン1.9は、アーカイブから削除されます。

関連情報:EMDBヘッダ

外部リンク:wwPDBはEMDBデータモデルのバージョン3へ移行します

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2020年8月12日: 新型コロナ情報

新型コロナ情報

URL: https://pdbj.org/emnavi/covid19.php

新ページ: EM Navigatorに新型コロナウイルスの特設ページを開設しました。

関連情報:Covid-19情報 / 2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2020年3月5日: 新型コロナウイルスの構造データ

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2019年1月31日: EMDBのIDの桁数の変更

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2017年7月12日: PDB大規模アップデート

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万見 (Yorodumi)

幾万の構造データを、幾万の視点から

万見(Yorodumi)は、EMDB/PDB/SASBDBなどの構造データを閲覧するためのページです。
EM Navigatorの詳細ページの後継、Omokage検索のフロントエンドも兼ねています。

関連情報:EMDB / PDB / SASBDB / 3つのデータバンクの比較 / 万見検索 / 2016年8月31日: 新しいEM Navigatorと万見 / 万見文献 / Jmol/JSmol / 機能・相同性情報 / 新しいEM Navigatorと万見の変更点

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